面对危机四伏的政局，明思宗朱由检殷殷求治。每逢经筵，明思宗朱由检总是悉心恭听阐释经典，毫无倦意，而且经常召对大臣，探求治国方策。尤其是勤于政务，事必躬亲。曾有人把明思宗朱由检称为中国历史上最勤政的帝王，并作了一个统计，称明思宗朱由检平均每天只睡两个时辰。由此可以看出：当时的明思宗朱由检求治心切，急于求成，很想有所作为。
在努力勤政的同时，明思宗朱由检也曾采取一系列措施竭力改变明神宗怠政、明熹宗昏聩的状况，如平反冤狱，给杨涟、左光斗等大批遭受阉党迫害的人平反昭雪，起用天启年间许多被罢黜的官员；全面考核官员，禁止朋党，力戒廷臣结交宦官；整饬边政，任用被百姓称为“袁长城”的袁崇焕为兵部尚书，赐尚方宝剑，托付其收复全辽的重任。这些做法，使崇祯朝朝政与前两朝相比有了明显改观，令朝野士民刮目相看，明思宗朱由检也被人视为“明主”。
刚愎自用，滥杀大臣明思宗朱由检的勤政取得了一定的实效，但当时的大明帝国还是矛盾丛集、积弊深重，政局无法在短期内根本好转。再加上明思宗朱由检的童年和少年时代，完全没有享受到常人能有的父母之爱、兄弟之情，反倒是目睹和亲历了“红丸案”和“移宫案”等骇人听闻的政治阴谋，使他养成了急躁褊狭、敏感多疑、刚愎自用的性格，这些在他性格缺点施政过程中产生了严重的消极作用，使他在朝政中屡铸大错。
当时明朝最大的敌人还是东北的后金，即后来的满清政权。但在与后金战争的紧要关头，明思宗朱由检心急、多疑的致命弱点，使他中了多谋善断的爱新觉罗·皇太极的反间计，冤杀了一代名将袁崇焕，使辽东防卫几近崩溃。后来虽又增加赋税，增调重兵，全力防范，但已经无济于事。明朝失去了唯一的东北屏障，八旗军队得以驰骋东北大地，如人无人之境。在此之后，明思宗朱由检还曾密令孙传庭在明思宗崇祯十五年（公元1642年）杀了李自成的同乡贺人龙，等于杀了一名在镇压农民起义中颇为悍勇的将领。贺人龙被杀后，农民起义军酌酒相庆：“贺疯子死，取关中如拾芥矣！”因此，明思宗朱由检的多疑、擅杀，无异于自毁长城。
同时，由于对朝中大臣的不信任、不满意，敏感多疑的明思宗朱由检更是频繁地更换官员，其更换官员之繁也是前所未有的。据后人统计，明思宗朱由检当了17年皇帝，先后任用了50位宰相，17位刑部尚书。崇祯一朝17年，设内阁大学士如弈棋一般，轮换了50人，变换之快，真是让人啧舌。其中任期较长的两人，分别是温体仁和周延儒。两人在《明史》中都列名于奸臣传中。
温体仁，字长卿，祖籍乌程，后落籍归安，为人“外曲谨而中猛鸷，机深刺骨”，是一个城府极深之人。明思宗崇祯元年（公元1628年），温体仁通过攻击钱谦益在主持会试中有舞弊嫌疑而得到思宗的赏识。次年，有御史任赞化攻击温体仁娶娼受贿，反而被明思宗朱由检以为党羽钱谦益而罢免。明思宗朱由检有鉴于万历、天启朝的党争，对于大臣结党最为反感。明思宗朱由检对于温体仁的欣赏，是因为温体仁“孤立”、“无党”。明思宗崇祯三年（公元1630年）六月，温体仁入阁为大学士。此后，温体仁为大学士8年。
周延儒，字玉绳，宜兴人，早温体仁一年入阁。但是，温体仁与周延儒在内阁中并不相让，相互倾轧。明思宗崇祯六年（公元1633年）六月，周延儒被温体仁逐出京城，温体仁把持了内阁，于是民间遂有民谣说“内阁翻成妓馆，乌归王巴篾片，总是遭瘟”。这是指当时内阁中的三位大臣：温体仁、王应熊和吴宗达。温体仁，乌程籍，归安人；王应熊，巴县人；吴宗达，因无所作为，人称“篾片”。一时间，这首民谣在京城街头成为笑谈。堂堂内阁大学士被人如此讥笑，可见其人品之劣。然而，就是这样的温体仁，却一直执政了8年，直到明思宗崇祯十年（公元1637年）才被罢免。之后，周延儒复入阁。但是，明思宗崇祯十六年（公元1643年），周延儒被勒令自尽。在周延儒之前，内阁大学士薛国观也被明思宗朱由检处死。
总共17年间，被杀的大学士有两人，被谴戍的大学士也有两人，即钱龙锡、刘鸿训。作为皇帝最亲信的大臣，内阁大学士轻易落到这样的下场，实在令大臣们寒心。在六部尚书中，刑部尚书换了17人。然而，17人中，薛贞被处死，韩继思、郑三俊、刘之凤、李觉斯、徐石麒等先后下狱，狱中瘐死2人，大部分人都不得善终。兵部尚书中，王洽因明思宗崇祯二年（公元1629年）清兵入关而下狱瘐死，陈新甲因泄漏议和之事而被处死。在地方督抚中，总督中被诛者7人：郑崇俭、袁崇焕、刘策、杨一鹏、熊文灿、范志完、赵光忭；巡抚被戮者11人：蓟镇王应豸、山西耿如杞、宣府李养冲、登莱孙元化、大同张翼明、顺天陈祖苞、保定张其平、山东颜继祖、四川邵捷春、永平马成名、顺天潘永图，另外还有河南巡抚李仙凤被逮自杀。这些大臣，都是应对辽东战事和平息农民起义的将领，他们动辄遭罪被杀，也就很容易说明崇祯朝军事上的大溃败了。
对于一般的言官，明思宗朱由检也总是非常严峻。明思宗崇祯元年（公元1628年）十一月，户科给事中韩一良上疏言官场贪污之风甚盛。当然，这样的奏疏只是就事论事，并不明指谁人贪污，谁人受贿。但是，明思宗朱由检一面表彰韩一良的忠心和敢言，一方面却非要韩一良指名道姓以回奏。韩一良知道一旦指名道姓，就是得罪人的事情，所以只说是“风闻”。明思宗朱由检大怒：“难道一人不知，遽有此疏？限五日内指名来。”按明思宗朱由检的意思，既然言官忠心为国，就要敢于破除情面。韩一良只好找一些已经有议论的官员来搪塞。但是，明思宗朱由检再对韩一良疏中“臣两月内辞却书帕已五百金”纠缠不休，要韩一良说出500两银子是哪些人送的。这时，韩一良再不肯说。于是，韩一良被革职为民。仅仅数月之间，从表彰到革职，还算敢言的韩一良却得到这样的对待。在晚明社会中，官场中的弊端自然不少。相互间送书帕（书仪）是极正常的事。明思宗朱由检希望一举之间将这种风气杜绝，却又着意在惩罚官员，这样官员们最终只是互相袒护，不敢再说真话了。
明思宗崇祯二年（公元1629年），关于工部招商中收取回扣一事的处理，也充分体现了明思宗朱由检急于求治的急躁心理。这一年的闰四月，工部尚书张凤翔上疏指出工部招商收取回扣之弊政。内阁大学士韩爌、李标、钱龙锡都说：“此从来陋规，望皇上宽处，后边人敢说。”但是，最终思宗将巡视工部库房的工科给事中王都、陕西道御史高赉明革职严办，等于是让一两个臣工为多年来的积弊承担责任。这也反映明思宗朱由检随意处理臣工的做事风格，而这样的行为，最终导致了大小臣工们对于朝政中的一切事情，最好是噤口不言。皇帝督责越严，臣下越不敢担当；皇帝焦劳越勤，臣下就越偷安怠慢。晚明著名的学者刘宗周就在批评明思宗朱由检的奏疏中这样说：“求治之心操之过急，不免酿为功利；功利之不已，转为刑名；刑名之不已，流为猜忌；猜忌之不已，积为壅蔽。”
除此之外，在清除以魏忠贤为首的阉党后，刚愎自用的明思宗朱由检也走上了明代皇帝宠信宦官的老路，又重用另一批宦官，并给予宦官行使监军和提督京营大权。于是，大批宦官被派往地方重镇，凌驾于地方督抚之上。后来甚至让宦官总理户、工二部，将户、工二部尚书搁置一旁，致使宦官权力日益膨胀，统治集团矛盾日益加剧。无奈之中，明思宗朱由检不断反省，四下罪己诏，减膳撤乐，又在宫中设坛，祈求上天降福消灾。在对天帝及各类神仙失望之余，明思宗朱由检也曾一度对天主教产生兴趣，召外国传教士入宫讲解教义。但这一切已经无法挽救大明王朝的危亡。
个人的悲剧，常是他的性格的悲剧。孟子说过，帝者与师处，王者与友处，亡国与役处。就是说，一个亡国的君主总是将他的臣民视为奴役。明思宗朱由检恰恰正是这么一个人。虽说在明代君主高度专权的政治环境中，皇帝是不可能以“师、友”的态度来对待臣民的。但是，明思宗朱由检对于大臣的态度，其严峻和刻薄已经超出想像。作为一个自律甚严、急于求成的皇帝，明思宗朱由检总是希望在最短的时间内改变长期以来政府的陋习。陕嗣宗批评明思宗朱由检的“五不自知”的奏疏中说：“今皇上于二三大臣间，呼之而前，唯恐不速，长跪逾时，备加谴诃，甚者刚遭指摘，便责以受贿。敬大臣之心何在？臣恐日习于尊倨而不自知！”又说明思宗朱由检“日趋于纷苛而不自知”。应当说，陕嗣宗的批评是非常深刻的。一个过分苛求的皇帝之下，是很难出现敢于担当的大臣的。所以，无为而治的明代皇帝如明孝宗、明穆宗统治的时代，倒是名臣辈出。后代历史学家常感叹崇祯朝“有君而无臣”，其实，因为明思宗朱由检过分地苛责大臣，大臣们动则得咎，哪里敢有什么动作呢？
身后谜团
朱由检子女流散之迷
明思宗朱由检的子女不幸生在了末代帝王之家，这就注定了他们悲剧的命运。
相比较而言，明思宗朱由检的女儿后来的下落倒还比较清楚。这是因为，明思宗朱由检在决意自缢之前，为了不让自己的女儿受辱，曾先后对自己的两个女儿下毒手。即使侥幸生还，也决无法遁逸。