司马睿之所以能在江南建立起东晋政权,主要依靠琅琊王氏家族的支持。建兴三年(315年),司马睿任命王敦为元帅,率兵讨伐叛乱的杜。王敦坐镇武昌,自行选派官吏,专权之心日渐暴露。永昌元年(322年)正月十四日,王敦借口清君侧,在武昌(今湖北鄂城)起兵反晋。三月,王敦率军攻入建康。晋元帝只得任命王敦为丞相,都督中外诸军、录尚书事、江州牧。四月,王敦退兵回武昌。永昌二年(323年)四月,王敦移师姑熟(今安徽当涂),自己担任扬州牧,图谋篡位。太宁二年(324年)五月,王敦病重。晋明帝司马绍下诏任命王导为大都督,讨伐王敦,又诏征苏峻、祖约等保卫京城。王敦以兄王含为元帅,率众五万进攻建康,再反朝廷。不久,王敦病死,王含军被击溃,王敦之乱平息。王敦之乱,揭示了东晋政权内部中央与地方权力之争的序幕。