1905年七月,孙中山自欧洲经南洋抵达日本,会见了黄兴等人,并商议组建新的革命组织。经过一系列紧张的筹备,同年八月,同盟会在日本东京正式成立。同盟会设立总理(始终由孙中山担任),总理之下仿照西方三权分立原则设立执行、评议、司法三部;执行部下设庶务、内务、外务、书记、会计、调查六科,由总理直辖;同时任命了汪精卫为评议部长,邓家彦为司法部判事长。成立大会通过了《中国同盟会总章》,确定以孙提出的“驱除鞑虏,恢复中华,创立民国,平均地权”十六字为同盟会政纲,后来孙中山又将其概括为三民主义。从此同盟会在孙中山的领导之下,努力开展各项活动和斗争,担负起领导中国民主革命的重任。1912年,经宋教仁等积极筹划并经孙中山同意,同盟会联合其他几个政治组织,改组为中国国民党。