1904年1月4日,在递交给国会的关于巴拿马运河条约的咨文中,罗斯福总统想在国会考虑这一条约之前澄清自己的立场。总统否认了他同情政变后上台的、控制巴拿马革命政府的军人集团的说法,使运河问题由政治问题变成了一个具体实际的问题。总统在咨文中很明了地说,他的政府已经承认了巴拿马政府,国会即使不通过这项条约,巴拿马也不会因此而重新归于哥伦比亚。他强调说,现在惟一的问题就是“我们是否要开凿巴拿马运河”。总统明确这个问题,为的是减轻南方参议员的忧虑。南方议员们普遍反对这项条约,尽管他们的许多选民赞成签订这项条约。主要反对者是亚拉巴马州的议员摩根。他谴责总统支持巴拿马革命和政变后上台的军政府。然而内华达州和马里兰州的议员们却表示支持当局的行动方针。