为确保我国航天食品的绝对安全，从原材料的选购、食品生产车间与设施的卫生、工作人员的管理到食品检验检测等所有环节都要进行严格把关。
首先是把好原料采购关
航天食品的原料全部是取得“绿色食品”资质的产品。“绿色食品”是指安全、营养、无公害食品，这类食品对工业“三废”和农药污染进行了严格的控制。我国航天食品的生产部门在全国选取了若干实力雄厚、声誉良好的原料供应商，并定期对供应商的质量体系进行考核。
其次是把好生产工艺关
由于航天食品绝不含防腐剂，而保质期一般要求在６个月以上，保藏时一般不考虑进行冷藏，宇航员在食用前又不能进行杀菌消毒处理，所以对于食品生产流程和生产工艺提出了很高要求。航天食品专家经过长期研究和实践，形成了一整套严格的生产过程的工艺文件和工艺参数。这些文件和参数一经确定，经过权威专家评审通过后，生产过程就严格按照这一要求进行。
三是把好人员管理关
我国航天食品是由中国某研究中心研制生产的。而该生产车间的几名工人，都经过了严格的政治审查和每年两次的身体检查，确保政治可靠、身体健康。平时，这些人员不得随意外出，不得与不明身份的人交往，也不能像一般人一样到外面餐馆吃饭。在进入生产车间前，每人都要淋浴、消毒，并换上特制的工作服。
四是把好检测关
为了保证航天食品的卫生质量，在食品的设计、研制和生产中，都必须严格遵守《中华人民共和国食品卫生法》，执行国家卫生行政部门批准颁发的《航天食品卫生标准》，对原材料的选购、运输与储存的卫生，车间环境与设施的卫生，生产人员的个人卫生，食品加工过程中的卫生，成品运输储存与交付的卫生等进行严格的管理与监督。所有航天产品必须经国家卫生行政部门检验并确定合格后，才能交付使用。