飞船发射季节的选择，要考虑到各种可能影响到发射的因素，其中气象条件是最直接、最关键的决定因素。飞船上天后，要由航天测控网对飞船实施测控管理。如果把神舟飞船比做放飞太空的“风筝”，那么，航天测控网就是那根重要的“风筝线”。我国的航天测控网由多个地面测控站和4艘远望号航天测量船组成。这4艘测量船分别是太平洋上的“远望”一号和“远望”二号测量船，印度洋上的“远望”四号测量船，大西洋上的“远望”三号测量船。其中，3艘测量船都在纬度相对较高的南半球。南半球的季节正好与我国相反。我国的春夏季节在南半球是秋冬季节，海况很恶劣，即使正常航行都难保安全，更不用说在海上执行测控任务了，因此不宜发射飞船。我国的秋冬季节在南半球是春夏季节，海况较好，便于航行和执行测量任务。因此，我国神舟一号至五号飞船的发射时机都选在与南半球相反的秋冬季节。另外，秋季和冬季相比，尽管2002年12月30日发射的神舟四号曾突破我国低温发射的历史记录，但在载人航天飞行中，以人为本、充分保障航天员的安全，成为发射的最大特点，因而发射段的气象条件也是非常重要的。显然，秋季比冬季更适宜。因此，神舟五号和神舟六号载人飞船都选择了在秋季发射。
