嘉靖三十二年（1553年），兵部员外郎杨继盛再也忍受不了严嵩的误国行为，他把严嵩的罪行归纳为“十大罪”、“五奸”。十大罪主要是：大权独揽，坏祖宗法；假传圣旨，为己谋利；结党营私，打击忠良；收受贿赂，引用奸邪；废弛战备，贻误军机等。五奸是：贿赂皇上身边的太监，成为自己的间谍；控制通政司，使它成为自己左右朝政的工具；勾结东厂、西厂等特务组织，使之为自己的耳目；或笼络或打击谏官，使之顺从自己的意志；收买网罗各部大臣，使之成为自己的党羽。这道奏章可谓是对严嵩的全面深刻的揭露，处处击中严嵩的要害。然而，有昏君才有奸臣，杨继盛的痛切陈述并没有打动世宗，在世宗看来，严嵩是最大的忠臣，杨继盛是对严嵩打击报复，因此对杨继盛说：“爱卿所奏事关重大，朕自会查明真相，给朝廷一个交代。”就这样对严嵩一再袒护。严嵩看到，杨继盛掌握了他大量的犯罪事实，此人不除，日后必然是祸患。于是他在明世宗面前诬陷杨继盛，说杨继盛在河套边境经常挑衅，才引起鞑靼人的进攻，危害国家的安抚大计，严嵩的死党们也随声附和，使明世宗信以为真。世宗大怒，把杨继盛打了一百廷杖，送交刑部审问。杨继盛在监狱里被关了三个月，还是审不出什么罪状，不过，皇上和严嵩不开口，谁也不敢放了他，就这样在狱中关着，一直持续了一年多。有人跟严嵩说：“你不杀杨继盛，说明人家没有罪，你要承担陷害忠良的罪名，放他出去更是放虎归山，不如早除掉他，免得外人议论。”严嵩只好再去世宗那里进谗言，又捏造了冒领军功等罪名，结果，杨继盛被处死。
严嵩不仅疯狂打击参奏他的政敌，只要形势需要，就会毫不犹豫地牺牲同党的性命，以维护自己的利益。
嘉靖二十九年（1550年），鞑靼部俺答汗率军攻到北京近郊，北京城危在旦夕。这时候，严嵩考虑的不是国家大局，而是个人作为内阁首辅的政绩名声，为了瞒住皇上明军在京郊战事的失利，他千方百计阻止抗战。国子司业赵贞吉等人主张出兵杀退敌兵，严嵩却污蔑他狂妄不切实际，结果被世宗打了板子、降职远调。严嵩还哄骗兵部尚书丁汝夔：“北京近郊在天子眼皮底下，假如战败，你我脸上都无光啊！咱们最好坚守不战，敌军抢够了，自然会撤兵。”于是，丁汝夔传出命令，要坚守不战。各路勤王军到京以后，严嵩举荐他的党羽仇銮为大将军，节制各路兵马。在他的节制下，各路勤王军队眼睁睁看着俺答军杀人放火、抢夺财物。数日以后，敌军烧够、杀够、抢够了以后，大军撤走，严嵩命人假装追杀，回去上奏皇帝说把敌人打跑了。昏庸的明世宗不问青红皂白，听信奸臣的奏报，竟然加封仇銮为太保，并赏赐金币，夸奖严嵩退敌有功，也给予了厚重的赏赐。
毕竟，敌军在郊外烧杀抢掠，要追究责任，严嵩密奏说：
“兵部尚书丁汝夔，保守怯战，不听微臣的劝告，拒不出战，才让敌军有机可乘，杀我子民，抢我财物，有损我天朝国威。”世宗便把兵部尚书丁汝夔下狱，让他听候处理。严嵩怕丁汝夔在狱中揭发自己不出战的罪行，就安慰丁汝夔说：“有我在，一定会搭救你出去。”但是，严嵩为了永绝后患，加紧了谋害丁汝夔的步伐。不久，世宗决定处死丁汝夔。这时候，丁汝夔临刑时才知道上了严嵩的当，大声喊道：“严嵩奸贼，害人不浅！”
严嵩从个人利益出发，倒行逆施，专权误国，还体现在东南沿海的抗倭斗争中。福建巡抚阮鹗在嘉靖三十一（1552年）年私通倭寇，案发以后，朝廷下令缉捕阮鹗，阮鹗以重金贿赂严嵩，竟然免于治罪，仅仅降官一级，算是对朝廷有个交代。相反，抗倭将领张经曾经在嘉靖三十四年（1555年）大败倭寇，俘获斩首的倭寇有二千多人，取得了辉煌的战果。由于没有贿赂东南督军——严嵩义子赵文华，被严嵩和赵文华以冒领军功罪处死。抗倭名将俞大猷，性格豪爽耿直，不会投机钻营，更不会贿赂长官。严嵩恼恨他不对自己唯命是从，就找了个理由把他逮捕入狱。严嵩的倒行逆施，使东南海防人心涣散，他们只知道贿赂讨好严嵩，这样就可以作威作福，没有人再忠心报效国家，致使倭寇越来越猖獗，东南海防一天天坏下去。
严嵩之所以打击异己屡屡得手，倒行逆施却并不获罪，主要是抓住了皇帝这根救命的稻草。世宗朱厚熄生性多疑，唯独严嵩知道他心中想的是什么，如果他想解救同党，先要顺着世宗的意思狠狠骂那人一顿，然后加以委婉的解释，正好说中世宗所不忍心的地方；如果想陷害异己，必然先微妙地解释那个人的优点和缺点，然后找到犯世宗忌讳的地方，巧妙陷害。利用这样的技巧，往往能够成功。另外，世宗皇帝自从嘉靖十八年章圣太后殡天以后，就不再上朝，嘉靖二十年（1541年）发生了“宫婢之变”，宫女们忍受不了世宗对她们的摧残，想勒死世宗，太监们闻声赶来，世宗幸免于难。从那以后，世宗就移居西苑万寿宫，再也不人大内，大臣们很少能够见到他，只有严嵩经常受到召见，皇帝的御札一天就下好几次，就算同是内阁大臣，别人也没有这种机会，因此，严嵩能够随心所欲，按照自己的意志进退官员，处理军国大事。所以，士大夫都很惧怕他，都来依附他以求自保，当时人称文选郎中的万窠、人称职方郎中的方祥，尚书吴鹏：欧阳必进、高燿、许论等人，都小心谨慎的侍奉严嵩，他的权势也超过了他以前的任何一个内阁大臣，就连首辅徐阶也怕他三分。这一年，江南有倭寇作乱，闹得很凶，严嵩对世宗说倭寇已被荡平。徐阶的儿子徐仰斋进入京城，拜见严嵩。徐阶怕儿子说错了话，事先商议了两昼夜，想好了各种应变的对策，才拜见严嵩。严嵩问道：“江南倭寇情况如何？”仰斋回答说：“非常猖獗。”严嵩把脸一沉，让家人送客，赶走了徐仰斋。徐阶知道以后，非常害怕，带着儿子到严府请罪，说自己的儿子不该妄言，严嵩这才作罢。
失宠被劾家破人亡
随着时间的流逝，严嵩慢慢地老了。在很长一段时间，他手中的政事都由儿子代为处理。他的儿子严世蕃长得又矮又胖，是个独眼龙，因为父亲的缘故作了高官。
他继承了父亲的文才、狡诈和心机，不仅精通儒家经典，写得一手好文章，还善于揣摩圣意，所以，每次的票拟都很对世宗的心思。后来，严嵩的妻子死了，严世蕃应该回家守孝，严嵩怕自己缺少帮手，请世宗批准他留在京城。世宗答应了他的要求，但是，从此以后，再也不允许他代替严嵩票拟。严嵩所票拟的奏章往往不称世宗的心意，有时候抓紧派人回家问儿子，正赶上儿子沉湎于女色，答的也是漏洞百出。严嵩看了很不满意，皇上的使者催得又紧，他只好自己动手，不过，效果很不理想，往往不合世宗的心意。慢慢的，世宗就不用他批答政事了，只用他写个青词，严嵩才思枯竭，青词也写不好了，只好找人代写，还是写得不够工巧典雅。后来赶上万寿宫失火，严嵩请世宗暂且住在南城。南城，是英宗作太上皇的时候居住的地方。当初，“土木之变”之后，英宗被也先大军掠走，郧王朱祁钰登上帝位，尊明英宗为太上皇，后来，英宗被迎接回来，就住在南城，没有执政的权力。在人们的心中，那个地方是不吉利的象征。
今天听严嵩这么说，很不高兴。而徐阶则主张建造万寿宫，非常符合世宗的心意。以后世宗就越发的亲近徐阶，有些政事就不再问严嵩了，到问他的时候，只是一些祭祀的事罢了。