这时，议会又要求查理二世对法国宣战，最终查理二世迫于议会的压力，只得同意将自己的侄女玛丽嫁给荷兰的奥伦治王子威廉为妻，以联姻的方式，与荷兰一起对法国形成战争威胁。尽管议会一直在担心并防范查理二世进行独裁统治，查理二世还是想方设法建立了一支小规模的常备军。
当时英国国内的反天主教情绪不断高涨，这使查理二世在国事处理上有点举步维艰。查理二世的弟弟约克公爵詹姆斯就因此而辞去所有政府职务，公开皈依罗马天主教，接着又续娶了同样信仰天主教徒的意大利公主为妻。查理二世的主要情妇、法国的朴次茅斯公爵夫人也是天主教徒，这引起了英国人民的极大不满。
1679年，查理二世第一次解散了保皇党议会，但议会在解散前通过了将罗马天主教徒从上、下议院中驱逐出去的第二个审查条例。第二年春天，新的议会开始了，新议会又提出了一项排斥查理一世信仰天主教的弟弟詹姆斯继承权的法案。但是查理二世决定抵制这项法案。在随后的斗争中，查理二世通过对议会上院施加影响，阻止了这项排斥法案的通过。然而在第四次议会开会时，下院再次表决通过排斥法案，查理二世一怒之下再次解散议会。
不过，有了其父查理一世的前车之鉴，查理二世担心爆发内战，于是他一方面在暗中与法国国王达成秘密协议，一旦发生叛乱，法王将给予支持；另一方面则利用自己的影响，把对自己态度友好的官员安插在中央和地方的主要职务上任职。查理二世最后4年的统治平安无事，是因为他从关税和执照税中增加了税入，所以不再有财政问题了。
1685年2月，查理二世突然患病且病情严重，卧床不起，没想到几天后就去世了。因为国王突然去世，王位一时间出现了空缺。英国的统治集团为了避免造成混乱局面而不可收拾，没有经过充分考虑，就匆匆忙忙地把詹姆斯拥上了王位，史称“詹姆士二世”。
三、詹姆斯二世专权
詹姆斯二世是查理二世的弟弟，1633年10月出生于伦敦圣詹姆斯宫，他是英国最后一位信仰天主教的国王。查理二世曾反对詹姆斯皈依天主教，他下令詹姆斯的子女必须按新教教义培养长大。当时的英国人对天主教仍然怀有很大的敌意，为了取得新教教徒的欢心，詹姆斯让他的女儿玛丽嫁给了一个新教徒——荷兰的威廉王子，即后来的威廉三世。
尽管詹姆斯皈依天主教后，曾经受到议会下院的排斥，但他继承王位的时候却出人意料地顺利。
继承英国王位后，詹姆斯二世立即公开做弥撒，但他也在议会中宣称，他将保护英国国教，即圣公会，因为“其成员在最困难的时刻表现出难能可贵的忠诚”。这时，议会也决定拨给詹姆斯二世一大笔钱。
1685年6月，阿盖尔伯爵发动叛乱，他指挥叛乱武装侵入英格兰。
这时，查理二世的私生子蒙茅斯公爵也起兵反对詹姆斯二世的统治，在英格兰西南部登陆。但这两股叛乱力量很快就被击溃，蒙茅斯公爵在伦敦塔被处死。叛乱虽然被镇压了，但这使詹姆斯二世开始怀疑臣民对自己的忠心。为此，他下令严惩造反者，采取了很多过激的措施，结果使得英国民众认为詹姆斯二世是个暴君，于是对国王的排斥情绪开始滋生。不过，此时的议会对国王仍然是忠诚的。
这年秋天，詹姆斯二世决定不顾第一个审查条例，而允许罗马天主教徒军官在军中服役，并且坚持对不信奉国教的人停止执行有关刑法，这引起了议会下院的强烈抗议，这时的议会变得难以驾驭。
2年后，詹姆斯二世终于也解散了议会，至此，他完全可以利用国王的特权取消或停止一些法律条例的生效，以实现他宗教信仰完全平等、自由的理想。不过，因为议会被解散了，詹姆斯也由此失去了某些议会曾经许诺给他的收入。
接着，詹姆斯二世还指定了一个教士委员会，以便阻止圣公会教士从布道坛上攻击罗马天主教的宗教信条，詹姆斯二世认为这种布道是“轻率的布道”。而且不久，高等法院判定，在特殊情况下，国王可以不受法律的约束。这使詹姆斯二世能够接纳天主教徒进入枢密院，而且能够自由任命罗马天主教徒为陆、海军军官，甚至能选任罗马天主教徒在牛津大学各学院任职。
1687年春，詹姆斯二世发布了首个信教自由宣言，目的是在英国实现完全的宗教自由。第二年，詹姆斯二世再次发布信教自由宣言，指示英国圣公会教士做礼拜时应该在布道坛上朗读。最后，詹姆斯把自己的两个内弟予以免职，因为他们是新教徒，对国王的政策并不赞同。
詹姆斯的忏悔牧师是一个耶稣会的人，他尤其被新教徒看做敌人。此外，詹姆斯二世还开始在伦敦接见罗马教宗的代表，这是自玛丽一世以来，教皇代表第一次来到英国。总之，詹姆斯二世的种种言行使得他逐渐失去了原本支持他的人，英国人民越来越不信任他的宗教政策，反对他的专权。
四、“光荣革命”
对于斯图亚特王朝复辟君主詹姆斯二世的高压政策，英国人民逐渐从不满情绪发展到武装起义。不过，当时新兴的资产阶级和新贵族仍然软弱无力，他们害怕人民的力量，不敢依靠和发动人民通过革命的手段去推翻复辟王朝，于是开始寻求向封建贵族妥协。正是在这种情况下，英国发生了“光荣革命”。
1688年，英国国内爆发了一场危机。当时，国王詹姆斯二世置英国大多数人为新教徒的国情于不顾，企图重新将天主教定为国教，而且强行镇压反对派，解散议会，已经处于众叛亲离的边缘。
终于，在这年夏天，詹姆斯二世的统治出现了根本性的动摇。当时，坎特伯雷大主教和6名主教上书要求国王撤销关于发布第二号信教自由宣言的命令，原因是查理二世在位时，议会曾一再坚持国王无权取消刑法典。这使詹姆斯二世大怒，下令将这7名主教抓起来审判。但出乎他意料的是，陪审团宣判他们无罪，这一判决让平民和军队都感到高兴。同时，詹姆斯二世的王后在6月10日这一天生下了一个儿子——后来被称为“老觊觎王位者”，这使英国处在了很可能再建立一个天主教王朝的危险之中。
就在7名主教被宣布无罪的当天，伦敦主教等人秘密给詹姆斯二世的外甥和女婿、奥兰治亲王威廉发信，邀请他到英格兰来保卫自由和财产，并维护其妻玛丽的王位继承权。当时的威廉正在荷兰与信仰天主教的法国国王路易十四作战，他被英国人民看做是新教的希望。
这时的詹姆斯二世其实心里也清楚，君主专制的时代在英国已经一去不复返了，自己并没有特权确保把天主教重新立为英国的国教，因此他正在努力去重组一个新的议会。然而，形势已经出乎他的控制。
1688年6月底，在新的议会选举之前，一群新教贵族要求威廉带军进入英国。
9月，威廉将要进攻英国的意图已经非常明显，但詹姆斯二世拒绝了法王路易十四为他提供军队的建议，因为他怕这样更加引起英国人的反对。他相信他的军队足以抵抗威廉。但他错了。11月，来自荷兰的威廉开始登陆英格兰。
很快，英国所有信仰新教的军官都叛变了，詹姆斯二世的另一个女儿安妮也参加了入侵军，并带走了许多王室的支持者。詹姆斯二世此时已是众叛亲离。于是威廉不费吹灰之力就占领了英国，并将詹姆斯二世软禁。
12月的一天，詹姆斯二世趁守卫的人不注意，悄悄逃出伦敦，并将英国国王的大印扔进泰晤士河，随后逃往法国。然而，詹姆士二世在肯特登船外逃时被渔夫认出，随即被捕。不过所幸的是，威廉不希望詹姆斯二世成为一个殉教者，因此于12月23日故意让他逃跑了。最终还是法王路易十四收留了詹姆斯二世，给了他一座宫殿和很高的收入，詹姆斯二世此后就住在这里，1696年有人企图刺杀威廉三世让他重返王位，但没有成功。
詹姆斯二世年轻时曾是个很有才华和能干的军人，但他生性急躁，且狂妄自大，沉溺酒色。法国国王路易十四虽然收留了詹姆斯二世，但对于他在宗教问题上顽固不化的态度，也称他是一个傻瓜，竟然会为了一台弥撒而抛弃了3个王国。被迫退位后，詹姆斯二世终生未回英国，在圣日耳曼度过了余生。据说，詹姆斯二世后来一直虔诚地悔恨自己所犯下的罪行，直到66岁时死于心肌梗死。
来自荷兰的威廉登陆英国后，召集了一次“惯例议会”。“惯例议会”一般在英国王位空缺时召开，比如内战后将王位授予查理二世的就是一次“惯例议会”。1689年2月12日，英国召开了“惯例议会”，会议宣布国王詹姆斯二世在逃离伦敦之时就已经自动放弃王位了，因此目前王位空缺；因此会议决定由詹姆斯二世的女儿玛丽继承英国王位，她将与丈夫威廉三世共同统治英国。随后不久，威廉和玛丽正式成为英国的君主，这就是英国历史上一直让人们津津乐道的“光荣革命”。
威廉和玛丽执政后，首先通过了一个法令，这个法令不仅指出詹姆斯二世滥用权力，还写明了未来英国王位的继承人顺序：首先是威廉三世和玛丽二世的孩子，然后是公主安妮和她的孩子，最后是威廉三世假如再娶的话而生的孩子。
五、夫妻共治
玛丽女王是英国斯图亚特复辟王朝的君主詹姆斯二世和其第一个王后安妮·海德王后的长女，也是荷兰执政威廉的妻子。1688年“光荣革命”期间，玛丽支持丈夫威廉进入英国，并随丈夫开进伦敦，结束了父亲詹姆斯二世的统治。1689年4月，她与丈夫签署了《权利法案》，两人共同统治英格兰，威廉号称“威廉三世”，她号称“玛丽二世”。后来，威廉三世辗转于爱尔兰和欧洲大陆指挥作战，玛丽二世则在枢密院的辅佐下主理朝政。
在玛丽二世统治期间，信仰新教的她十分活跃，还以勤于政务和善于决断而受人尊敬。尽管丈夫威廉三世拥有大部分权力，但在日常的政务处理上，主要还是依靠玛丽女王。她当政时，还自封为法国女王。因为玛丽女王性格温文尔雅，待人接物有礼有节，因此得到丈夫的百般敬重和爱慕。
威廉三世在入主英国前是奥兰治亲王、荷兰执政，他是荷兰前执政威廉二世与英国国王查理一世之女玛丽公主的儿子。此前，为与英国结盟，他与表妹、英国公主玛丽结婚。1688年11月，英国发生“光荣革命”时，英国议会邀请威廉登陆并统治英国，不久，威廉与玛丽夫妇共同加冕为英国国王。
这次王位更替在英国历史上有着里程碑式的意义，它意味着英国1640年爆发的资产阶级革命的结束，自此建立起了世界上第一个长期稳定的君主立宪制，这就是史家所啧啧称道的“光荣革命”。由此，英国逐渐树立立宪君主制和议会高于王权的政治原则，而威廉三世成为“英国国王兼荷兰执政”，这是英、荷两国在历史上唯一一次被划到了同一个人的名下。
1701年，英国议会又通过了《嗣位法》，该法案不仅规定了玛丽女王的妹妹安妮公主为继承人，还规定了今后任何天主教徒皆不能继承英国王位，任何英国国王皆不得与罗马天主教徒结婚等。
“光荣革命”后，威廉三世与玛丽二世夫妻二人共享英国王位，但玛丽女王长期甘居幕后，威廉三世则是实际上的国王，只有在威廉出征海外时，玛丽才出来主政。威廉三世虽然信仰新教，但他是一个宗教宽容者，对天主教没有什么偏见。威廉三世曾被后人列入世界历史上最有影响的帝王之中，这主要是因为在他执政期间，不仅使荷兰渡过了被英、法两国夹击的艰难岁月，维持了荷兰“海上马车夫”的独立和强盛；而且他还顺利接受了《权利法案》，使英国跨入了君主立宪制，而后者对英国历史和世界历史都产生了重要的影响。
总之，英国资产阶级革命经过半个世纪的反复斗争，终于推翻了封建专制制度，它是人类历史上资本主义制度对封建制度的第一次重大胜利。资本主义制度同封建制度相比较，是人类历史的一个重大进步。英国资产阶级革命为英国资本主义迅速发展扫清了道路，大大促进了生产力的发展。100年后，英国发生了工业革命，成为大机器工业的发源地。此外，英国资产阶级革命揭开了欧洲和北美资产阶级革命运动的序幕，开辟了资产阶级革命的新时代，有着划时代的意义，它标志着世界近代史的开端。