公司初创时，没有严格的管理制度，也没有严格的工作流程，而是自由争论，平等决策。楼文胜说：“决定页面时，彻夜不停的争论：设计标识（LOGO）时，争论过二十几个方案，当盛一飞拿出今天人们到处可见的那个字母a的变形时，大家一致认可。其实这个标识的人形就是孙彤宇的侧面像。”设计页面时，开始由宝宝做了个模板，这个模板做得很成功，有很好的扩展性，然后大家在这个模板基础上一起开发程序，狮子主要负责写Windows下的程序，很快阿里巴巴的页面就设计出来了。
马云说：“因为我不懂技术细节，而我的同事们都是世界级的互联网顶尖高手，所以我尊重他们，我很听他们的。他们说该这样做，我说好，你就这样去做吧。试想一下，如果我很懂技术，我就很可能说：那样没有这样好。我会天天跟他吵架，吵技术问题，而没有时间去思考发展问题。”
尊重和不干预，马云对待工程师一直是这个态度。开始公司里只有三四个工程师时是如此，后来公司里的技术人员发展到500人，还是如此。马云一直把他们当做一个另类群体，尊重他们宽容他们，甚至给他们特殊政策和特殊待遇，并为他们的发展开拓了广阔的空间。马云清楚，一个网络公司离不开技术，他时常为阿里巴巴拥有众多的世界级的网络高手而自豪。在他不惜工本千方百计吸纳人才时，其中很多人都是像雅虎搜索器开发者——吴炯这样的技术人才。现在阿里巴巴的工程师分为P1、P2、P3三个等级，但成为了P3以后还可以发展。马云早就宣布过：工程师可以做技术副总裁，也可以做COO和CEO。阿里巴巴的现任COO李琪就是工程师出身。
但马云从创办网络公司的第一天起始终坚持：技术很重要，但技术不是第一位的，技术要为商业模式服务。马云虽不干预技术细节，但要干预技术设计的原则。对此，马云说：“有一段时间我就像公司里的技术检查员，有时候技术人员做出一样东西后说这样东西非常好，我一看我不会用，我说，因为我不会用，所以85%的人不会用，如果我会用这东西还可以拿出去。”
马云提出来的阿里巴巴设计原则是：简单。马云还和其他人一起干预了主页面的设计：“我们极其挑剔，仅一个主页面，我们就枪毙了16稿。”
启动时的阿里巴巴因为只有十几个人，因而分工也很简单。除了4个程序员外，其他人都做编辑和客服，当时还是一人身兼数职，人手少，不兼也得兼。团队中有6名女将，她们不但要做信息编辑和客服，还得负责行政、后勤、出纳。
阿里巴巴一开始就推出了中英文两个网站。网站启动时，信息是零，会员也是零。迫在眉睫的问题是：如何证明这个网站是有价值的，是可以为客户带来财富的？
启动是异常艰难的。开始网上每天只有10来条信息，后来变成20来条，好多天以后才突破100条。但几个月后，阿里巴巴网站上一天的信息就有几百条。信息来了之后，阿里巴巴的员工们对每一条信息进行人工检测核实，确认基本可信后才把它放在网上。信息多起来之后，员工们就对其进行分类。当时的阿里巴巴，全世界的商人都可以在上面免费发布信息包括最新样品的图片，也可以在上面免费查找信息和贸易伙伴，阿里巴巴网上的所有信息都来自客户，这些信息经过阿里巴巴员工的初步核实后，然后将其按照行业类别进行分类整理后再发布到网上。阿里巴巴网站一启动就实行会员制。开始会员增长得很慢，后来EDI的中国商品交易市场网上的很多会贡听说了阿里巴巴，纷纷前来加入，会员的增长也快了起来。
开始马云提出一年要有1万个会员，大家都不相信。结果2个月后，会员敷就突破了2万。不久马云又在阿里巴巴网上开辟了一个真正的BBS，就叫以商会友论坛。开始没什么人，阿里巴巴的员工就自己注册了几个马甲，然后往上贴，把论坛烘热。烘了大半年，人气上来了，几年后这个论坛发展成中国商人第一网络媒体。就在国内大大小小的网站热衷于买卖、拍卖，成交之声不绝于耳时，阿里巴巴仍然坚持只给会员提供免费的信息交流和产品展示。
阿里巴巴网站的会员都可以通过网上的简单操作在阿里巴巴建立自己的私人“样品房”，陈列展示他的样品图文信息，并拥有自己的独立网址，而且所有的服务都是免费的：每一条信息都经过网站编辑人员细致的检查整理，在12小时内得到发布。另一方面，会员可以在阿里巴巴获得他想要的信息。只要注册成为会员，就可以免费享有阿里巴巴网站的信息资源，这些来自全球范围的最新买、卖、合作机会信息涵盖32个行业700多项产品，用户可以通过产品的关键词、买卖类型等多种方式检索。
阿里巴巴的客服则是通过E-mail与客户互动。阿里巴巴的创业时代是艰苦卓绝的时代。网站启动时，马云就对员工说：“6个月内不见媒体。”因而开始的6个月，阿里巴巴基本上是封闭运作的。开始的十几人，后来的几十个人，关在湖畔花园里，日夜苦战，闭门造船，造一艘史无前例的名叫阿里巴巴的“战船”。“6个月内，我们要造一艘船，这就是阿里巴巴。还要训练一支船员队伍。起航出港后，天气好我们会跑得很快，但如果碰到狂风暴雨，才发现船造得不牢固，船员队伍不够坚强，大家都将随着这艘船一起沉没。”马云如此告诫大家。
阿里巴巴前6个月的成长速度是惊人的。1999年3月10日阿里巴巴从零信息、零会员起步，1999年5月1日，阿里巴巴中英文网站注册会员分别突破1万名，会员总数超过2万人。1999年5月20日，经过2个多月的技术开发和测试，阿里巴巴网站第2版正式推出。1999年7月9日，在香港注册成立阿里巴巴中国控股有限公司，届时会员达到3.8万名，页面浏览率每天12.5万。1999年9月9日，阿里巴巴（杭州）研究发展中心正式注册成立。届时会员突破8万名，库存买卖信息20万，每天新增信息800条。
正是因为马云的秘密制造策略，阿里巴巴的业务的增长会员的增长都是靠客户心口相传。从某种角度来看，阿里巴巴的快速成长也得益于马云的秘密策略，因为多年的坎坷经历让他早已明白“锋芒毕露不如隐身江湖”的道理。
8.气吞寰宇，让天下没有难做的生意
“我认为互联网就那么两大块业务能赚大钱，一是电子商贸，一是娱乐。我不认为有人会一辈子都只顾玩乐，也不相信网络游戏能够改变世界，我还是最看好电子商贸的前景。”
——马云
从那一天起，马云开始铁下心来做电子商务。不仅是为了做一个网站，更是想做一个世界级的公司，中国最伟大的公司。把创办阿里巴巴前后的所有故事都联系起来以后，我们不得不承认一个道理：时势只是给了英雄生存的土壤，内心的伟大梦想与崇高使命才是成就英雄的最大动因。今天，用“英雄”或者“教父”来称呼马云，或许有违作者一贯坚持的财经写作的中立、客观的立场，但马云的确是配得上这个光荣称号的。