按照公安部党委要求，禁毒局局长刘跃进率员奔赴西双版纳，抽调云南省公安厅、西双版纳州公安局骨干侦查员成立“10·5”案件专案组。
彻查湄公河案件真相、严惩幕后真凶的同时，如何保障湄公河航运安全，防止类似案件再次发生，成为更艰巨的任务。湄公河上的货运，基本被来自中国的商船所主导。按照云南省的官方数据，湄公河国际航道的货运船只在2011年共有130艘，其中110艘属于中国。清盛作为泰国的一个边陲之地，在港口的带动下发生了翻天覆地的变化，每天都会有数千吨中国水果、蔬菜抵达这个小港，中国回国的船上则装满了泰国的橡胶、木材和干果。但是，这一切都在案件发生后停了下来。真凶没有抓到之前，很少有商船敢于再次冒险进入那片危机四伏的水域。
2011年泰国水灾期间，中国是第一个向其提供赈灾援助的国家。10月29日，温家宝总理打电话给泰国总理英拉，首先就泰国遭受罕见的洪涝灾害表达了诚挚慰问，并表示在已提供的援助基础上，再向泰国政府提供救灾援助。他同时要求泰方查明真相，加紧审理此案，依法严惩凶手，并希望中泰老缅四国协商建立联合执法安全合作机制，共同维护湄公河航运秩序。
建立联合执法安全合作机制——这是恢复湄公河秩序的负责任之举，体现了中国以苍生为念的大国智慧与胸怀，最终受益的将是湄公河两岸的各国人民。2011年10月31日，中国国务委员、公安部部长孟建柱与泰国副总理哥威、老挝副总理兼国防部长隆再和缅甸内政部长哥哥在北京召开专门磋商会议，并发布了《中老缅泰关于湄公河流域执法安全合作的联合声明》，就在湄公河流域加强联合巡逻执法、联合整治治安突出问题、联合打击跨国犯罪、共同应对突发事件等议题达成了共识，表示将争取在12月大湄公河次区域经济合作领导人会议召开之前恢复湄公河航运。