端方这支部队是清朝在南方残存的生力军。为了挽救四川政局，清廷下令将赵尔丰革职，新任端方为四川总督。端方思想开明，倾向宪政改革，而且知道南方局势已经糜烂，不是一城一地的得失可以挽回的。朝廷需要的是宏观体制的改革，需要缓和百姓的愤怒。他既知事情不可为，就想回北京向最高统治者面陈机宜。遗憾的是，局势不允许他这么做。
端方计划启程的时候，还没有得到成都独立的消息。资州知州将成都的混乱情况告诉了端方，端方更加坚定决心要返回北京。但是资州当地士绅包围他，请求：“端公别走。您如果反正，成都唾手可得，到时大家都会推举您为都督。况且，现在端公率领的部队已经出现了哗变的迹象，如果您不反正，恐怕祸起萧墙。”地方士绅的话没错，端方带来的湖北新军内部有革命倾向，端方最好的对策就是率领这支生力军攻入成都，自己当都督。端方的可悲之处，就在于他虽然开明，了解民主宪政，却对清朝愚忠，坚持要回北京。士绅们再次请求说：“端公如果担心成都不能容，可以在资州易帜反正，我等可函致各地士绅来资州拥您为主，公幸勿疑。”端方长叹：“如果我那么做，有何面目见慈禧太后、德宗皇帝（指光绪）于地下哉！我计决矣，君等毋为我虑也。”地方官和士绅们见端方顽固不化，都叹息而散。
但是，军队拖了端方的后腿，让他无法成行。新军计划响应革命，加上对前途迷茫无期，部队军心浮动。端方在资州盘桓多日，一来是他向成都的银行借了四万两白银发本月军饷，借银未至；二来是有土匪相约来投诚，他想等待他们如约而来（都什么时候了，端方还想收编土匪，真是尽职）。端方越犹豫，军心就越浮动。官兵们对端方进行信息封锁，南北公私函电和同僚之间的信牍都被官兵们截留，到不了端方手上。所以，端方只知道武昌新军起义和成都局势动荡两件事情，对此后的各省独立都一无所知。不过，新军官兵们的消息是灵通的，他们知道得远远比端方多。他们要谋划自身利益，想在大动荡中分得一杯羹。
端方所率两标人马统兵者分别是曾广大和邓某，都是端方担任湖广总督的时候提拔起来的，和端方有师生之谊。出发前，瑞澂又推荐了董海澜给端方，端方任命他做了管带，一起入川。一路上，端方为稳定军心，极力笼络部下。有士兵生病了，端方派弟弟到军营问候；有士兵亡故了，端方亲自修书哀悼；沿途官民劳军的粮食，端方都先尝毒；甚至有士兵行军途中掉队了，端方竟然下令雇轿抬着他。所以，端方得到了部分军心，曾广大也约束士兵，不让大家乱动。
端方本来如果赶紧离开，或者偷偷离开都可以，不过他把成都银行借银的事情布告给了官兵。这批银子迟迟没有到，官兵们就不让端方走。12月27日黎明，端方都收拾好回京行李了，他任命的管带董海澜竟煽动部分官兵冲入端方的行馆，把端方软禁到侧屋中，然后遍搜行箧，想得到些金银财宝。结果，乱军没得到什么银两，愤怒之下要杀端方。曾广大为他求情说：“端方不是骗子，他想走就让他走吧，何必杀呢？”他提议举手表决要不要放走端方。结果举手的人很少。曾广大再三劝说，乱军气势汹汹，怀疑曾广大有异心，扬言要先杀曾广大再杀端方。曾广大不敢再说，大哭而走。乱兵把端方逼到行馆的一间屋中，乱刃齐下，又割下他的脑袋，返回武汉去了。端方的弟弟端锦见哥哥惨死，大骂乱军。乱兵强迫他跪下，他不跪，也被乱刃刺死，被割下了脑袋。第二天，成都银行的四万两银子到达了资州，可惜挽回不了端方的命了。
据说端方在最后的日子中，一再声称自己祖先姓陶，是汉人，明末清初的时候不得已才加入八旗。为此，他还把名字改为“陶方”。不过此举未能让他脱离噩运。
金陵王气黯然收
四川独立后，长江以南各省全部光复，依然处在清朝统治下的只有江宁一座孤城了。
江宁，就是南京，是六朝古都、东南都会，当时处境非常危险。周边的镇江、常熟、江阴、宜兴、南通、扬州等地的清朝官吏和守军或起义，或不战而逃，城市相继光复。就连江苏最北部的徐州，也在当地士绅组织下宣告独立。南京被光复地区团团包围，成了名副其实的大洋孤岛。让清廷聊感欣慰的是，困守南京的清朝官吏“忠君报国”，在四面楚歌的绝境中依然顽强地和起义军对抗。
镇守南京的清朝官吏主要有三个人。为首的是两江总督张人骏。他是64岁的老臣了，直隶人（河北丰润人），进士出身，宦海沉浮多年。城内驻扎着八旗驻屯军，由江宁将军铁良统帅。铁良，满族人，曾任幕僚和侍郎，后赴日本考察军事，回国后任练兵大臣、陆军部尚书，对新旧军事都很有心得，被视为满族人中最“知兵”的人，是可以和袁世凯相对抗的实干人才。可惜，载沣上台后，认为铁良不是自己“这一条线”上的人，非但没有重用他，还将他贬到南京来养老，落得个眼不见心不烦。当时，铁良已经58岁了。
第三个人就是57岁的江南提督张勋。这个人值得大书特书一下。张勋，江西奉新人，出身贫寒，吃过糠咽过菜，做过苦力受过责打，二十多岁投军，目的只是混口饭吃。他和湖北张彪的经历类似，都算得上是“苦大仇深”、“苗正根红”的苦孩子。但是参军后，张勋因为头脑简单、为人忠厚（在新军中经常受同伴欺负和鄙视），得到赏识，稳步升迁。据说八国联军侵华，慈禧太后西逃的时候。张勋不顾身上有伤，寸步不离慈禧的车驾，日夜护卫，把慈禧感动得不行，直夸他是忠臣。到革命爆发的时候，这个昔日的苦孩子已经拥有了荣华富贵和庞大军队了。晚清的时候，朝廷提拔了不少像张勋这样的人，尤其是北洋新军中有很多穷苦人家出身的将校。他们按照原来的仕途规律，几乎没有可能进入官场当官，能在社会上混个温饱就不错了，如今朝廷给了他们高官厚禄、莺歌燕舞和强大的势力，他们怎么能不对清廷感恩戴德呢？相反，那些从小在温柔乡里长大的权贵，不是缩头不吭声就是望风而降、闻风而逃，让清廷大为失望。
话说，张人骏、铁良、张勋三个人都忠于清室，武昌起义后大肆搜捕革命党人。遇着剪去辫子的青年，立即逮捕，押往刑场斩首，杀后悬首示众。城内到处是手持大刀的旧军，无辫青年吓得戴上假发藏在家中，不敢出大门一步。
进入11月份后，东南一带纷纷独立。张人骏等人收拢南京周边的军队，加固工事，防备革命军来攻。南京城内的驻军并不算少。占大头的是旧军，主要是张勋统率的江防军和江宁将军铁良的旗兵，总兵力约二万人。新军编练为第九镇，总数约七千人，统制为徐绍桢。新军官兵倾向革命。广州起义的指挥赵声曾在第九镇进行兵运活动，张人骏因此将他斥退。武昌枪响后，张人骏和铁良认为新军不可恃，调了江防营驻扎在新军兵营附近，同时不顾徐绍桢的反对，断绝了新军的军火弹药补给，还收缴了官兵们在打靶和训练的时候留存的子弹，抢走了营中的大炮和机关枪。新旧军之间的对立情绪陡然上升，占据火力优势的旧军把炮口都对准了新军兵营。眼看着火并一触即发，城中的士绅、商户赶紧找张人骏请愿：要打，也不要在城里打起来啊！不如将新军移往城外。张人骏觉得这个主意不错，10月31日命第九镇限期从市内移防至距城65里的秣陵关。南京城的防务全部交由江防营和巡防营负责。张人骏给旧军每人发足了武器弹药，单单子弹就每人发了500发，以防万一。而出防的第九镇的武器弹药就可怜得多了，士兵平均每人仅有子弹3发。
即便如此，张人骏等人还是对第九镇不放心，命令旧军把炮口都对准秣陵关方向，抽调城外旧军包围第九镇。张勋则派人监视徐绍桢，观察动静。又有两名满族军官，暗藏手枪，求见徐绍桢，企图行刺。徐绍桢是广东番禺人，中过举人，考察过军事，当过总兵、提督，当时已经50岁了，本无意革命，但被张人骏等人苦苦相逼，胸中怒气咽不下去。部下原本就倾向革命，如今更是起义呼声迭起。徐绍桢于是决心起义。反正被张人骏等人步步紧逼，难逃一死，不如揭竿而起，看看鹿死谁手？
徐绍桢联络南京城内同情革命的旧军官兵，约为内应，定于11月8日第九镇以演习为名发难，袭取南京城。不料，城内的人自行于7日仓促起义，被张勋调兵镇压。张勋手下的悍将、江防军统领王有宏亲自用机关炮击毙起事士兵20余人。旧军中的革命官兵溃散。事后，南京城紧闭城门，全城戒备，如临大敌。第九镇官兵听说城内已经起事，在11月8日黎明誓师，兵分三路向南京城进发。南京城虎踞龙盘，周边堡垒要塞众多，加上几个朝代的苦心经营，城防异常坚固。起义官兵非常英勇，发起连续冲锋，都冲不破装备精良、占据有利地形的清军。再加上起义军弹药严重不足，血肉之躯难以战胜钢铁工事，厮杀到9日拂晓，起义军伤亡惨重，弹药用尽，被迫向镇江方向撤退。之前，第九镇某营管带林述庆已经在镇江起义，成立了镇江军政分府。徐绍桢就在镇江收拢残部，并向周边独立政权求援。
11月11日，沪军都督陈其美分别致电江苏都督程德全、浙江都督汤寿潜，提议组织江浙联军，会攻南京，并推举徐绍桢为联军总司令。程、汤二人马上复电赞同。东南各处军队，纷纷向镇江地区集结，既有镇军、浙军、苏军、淞军、沪军，还有松江、江阴等地起义的巡防营，总兵力达万余人。
江浙联军会攻南京城，是东南革命最坚硬、最困难的一仗。联军不敢怠慢，先派出一支部队渡过长江，绕到南京城北，截断清军的后撤道路，然后各军再开始对城外要塞发动进攻。11月24日，淞军及浙军一部攻占乌龙山，乘胜又于次日晨攻克幕府山。联军赶紧在山上安置重炮，威胁城内清军据点。同日，浙军主力及镇军、苏军接近南京城墙，与清军展开了一场遭遇战。士气高昂的联军在战斗中歼敌千余，俘敌数百。清军统领王有宏被击毙，大大挫伤了清军的士气。战后，联军成功占领孝陵卫，前锋抵达紫金山脚下。
张勋见联军步步推进，清军处境不妙，在26日亲自率领数千名清军出击，扑向幕府山、孝陵卫。张勋是玩了命地督战，往前冲，联军是钉死在阵地上，寸步不让。双方反复争夺阵地，苦战了一天。最后，清军不敌，张勋撤回城中。联军乘胜肃清了城外残存的清军。
29日凌晨开始，联军对南京城发动总攻。浙军进攻朝阳门，苏军进攻雨花台，都被清军居高临下击退。联军重新部署后，决定对雨花台发动佯攻，主力先取城外制高点天堡城，然后俯攻南京。天堡城位于紫金山西峰山顶的绝壁之上，是由太平军修建的，当年湘军和太平军在此展开过旷日持久的鏖战。如今，堡垒内的清军凭借储存的大量火炮和机关枪，据险顽抗。联军自下而上，冒着枪林弹雨仰攻，伤亡很大，进展很小。革命军拿出了攻坚的老方法：上敢死队！联军组织两队敢死队，从两面进攻天堡城。敢死队员攀岩走壁，不怕牺牲，无畏地向前冲。各军紧随其后，向山上冲去。清军渐渐不支，天堡城挂出了白旗。联军官兵们高兴起来，原地停止了进攻，派人上前联络。不料，天堡城的清军是假投降，趁联军麻痹下来，突然集中火炮和机关枪向联军队伍猛烈射击。联军倒下了上百人。幸存的战友们愤怒至极，冒死冲锋，终于将守敌全部歼灭，占领天堡城。站在天堡城上，联军可以鸟瞰南京全城。官兵们将堡垒中的大炮调转炮口，对着城内朝阳门、富贵山、太平门等处轰击，连连命中目标。
天堡城上炮声一响，城内清军立刻胆寒。南京城全部暴露在革命军炮口之下了！紧接着，雨花台也被联军攻占，环绕南京的制高点全部为联军所控制，清军已经无险可守。张勋知道败局已定，终于想到“和平”解决问题了。他派人分别向联军总司令徐绍桢、镇江都督林述庆求和，以交出南京城为条件，要求革命军允许江防军移往别处。徐、林只答应接受清军投降，拒绝张勋所部转移他处。当晚，张勋率部偷偷渡江，向北逃去。张人骏、铁良等人也在当天夜间乘船出逃。张人骏逃亡上海，当起了寓公。（现在，人们都知道他有一个出名的侄女：张爱玲。）铁良逃往北京，继续效忠他的朝廷去了。
张勋带着部队逃跑，难度大了很多。这支清军遭到了江北革命军的层层阻拦。张勋边战边逃，丢弃了大量军需辎重，一路狂奔到徐州才停歇下来。徐州原本已经独立，但由士绅与旧官僚主导，态度并不坚定，如今见张大帅到来，自动取消了独立。张勋就此长期在徐州盘踞下来。清廷将张人骏革职，让张勋在徐州空挂起两江总督的虚职，算是对这个顽固悍将的褒奖。
南京城内残存的清军多数是巡防营，无心抵抗，开城投降。12月2日，江浙联军开进南京城。南京光复。
“人世几回伤往事，山形依旧枕寒流。”南京城看惯了金戈铁马，穿城而过的长江淘尽了千古英雄。如今，光复后的南京城即将见证前所未有的历史变迁。南京曾经是六朝古都，是历史上南方的政治中心，又是前明朱元璋和太平天国洪秀全的都城。它的光复被革命党人附上了浓厚的政治色彩。主张“排满兴汉”的人们特别兴奋。入城后，江浙联军将士们络绎不绝地到紫金山山南的明孝陵（明太祖朱元璋的陵墓）去祭奠，文人墨客们也竞相鼓吹。
至此，南方各省全部独立。南方浑然一体，南北对峙局面形成。湖北、湖南、江西升起了十八星旗，广东、广西、云南和福建飘扬着青天白日旗，江苏、浙江、安徽等地换上了光复会的五色旗。其他反正省份，主要靠士绅和旧官僚主导独立，革命党的力量并不强大，挂的是白旗，有的在旗上写“大汉”或者“兴汉”几个大字。
说完南方独立的景象，我们来看看北方的革命情势。
袁世凯的北洋军帮助清朝稳定了华北几省的形势。比如河南省，在陕西、湖北、山西、安徽等独立省份的包围下，没有独立。河南革命党人也发动了会党，组织了起义。但北洋军因为镇压武昌起义的缘故，早早就南下河南，压制住了当地的独立倾向。袁世凯本人在河南的人脉关系也起到了效果。又比如山东，巡抚孙宝琦原本就是庆亲王奕劻的儿女亲家，面对士绅和新军的独立压力，才不得不在官绅大会上宣布山东独立。后来，北洋军向山东方面施压，孙宝琦自然宣布取消了独立。
当然，这并不是说北方革命党人没有努力，没有流血牺牲。北方和南方一样，革命势力渗透到了各地。即便是在清朝“龙兴之地”的东三省，新军中也有大批革命党人。东北地区成立了同盟会辽东支部，领导人主要是“士官三杰”蓝天蔚、吴禄贞、张绍曾等。他们一直在积极筹谋北方新军革命。