蒙莫斯战场上的严重失误大大打击了李将军在军中的威信。但是他不认为这次的失败是他个人原因造成的，在写给华盛顿的一封信里，他将所有的过错都归结在误传情报的信使身上，如果他没有收到假情报，就不会主动撤退，也不至于兵败如此。他的信带有很浓的火药味，并且将矛头直接指向了华盛顿。他抱怨自己没有得到应有的待遇，指责华盛顿过分偏袒外国军官而视他为无物。他表达了自己失望的心情，并透露了愿意退役的想法。华盛顿接到他的信之后，就立即做了答复。他认为他和李将军之间存在很大的误会，他解释了为什么要启用拉斐特做指挥官的原因。他认为拉斐特具有非凡的军事指挥才能，在军队中也颇得人心，并且他在李将军归来之前就已经在军中担任了相当级别的职务。因此，他任用拉斐特并非出于个人的交情，而是遵循人尽其才的原则。他劝李将军做一个心胸宽广的人，只有大家齐心协力通力合作，才能够保证战争的胜利。至于他要退役的决定，华盛顿并没有做出明确的答复，因为他知道李将军擅自撤军一事已经造成了严重的后果，有可能会上军事法庭。果然，没过多久，大陆会议就给李将军下达了通知让他上军事法庭接受调查。不过这次，李将军并没有为自己申辩什么，也许他的内心也已经做好了退出军队的准备，所以他一再催促军事法庭就蒙莫斯一案赶快做出裁定。军事法庭做出的裁定是李将军故意违背军令，擅自撤兵，从而导致蒙莫斯的兵败。因此，他被撤销了大陆军指挥官的职位，同时也被批准了退役回乡的申请。李将军回到故乡弗吉尼亚之后，就开始安心地在自己的土地上过起了隐士的生活。不过他的性格决定了他对这件事情并不甘心。他后来在家乡的报纸上连续发表了一些措辞严厉的文章，嘲讽大陆会议和华盛顿，华盛顿由于深谙他的性格，因此并不跟他计较。李将军在家乡待了一段时间之后，又十分想念部队的生活，因此他又动身去了费城，希望能够重新获得大陆会议的批准再次参军，结果他在费城不幸感染了风寒，回到家乡后不久就去世了。李将军生来就是一个性格迥异的人，他的遗嘱也是相当的另类。他在遗嘱中交代死后不要把他葬在距离任何长老派或洗礼派教堂不到1英里的地方，因为他生前就同一些他很讨厌的同伴待在一起，他不希望死后继续这样。
7月22日，法国舰队回到了桑迪胡克。法国舰队这次出征的目标是罗德岛。根据法美两军的协议，先由美军从陆路进攻，然后法国舰队随后跟上，并在罗德岛的西岸登陆。与此同时，美国军队要穿过希科涅特海峡，在靠近岛屿北端的地方登陆。为了这次联合行动能够顺利实施，早在7月17日，华盛顿就给驻守在普罗维登斯的苏利文将军写了一封信，让他随时做好南下哈德逊的准备，并让他召集新英格兰的民兵团随时接应主力部队。随后他派格林将军和拉斐特将军前去新英格兰协助苏利文的工作。苏利文很快就集结了两个师的兵力，一支部队交给格林将军负责，另一支则交给拉斐特负责。为了等待华盛顿的援军，这次联合行动的实施的时间推迟到了8月10日。正是这次延误，导致了此项计划的失败。
8月8日，法国将军德斯汤公爵率领舰队进入了海港，舰队在驶入哥特岛的时候，同英军展开了激烈的炮轰。英军出师不利，被法军舰队打得连连败退。最后为了撤退，还不得不焚烧了三艘护卫舰。与此同时，苏利文将军率领部队从普罗维登斯南下，抵达了郝兰德渡口。此时英军的舰队正驻扎在郝兰德的对面，为了防止被美军切断退路，他们于8日晚上撤退到了新港口。见敌军弃堡逃走，苏利文将军立刻命令部队占领了敌军的据点。然而由于他的行动没有跟德斯汤公爵事先通气，导致德斯汤公爵对他产生了很大的意见。然而联合行动还是照常进行着。9日凌晨，德斯汤公爵的舰队直逼新港口。此时驻守在新港口的英军指挥官不是别人，正是退役的豪将军的哥哥豪勋爵。豪勋爵是一名海军司令官，指挥海军作战的经验一点都不比法国人少。而且，他已经事先派人送加急信件请求援助，援军及时赶到，使他又多增加了四艘大战船以及10艘护卫舰。要不是联合行动计划推迟，援军根本不可能及时赶到，那么法军摧毁英军的舰队就是易如反掌的事情了。但是木已成舟，美法联军目前面临的只能是同英军之间的一场恶战。豪将军在朱迪斯角占据了一个有利的位置，随时准备向法军舰队开炮。晚上的时候，突然刮起了东北风，这个风向对美法联军十分有利，于是德斯汤伯爵打算利用这个机会打击敌人。法国舰队在穿越排炮网的时候遭到了英军猛烈的轰击，但是没有受到实质性的损伤。但是豪勋爵似乎并不想同法军决一死战，在形势相对不利的情况下，他决定首先保存实力，等时机扭转再展开反扑。于是，豪勋爵命令舰队在海湾同法军慢慢地周旋，双方偶尔开一次炮，但是基本上都是在兜圈子。最后，英法两军的舰队消失在了广阔的海面上。谁都不知道他们的舰队开往何方去了。
苏利文将军在朱迪斯角等候法军舰队的归来，一直等了十来天，才终于见到了法军的踪影。原来，法国舰队在海上遭遇了大风暴，舰船受到了重大的损伤，已经没有办法继续战斗了。得知这个消息，苏利文将军又急又气，在这个节骨眼上，法军如果退出，仅凭他们的力量，肯定无法同英军抗衡。然而德斯汤伯爵似乎很坚决，他执意要将舰队开往波士顿在那里做了整修之后才肯继续出战。这简直就是个可怕的消息。英军一步步逼近，无论如何，他们也不能让法军就此放弃作战计划的。于是，格林将军、拉斐特将军以及苏利文将军纷纷劝说德斯汤伯爵，企图让他改变初衷继续配合作战。然而法国海军中的许多将军都已经去意已决，仅凭德斯汤伯爵一个人根本无法决定整个舰队的去留。最终，他们还是离开了盟军，朝波士顿方向开去。
得知法军背信弃义的消息，美军感到十分愤怒，而英军感到欣喜若狂，他们打算利用这个机会，狠狠地打击美军的气势。此时，美军部队中开始有人造谣，说美国独立战争肯定打不赢，继续作战只能是死路一条之类的话，这使得美军一时间出现了很多逃兵，短短几天之内，就短缺了3000多名民兵。看着大家垂头丧气的样子，苏利文将军再次发挥了大将的作用。他一边写信给华盛顿报告情况，一边鼓励大家振奋精神，同英军奋战到底。他相信没有法国盟军的援助，他们照样能够打赢独立战争。然而，战斗精神虽然可敬，他还是得面对现实。美军的实力实在不足以同英军抗衡，何况几天之后，英国的大批援军即将赶到，到那时，美军将会面临全军覆没的危险。面对这种情况，当务之急就是要赶紧撤退。当天晚上9点钟，苏利文将军命令全军拔营撤退。在骑兵的掩护下，部队从两条路撤退。敌军直到天亮才发现美军撤退，于是开始追击。在撤退过程中，美军后卫部队同英军展开了英勇的战斗，虽然保证了主力部队的安全撤退，但是也牺牲了很多英勇的将士。29日，英军继续对美军阵地进行轰炸。美军不得不放弃了罗德岛。此时双方的哨所相距不过400码，美军的任何行动都有可能引起敌军的注意。苏利文将军命令士兵们修筑防御工事，表面上开起来是要同敌军决一死战，而背地里却在悄悄地撤退。当天夜里，美军借着火光，在英军不注意的情况下，安全地渡过了海峡。
在美军登陆的时候，拉斐特爵士从波士顿赶了回来。他向大家叙述了他同法军海军将领德斯坦伯爵会面的情况，德斯坦坦言自己兵力不足，无法继续给美军提供支援，同时他做出保证，一旦自己的兵力得到加强，他一定积极配合美军作战。在拉斐特爵士的指挥下，美军顺利地渡过了海峡，没有受到敌军的阻拦。敌军将要入侵怀俄明山谷的消息很快就传遍了整个地区，这引起了当地山民的恐慌。该地原有的部队已经被撤走了，为了保卫家园，不少人加入了志愿军团。他们将自己称为正规军。巴特勒上校率领的一支部队将怀俄明山谷烧成了一片废墟，农庄被烧毁，财产被洗劫一空，耕田的农夫也未幸免于难。面对这种情形，大家一致决定要靠自己的双手保卫自己的家园。泽布伦上校率领民兵配合华盛顿派来的一支援军埋伏在怀俄明河附近，等待敌军到来，他们便发起了进攻。泽布伦上校率兵埋伏在右侧，丹尼森率领的民兵埋伏在左侧。待敌军靠近时，两支部队同时发起了猛烈的进攻，敌军被打得猝不及防，连连败退。但就在此时，敌军右翼的印第安人冲进了沼泽地，牵制了美军左翼。丹尼森上校为了改变自己所处的不利位置，迅速下令后退。但许多士兵误以为指挥官下令撤退，结果转眼之间，左翼部队被打散了。打退了左翼部队，印第安人又赶来攻打右翼部队，在混战中，美军大部分被杀死，小部分逃走，还有一部分被俘虏。富饶的怀俄明山谷被彻底毁坏了。
与此同时，阿布思诺特将军率领一支舰队赶到了哈德逊，这使得亨利·克林顿将军的兵力得到了大大的增强。虽然兵力以及武器装备上都得到了加强，但是克林顿将军对攻打哈德逊河依然没有十足的把握。华盛顿在西点加强了驻防，彻底扭转了美军的不利局势。眼看攻打哈德逊无望，亨利·克林顿打算转战南方，以占领南方其他地方来弥补在哈德逊河流域的失利。由于南征需要大量的兵力，他在筹备期间同时加强了纽约岛和布鲁克林的驻防。在这个关头，他收到了法军海军将领德斯坦伯爵率军抵达哈德逊河的消息，看来美法打算再次联手攻打纽约了。为了做好充足的准备，华盛顿召集中西部各州的长官开了一次会议，同他们商量了筹备物资以及召集民兵等事宜。为了保存实力，亨利·克林顿再次改变了作战计划。他打算放弃罗德岛，并将罗德岛的士兵以及战略物资全部撤到纽约州，集中所有的实力来加强纽约州的驻防。华盛顿收到情报，情报说西班牙也打算联合法军对抗英国，这个消息让美军再次充满了信心。同时华盛顿还收到拉斐特侯爵的信，侯爵在信中说明了自己目前的情况，他被任命为法国军队的指挥官，目前一切都非常顺利。华盛顿回信对他被提升为指挥官表示祝贺，同时对他表示了感谢。正是由于他的努力，美国才能够争取更多的国际支持，美国人民才能够更加有信心地对抗英国。与此同时，华盛顿还在信中表达了他个人对拉斐特侯爵的敬意，并祝福二人的友谊能够地久天长。
虽然德斯坦伯爵率领舰队抵达了哈德逊，但是美法联合攻打纽约的计划再次落了空。德斯坦伯爵打算联合南方指挥官林肯将军攻打萨凡纳，该地于去年被英军占领。美法联军包围了萨凡纳，连续三周以来，对英军进行了连番的轰炸。眼看轰炸无效，林肯将军决定同德斯坦伯爵对英军进行突袭。此番的进攻虽然勇猛，但是也没有取得实质性的进展。美法联军在进攻中被击溃，法军死的死，逃的逃，狼狈不堪。此次战斗美军共损失兵力400人，而法军则超过了600人。德斯坦伯爵自己也在战斗中受了重伤。相比之下，英军的损失要小得多。战斗结束之后，美军的民兵被遣散回家，而法军则起锚回国了。剩余的美军渡过萨凡纳河撤退到南卡罗莱纳。这次战役之后，美法之间的合作彻底地结束了。没过多久，纽约和马萨诸塞州的民兵被解散，华盛顿也只好改变了他原来的作战计划。他将部队一分为二，一支由西斯将军率领驻守在西点，另一支则由他自己亲自率领驻守在莫里斯顿。骑兵队伍被派往康涅狄格州。而亨利·克林顿将军此时正在纽约招兵买马，打算发起新一轮的进攻。为了防止英军进攻华盛顿亚和卡罗莱纳，华盛顿分别向这两个州派遣了重兵增援。他将南方的大部分兵力都调往这两个地方，他的远见卓识得到了大陆会议的肯定。与此同时，北卡罗莱纳军队和弗吉尼亚军队分别于11月份和12月份向查尔斯顿进军。敌军方面尽管已经做好了充分的准备，但是接连两个月来，他们都没有发动一场进攻。为了防止敌军偷袭，华盛顿做好了最周密的安排。亨利·克林顿将军一直担心德斯坦伯爵在萨凡纳战役撤退之后会重新会合华盛顿的军队攻打纽约，然而等了许久才知道法军舰队已经回国了。这让他一直悬着的心终于放了下来。眼看来自法军的威胁已经消除，他现在准备抓紧时间实施他的作战计划了。他打算亲率几千名精锐士兵搭乘5艘军舰向查尔斯顿进发。拜伦上将刚刚离开，亨利爵士便率领海军出发了。这支舰队于11月3日起航，目标是圣卢西亚。另一支则由坎贝尔中校率领于11月底与海德·帕克尔率领的舰队向乔治亚进军。英国内阁决定将战火从东部延伸至南方各州，于是普雷沃斯将军的部队已经开始向萨凡纳河两岸进发。美军在当地驻守的只有600多名正规军以及少量民兵，罗伯特·豪勋爵在这年夏天抵达佛罗里达，后来由于受到疾病困扰不得不从该地撤出。12月29日，坎贝尔中校率领的部队在距离佛罗里达3英里处登陆。由于当地河网密布，到处都是沼泽地，坎贝尔中校于是率领部下沿着一条两旁都是沟渠的小道前进，并迅速击溃了当地的一支守卫部队。当坎贝尔中校入侵乔治亚的时候，亨利爵士命令普雷沃斯从侧翼开始发动进攻。他先占领了桑伯里要塞，再率军朝萨凡纳河进军，截止到1779年月中旬，整个乔治亚州沦陷。