在李靖走了之后，李二帝下就就开口对太极殿中的大臣问道：“如今药师兄去了前线，而兵部不能无人主事，你们认为谁是合适的人选，”在李二帝下的心中，魏叔琬自然是合适的人选，不过魏叔琬的年纪不大，不能担任兵部尚书，但要是在让魏叔琬去主持兵部事物的话，户部的事物就全压在刘政会身上，如今户部的事物也非常繁忙，让魏叔琬长时间在兵部的话，恐怕会耽误事情，所以就询问手下大臣的意见，看看还有没有合适的人选。
在李二帝下的话语刚落，长孙无忌就开口说道：“启禀帝下，老臣以为可以让太子殿下负责署理兵部事物，毕竟太子身为储君，应该对朝中事物多点了解”，由于长孙顺德在白龙关大败，导致太子一系在军中的力量损失不小，而长孙顺德即是长孙无忌的族叔，又是太子李承乾的主持者，如果李承乾署理兵部事物的话，那么就可以为长孙顺德开脱一下，也可以借此机会在军中安排一些心腹。
李二帝下听到长孙无忌的话，心中倒是一动，毕竟此前李二帝下打算再多加锻炼一下李承乾，而去署理兵部事物又是一个不错的机会，兵部的事情十分复杂，需要耗费的心思也多，如此既可以让李承乾得到些锻炼，还可以接触一些军中事物，以后对于兵事不至于一无所知。
听到长孙无忌的话语后，魏徵就开口反驳说：“长孙尚书此言差矣，兵事何等至关重要，何况如今正在与薛延陀部大战，几十万将士在前线浴血奋战，太子殿下从未接触过兵事，如何能在此时署理兵部，若因此耽误了兵事，如何是好，还有如果太子负责治理黄河，事务本就繁忙，恐怕更是无法分身”。
李二帝下听到魏徵的话语后，觉得会有道理，马上就把锻炼李承乾的心思放下，毕竟魏徵说的没错，此时正与薛延陀部大战，而且战事的规模不小，稍有差错就会耽误大事，而且在李二帝下的看来，锻炼李承乾有的是机会，也不急在这一时，于是开口说道：“太子从未接触过兵事，却不适合在此时署理兵部，众卿还有什么合适的人选”。
长孙无忌非常了解李二帝下的心思，从李二帝下的细微表情就知道想让李承乾署理兵部的事情不能实现，心中对于魏徵就有些记恨，可还是不能让兵部事物落到别人的手中，毕竟长孙顺德的兵败对于太子影响不小，而长孙无忌此时又是太子最大的支持者，绝对不会袖手旁观，于是又马上开口说道：“臣这里还有一个合适的人选，就是潞国公侯君集，此时侯君集正在长安城中，正适合署理兵部”。
魏徵听到长孙无忌的话语后，又开口说道：“长孙尚书难道不知道，侯君集身受重伤，如今还在家中休养，如何能够主持兵部事物，”心中倒是有些奇怪，长孙无忌今日举荐的人都不合适啊，不像这只老狐狸的风格，不过魏徵本来就是建议大夫，本身就是专门找茬的，所以他的反对倒是正常。
这时长孙无忌有些恼怒了，对着魏徵说道：“那魏大夫认为由谁来负责兵部事物，总不能让你儿子去吧，你要知道，你儿子年级不大，如何担任兵部尚书，而且户部如今的事物也不少，总不能全让刘尚书一个人忙碌”，长孙无忌此时由于关心则乱，说话就有些冲动，毕竟长孙顺德是他的族叔，两人又都支持太子，关系很不错。
这时房玄龄突然开口说道：“帝下，臣以为可以让侯君集担任兵部尚书，由于侯君集伤势未好，就让他在府内养伤，现在可以让魏叔琬署理兵部事物，等到侯君集伤好之后，在去兵部任职”，房玄龄本不想开口，可看到二人争执不下，说的还都有些道理，于是便开口打个圆场。
李二帝下听到房玄龄的话语后，觉得倒是非常合适，毕竟侯君集的伤势在将养些时日也就好的差不多了，过段时间就可以去兵部任职，而且在李二帝下心中，侯君集也确实是个合适的人员，不但是跟随自己多年的老臣子，而且本事也不差，足可担任兵部尚书，于是就开口说道：“玄龄所言有理，那事情就这样定了，先让魏叔琬署理兵部，等到侯君集伤好之后，二人在交接兵部事物。”
李二帝下有了决定之后，长孙无忌和魏徵就不在争论了，而且魏徵认为房玄龄的主意不错，让魏叔琬短时间的负责兵部事物非常合适，魏徵倒不是有什么私心，之所以反对长孙无忌的意见就是他刚刚说的原因，毕竟以魏徵的正直，根本不会为自己儿子谋私利，不然魏叔琬的几个兄弟也不会到现在还是不入流的小官。
魏叔琬在一旁听着长孙无忌和父亲魏徵的争论，就猜到事情可能会落到自己头上，毕竟自己此前曾经署理过兵部事宜，而且干的还不错，不过没想到房玄龄会出这么个主意，这倒是非常的合适，对于长孙无忌举荐兵部尚书的心思，魏叔琬倒是猜到了一些，不过这样也好，侯君集成兵部尚书，自己在兵部的时间应该用不了多久，等到李二帝下开口让自己署理兵部后，便欣然受命。
事情都定下以后，李二帝下就散了会议，让众人离开，毕竟这里的都是朝廷重臣，每天都有不少的公务需要处理，魏叔琬现在署理兵部事物，便直接来到了兵部，由于此前曾经担任过兵部侍郎，所以对于兵部的人员和事物很是熟悉，于是很快就开始观看最近来往的公文。
现在兵部最重要的事无非就是凉州战事了，至于北方颉利故地的战争，在李勣的负责下，形式倒是一片大好，魏叔琬只要保证大军的粮草器械，和各种后勤事宜就好，其余的像是将领的任命，人马的调动，兵部都有一套程序，也都有官员负责，不出什么大事情的话，是不需要魏叔琬操心的，于是魏叔琬便开始查阅凉州来往的公文，想要了解一下战事，可这些根本看不出什么来，看来一切都要等李靖到了凉州，才能给朝廷发来具体的情况。