十三年战争指波兰同条顿骑士团为争夺波莫瑞东部而进行的战争。条顿骑士团在格伦瓦尔德战役中的失败，对于1440年普鲁士联盟的建立起了促进作用。该联盟联合了敌视骑士团的各城市、普鲁士和波莫瑞骑士阶层中的下层骑士。联盟拒不向骑士团称臣，并于1454年2月4日举兵反对骑士团，从其统治下解放了格但斯克、托伦、埃尔布拉格、克鲁列韦茨等城市和要塞。
波兰国王卡西米尔四世宣布将骑士团的领地并入本国版图。波兰小贵族阶级民军进驻骑士团领地，但1454年9月在霍伊尼策附近遭到失败。条顿骑士团趁波兰国王财政困难之际，得到了勃兰登堡和德意志其他公国以及丹麦的支持，这些国家都不希望波兰在波罗的海沿岸得势，战争遂连年不断。
1462年，杜宁所率波军在扎尔诺夫策城下之战中获胜，战争从此出现转机，后以缔结托伦和约而告终。
根据和约规定，波兰收回了绝大部分领土并获得波罗的海出海口，这对其经济发展起了很大作用；条顿骑士团臣服于波兰。经过13的年战争，波兰的军事组织发生了变化，由训练较差、纪律不强的骑士组成的波兰小贵族阶级民军在军事上的作用下降了，常备雇佣军开始在战斗行动中起主要作用。