一众五人在树莲的带领下，来到水脉市一条著名的小吃街上。
大家在享用这条小吃街上各式各样美食的时候，似乎有什么惊人的发现的小航和小萤二人，都是瞪大了眼睛。
小红顺着他们目光的方向望过去，只见到一个身披灰色斗篷，满脸胡茬的大叔。但此时还是觉得波澜不惊的小红，在听见小航和小萤二人呼出来的名字以后，却是感到吓了一大跳。
藤原？这个名字不就是水脉市道馆首领的名字吗？
眼前外貌如此不起眼吃着小吃的大叔，居然会是水脉市的道馆首领，这让小红顿时感觉自己有些”有眼无珠“
连忙上去热情问候一番，然后小红和他聊起了预约道馆战的事情。
也就在这时，水脉市的天空顶部忽然出现一个巨大的时钟模样“虫洞“，一只周身像是带有金属部分，身上有数道浅蓝色条纹，外形像是深蓝色蜥脚下目恐龙的神秘宝可梦从大时钟里掉落下来。这只宝可梦的头上，有着突起的方锥形顶部。它身体淡蓝色的条纹，从锥尖延一直伸到身体的脖颈位置。头上往两侧位置生长有两根金属色的角，往下眼神到嘴的两边。一双眼睛几乎看不到巩膜，有红色的虹膜，瞳孔为黑色。它的鼻部左右各有三道黑色条纹，鼻梁和角一样同为金属的颜色。金属色的的下嘴唇上，长着两颗白色的尖锐锥形牙齿，它没有上嘴唇。它身上的胸前的金属部分，就像一副天生的胸甲一样，铠甲的中心位置，镶着一颗钴蓝色的五边形钻石。它的脖颈上，有银白色的三个棘状突起刺，背上是鱼鳞状有五根尖刺的结构。生长一条尾巴，长有四足，每只脚上面，都有三个金属的利爪，背上银白色的翼状结构，和珊瑚有几分相像。
赶忙拿出宝可梦图鉴确认这只神秘来者身份的小红，却是得到一个惊人的消息。
“帝牙卢卡，当帝牙卢卡的心脏跳动时，时间就会流逝。是神奥地区的传说宝可梦。”
掌握时间的神，小红和大家都是没有想到，居然会出现这里。
“哈哈！我们又是见面了，小鬼！”
水脉市小吃街人山人海的潮流中，一个男子忽然大笑着朝小红等人走来。看见他手握亮起光泽的金刚宝玉，丧心病狂放声大笑的样子，小红立马认出了他的身份。他就是曾经在214号道路，自己和小航，小萤还有小雪，一同全力奋战过的时空团首领——苍日。
“你这个家伙！我这就把你抓到君莎小姐那里去绳之以法。”
望着来势汹汹的苍日，小航内心忐忑的发声。
“这可能吗？这并不现实！孩子，你们曾经见过白金白玉的功效，那么自然不难猜出我手中金刚宝玉的效果才是！”
说着，苍日刻意把手中闪着光的白金宝玉，举的更高几分，好像是生怕小航他们没有看到一样。
“感受绝望吧！曾经阻止过我的四名训练家！”
苍日用愤恨的声音宣言过，然后只见他手中金刚宝玉的光芒更甚。下一秒，这个世界的时间，都是仿佛有了确切的形体。藤原在身体失去移动能力前，感应到了危机，在最终时刻，把水雷徽章递到小红的手里。
摸摸眼前藤原停止动弹的身体，肌肤的质感还在。但他一直都是那副凝重的表情，让小红不禁觉得，他的时间，永远的定格住了。
“首先是水脉市，接着就是长寿市，我会让你们最终成为，这个世界的孤独者，永恒忏悔自己曾经犯下的过错！”
抛下这么一句话，苍日也没有和小红一行人再做纠缠的打算，打开宝可梦球放出自己的化石翼龙，和帝牙卢卡一起，离开了这里。
这个世界的孤独者？意思是要让这个世界，仅剩下我们几个人的时间流淌吗？
苍日的做法，不可谓不狠，仗着自己有帝牙卢卡相助，小红他们无法反抗他，想要折磨他们的一生。
“接下来怎么办？”
“……回长寿市。”
老实说他们谁也没有把握，大家再次聚集在一起，就能够阻止有帝牙卢卡相助的苍日。但小红在沉默了一会，做好了心理准备后，还是给出了小萤，小航最想听见的答案。
“怕什么？我们还有关东地区三只传说鸟宝可梦相助呢！”
反正不管是死是活，大家都得回长寿市一趟，尽可能阻止苍日的阴谋。所以小航故作轻松的样子，安慰大家。
“你们说的，是这三个家伙吗？”
昔日的“老友”，时空团三干部。艾拉，玛莎，泰利，在苍日离去后，出现在水脉市。
“现在就让你们见识一下科学的结晶，洗脑的力量！”
烈焰，雷霆，寒冰。三种不同的攻击霎时朝小红等人袭来，望着过去的好朋友，如今居然变成敌人，大家或多或少在一开始，都有些不相信。
四人一起拿出宝可梦迎击三只传说宝可梦无可披靡的攻势，在一阵爆炸产生的烟雾，小红等人溜离了此地。
“可恶！居然让他们给跑了，不能让他们再打扰老大的计划了，就像这三只鸟在让我们捕获洗脑前，拼死让由克希逃走那样。”
在苍日离开后，出手攻击小红等人，完全是时空团三干部自发的想法。他们觉得在老大的计划面前，不能留下任何的隐患。
最终在长寿市守株待兔的时空团三干部，果不其然等到了其实内心很不想遇到，想着干脆他们放弃就好的小红一行人。
这里的空间扭曲，似乎是有意不让帝牙卢卡进去一样，把它拦在了外面。苍日因为帝牙卢卡不知为何无法通行这里，一时也是泛起了愁，和它一起待在外面想办法进去，
帝牙卢卡的时光咆哮一次又一次撼动长寿市这层不知道那里来的天然屏障，里面的住民一时都是看的人心惶惶。
小红在长寿市的宝可梦中心，把索罗亚克拿回来的时候，还顺便让七度灶博士把美纳斯和玛纽纳一起传输过来。然后和时空团三干部在长寿市碰见的四人，和他们发生了战斗。在此期间，小红和小萤交换了一只身上的宝可梦。时空团三干部自从上次在214号道路吃亏他们团结协助的亏，这次似乎有意的分隔开他们，分别在长寿市的三个地面，不留情面的大肆破坏。
小红对上艾拉，小航对上泰利，小雪和小萤对上玛莎。为了保卫长寿市，三处战场的战火开始燃烧。