周祖训为人民的教育事业，艰苦卓绝地奋斗了大半生，积累了丰富的教育经验，曾将一些独到见解、真知灼见撰写成几十篇教育论文，有十多篇先后在国家、省、市的报纸杂志上发表，引起教育专家和教育界同仁的赞许。兹将其中四篇有代表性的论文，择要介绍于后。
1931年，周祖训在中央大学教育系读三年级时，因受陶行知先生的乡村教育学说的启迪，曾深入农村调查，搜集第一手材料，并查阅大量有关资料，深入探讨当时中国教育现状和农民关系的问题，写出一万多字的《中国现代教育与农民》一文，送由上海商务印书馆出版的《教育杂志》发表，因遭上海“一·二八”事变，商务印书馆被毁，该稿亦化为灰烬。后来周祖训又重新整理出来，发表于《河南教育》杂志上。周祖训在前言中开宗明义地指出：“农民在中国占重要之地位，无论从历史方面、人口数量方面，或经济方面，均为不可否认的事实。”“在农村与教育同趋破产之时，对中国现代教育与农民之关系作一番考察，无论如何都是值得的。”
周祖训旁征博引，运用大量事实，集中论述了三个问题。第一，中国现代教育是拒农的。他把中国农民与西方资本主义国家法、美、德、英等国农民在经济地位、农田占有、实际收入、生活标准诸项作比较后，尖锐地指出：“中国农民经济能力之低实令人可惊，然则其子弟又何配进现代学校之门，尝一尝教育滋味呢？”“所以国人在现行教育制度下，虽日唱教育机会均等、普及教育之高调，而多数农民子弟，终被摈在学校门墙之外。”第二，中国现代教育是出农的。文章指出，“中国传统的教育……唯一的目的在造就统治人才或官吏”，国人对现代教育的“观念还未改变”；“一入了学校，便算是上等人……便不屑与短打的（农民）为伍”，“都跑到都市里去找工作”，“最奇怪的是学农业的学生偏也是出农”。据调查，“学农而在农界任事者31人中无1人”，“农村方面送100个子弟到学校，农村就失掉100个子弟”。第三，中国现代教育是败农的。文章指出中国农民历有热爱农村、热爱劳动、性格质朴等优点。可是，“乡间儿童到县城里入了高等小学校以后，便对于旧日乡间朴质生活已过不来，旧日的饭亦不能吃了，旧日的衣服亦不能穿了”，甚至“鄙视体力劳动”，沾染“赌博酗酒等恶习”。据调查，“在不识字之农民中，有好品格者，比在受过教育之农民中多百分之二十三”。周祖训最后一针见血地得出结论说：中国现代教育对农民之关系，是拒农、出农、败农的！论文主题之鲜明，论据之充分，论证之有力，语言之犀利，就一个大学生而言，委实难能可贵。
1933年，周祖训在中央大学毕业前夕，撰写的毕业论文《初级小学国语教科书文字分量研究》，是以当时全国初级小学普遍采用的新时代、新主义、新中华、新课程及基本五种教科书，共约20万字为材料，经过精心的分析、研究、统计、整理出来的，曾在当时的《实验教育》杂志上发表。全文计25个页码（16开纸），分量很重，学术价值很高。当时中央大学教育学院院长、教授、著名教育家艾伟，曾对此文给予很高的评价。16年后即1949年，艾伟在他撰著的中国教育心理研究丛书《阅读心理汉字问题》一书中，在第三十节“艾伟周祖训二氏之研究”里，对该文作了专门的介绍与评价。一个大学生的毕业论文，被著名教育家、导师在其撰写的学术鸿篇巨制中加以引用和评价，并在前言中表示鸣谢，其重要的学术价值是不言而喻的。
1946年9月8日，发表于《河南民国日报》上的《创设工读中学刍议》，是周祖训写的又一篇教育论文。文章直言不讳地指出：“大多数农民生活均在饥饿线下……奚暇送其子女入学校哉？”而“工读中学之设，在使学生一面读书，一面工作”，“工作所获工资，可用作求学之用，而劳动之精神与技能亦可于工作中养成”，“教育机会均等，学用配合二问题，均可迎刃而解焉。”显而易见，这篇论文关心农民教育的指导思想，与他15年前撰著的《中国现代教育与农民》的主题是一脉相承的。周祖训对中国农民子弟的教育问题是何等关心啊！接着，文章就学校组织、教学与训导、工作种类与场所、读书与时间分配、修业期限、学生选择等问题，都作了简明扼要的论述。清朝教育家颜习斋曰：“口头说出，笔下写出，不如身上做出，乃是不自欺，乃是有实得。”周祖训写《创设工读中学刍议》一文，绝非泛泛而谈，空发议论。这是他在1939年至1945年于师岗镇信阳师范学校开展生产劳动教育实践的总结与升华。
1979年周祖训被彻底平反昭雪并恢复高中校长职务后，已逾古稀之年的他，振奋精神，拼命工作。他在回顾总结连续担任25年中等学校校长实践经验的基础上，提出了“一个优秀的校长，要具备‘三个包住’的理论”。这是他在一篇总结体会的文章中提出来的。
“包住”之一，是校长每天在校工作的时间一定要“包住”师生在校工作、学习的时间。一个优秀的校长，每天到校要早于师生，离校要晚于师生，把师生每天从早到晚的一切活动，都看在眼里记在心中，及时发现问题，解决问题，使学校各项工作处于最佳状态。周祖训在25年的校长生涯中，除出差、患病之外，几乎天天如此，无一日懈怠过。
“包住”之二，是校长的学识要博大精深，校长所掌握的知识面要“包住”教师所掌握的知识面。周祖训常讲，要给学生一杯水，教师就要有一桶水、一缸水，校长要有一缸水、一池水。当然，校长也不可能是全才，问题在于要有危机感和紧迫感，对自己知识面的弱项，要敢于正视，要放下架子，虚心向学有专长的教师学习，变弱项为强项。“以其昏昏，使人昭昭”是不可能的，只有校长所掌握的知识面“包住”教师所掌握的知识面，才能更好地帮助和指导教师搞好教学。周祖训复职后，在听高二数学课时，有些地方弄不懂，他并不因为年迈而原谅自己，而是虚心向教得好的数学教师学习，很快弥补了自己的不足。
“包住”之三，是校长要用自己的心“包住”师生的心。意思是不仅要“身入”，而且要“心入”，要全身心地扑在学校工作上，把全部精力和心思都用到各项教育和教学活动中，和师生打成一片，交知心朋友，深切体谅师生的甘苦，全心全意为他们服务，千方百计调动他们的积极性，为提高教育质量鞠躬尽瘁。