凯撒打破罗马军队冬季不作战的常规，利用庞培的麻痹思想，冒着严冬凛列的寒风，开始了向希腊的跨海突袭。凯撒的船队一路平安被风吹到了塞芳尼安山脉的海岸附近。士兵们都悄悄下船登岸，船只在当夜被遣回出发的布隆狄西乌姆港，继续把其余的军团和骑兵再运送过来。
时间正在一分一分地流走，太阳已经要沉到海底去了，凯撒觉得必须迅速作决定了。
凯撒命令道：
“现在，为了行动方便，不被敌人发现，我决定将化整为零，分为三路，各自分头行动，务必于明日天亮前赶到奥利库姆城。”
此时庞培的部队，降低了沿海有一些守卫部队之外，其他部队正在赶往冬令营的路上。当庞培听到凯撒上岸的消息后，急令部队调整部署，准备固守沿海要点。凯撒通过急行军，赶往奥利库姆。守城军民很快要求投降，把城池交给凯撒。彼利斯、阿曼提亚和邻近的其他市镇、以及整个伊庇鲁斯都派使者来见凯撒，愿意听从他的命令。在招降的同时，凯撒还率军强攻下其他一些城镇。这样，凯撒通过突然袭击，收复和攻克了奥利库姆等沿海及浅近纵深的诸多城镇和要塞，使自己的登陆部队建立了一定地幅的基地，站稳了脚跟，从而使这次跨海登陆行动取得了初步的成功。
公元前48年6月6日，著名的法萨卢战役开始了。数量上的优势完全在庞培一边，他拥有47000名步兵和7000名骑兵，而凯撒只有22000名步兵和1000名骑兵。
凯撒军队一路穷追猛打庞培的军队，把他们包围起来，从背后攻击他们。在凯撒部队两面夹击下，庞培的军队支撑不住，全线溃退。
凯撒与庞培在法萨卢的决战就这样结束了。在这次战役中，凯撒损失的士兵不到200人，但却有30名百夫长，都是些很勇敢的人。庞培大约死去15000人，投降的则在24000人以上，连驻扎在要塞里充任守卫的那些营也都投降了。
当凯撒军队冲进庞培营寨时，庞培找到一匹马，扯掉自己身上的统帅服饰，带着30名骑兵随从，从后门奔出营寨，驱马一直向拉里萨奔去。他在那边也没停留，一路收集起一些正在逃跑的部下，日夜不停地奔驰。赶到海边，乘上一艘粮船。
当凯撒在亚细亚停留了几天之后，听说人们曾在塞浦路斯见到过庞培，便猜想庞培仗着自己和埃及王国有交情，一定是去了埃及。凯撒便毫不犹豫地带着军队赶向埃及的亚历山大。
凯撒一到埃及，埃及人就把庞培的人头献给凯撒。但是凯撒并没有接受这一可怕的礼物，他转过脸去，落了泪。他对这些见风使舵的家伙的鄙劣做法十分反感，并斥责了他们。
艳后情爱与埃及战火凯撒在撤军返回罗马之前在这里出现了一段难舍难分的感情纠葛，驱使他不得不插手埃及王室的权力之争，将他长时间地拖在了这里。
当时的埃及，由先王之子、不满13岁的托勒密十三世统治。先王有一女，名克娄巴特拉，聪明过人，魅力无比。克娄巴特拉虽名为女王，与其弟共同执政，可大权却掌握在监护人手中，她实际上徒具女王之名；再加上托勒密十三世与监护人沆瀣一气，滥杀无辜，克娄巴侍拉公主奈何不得他们，连自己的性命也难保，便带着心腹侍从逃出埃及，到叙利亚避难。公主在叙利亚招兵买马，欲伺机重返埃及，杀死监护重臣，使自己成为名副其实
的埃及女王。
正当克娄巴特拉忙于准备重夺王位这时，这位后来被人们称为埃及艳后、尼罗魔女的公主，听说凯撒已来到埃及，便立即与亲信商量，决定求援于凯撒，借用他的军事力量除掉国内政敌，重登王位。凯撒愉快地接受了女王的要求。当然口头上的接受是轻松的，但要真正履行自己的诺言则并不轻松。凯撒在埃及一共度过了9个月。这9个月的多数时间是在血与火的战争中度过的。
凯撒率军追击庞培，首先是从亚历山大港上岸的。上岸后凯撒的傲慢态度引起了当地群众和王室成员的不满。后来凯撒借故扣压了小国王，致使双方军队发生了冲突，于是亚历山大战事开始了。
亚历山大此时是埃及的国都。这是一个天然条件极好的港口城市。凯撒军队占据着这座城市的北部和西部及对面的法罗斯岛的部分地域，临靠大海，这使凯撒军队可以得到海上支援。双方军队一发生战事，凯撒马上命令部队构筑工事，固守待援。
与此同时，埃及人也在积极备战。他们派使者和征兵官员出去，到埃及王国各地去征兵，并运到城里大批轻矛、弩机。城里还建立起大规模的武器作坊。青壮年奴隶都被统统武装起来，由比较富裕的主人供给他们每天的伙食和饷钱。
经过一段交战，双方互有胜负。
一天，埃及人突然派使者来见凯撒，要求他放了小国王，允许国王到自己的臣民那边去。
凯撒认为他们的要求是出于真心，国王释放了，有利于停战。要是国王有反心，无非仗继续打下去。他拉着小国王的手，送别了这位差不多已经长大成人的孩子，双方分手时说了一些客气话。
埃及人得到了国王，马上又开始了激烈的反抗。他们首先决定对罗马人的一支海上运输队发动截击。当凯撒得知此事时，命令他的全部舰队都做好准备，待命出动。他把这支舰队交给副将提比略·尼禄指挥。结果，这位海上战将因无人支援而和自己那条四列桨舰一起遇难。
就在凯撒海上战局十分困难之际，一支援军来到这里，这就是佩伽蒙国王弥特里达特。这是一个家世显赫，既有丰富的战争经验，又勇敢出众的人，而且是凯撒的一个非常忠诚、非常真心实意的朋友。在亚历山大战争刚爆发时，他被派到叙利亚和西里西亚去征召援军。因为那些国家的由衷相助和他本人的辛勤努力，迅速召集起一支庞大的军队。现在他一路夺关斩将，把埃及人的阵营撕开一个大口子。一路上他利用胜利者的声威，把经过的地区统统都降服过来，让他们和凯撒结成友好关系。埃及国王见这支大军一路杀来，就派大批军队去迎战。埃及国王希望能把他顶住在尼罗河边，不让他和凯撒会合。
弥特里达特派人送信到凯撒那里，把自己的困难处境报告给他。在这困难时刻，凯撒赶来支援他。他赶在埃及国王军队前面，在他们还没攻击弥特里达特之前，把弥特里达特的那支得胜的军队安全地接到自己这边来。
取得这次胜利之后，凯撒估计如果自己突然进军，一定会引起埃及人的巨大的惊慌，于是乘胜一直推进到国王的营寨前。他在离敌人不远的地方扎下营寨。
次日，凯撒率军对离敌人营寨不远的一座小村庄发动攻击。这个小村庄里有国王筑起的一座碉堡。凯撒集中优势兵力去进攻，最终把它攻了下来。趁埃及人惊慌失措之际，乘势直接去攻击国王的营寨。国王从营寨里逃了出去，登上了一条船。可是后来他的大批部下都泅水向这只船涌来。因为人太多，那条船终于沉没，国王和许多士兵一起被淹死。
战争结束的如此迅速，使罗马人都感到突然。凯撒因为这次巨大的胜利而充满信心。公元前47年3月27日，也就是战争结束的当天晚上，他带着骑兵，由最近的陆路亘奔亚历山大。亚历山大广大居民全都抛掉武器，放弃防御工事，向凯撒投降，凯撒接受了他们的投降，还安慰了他们。然后他穿过敌人的防御工事，在部下们的热烈祝贺声中，来到城市的原来属于他控制的那部分街区，罗马官兵们欣喜若狂，难以言表。
掌握了亚历山大，就象征着征服了整个埃及。凯撒仍旧把老托勒密写在遗嘱上的要求继续付诸实施，把老国王的继承人安排到王位上去。
克娄巴特拉终于如愿以偿，加冕登基，成为真正的埃及女王。克娄巴特拉女王复位的第一件事，就是提出陪凯撒逆尼罗河而上，视察全埃及，其实就是游山玩水，共享爱情的欢乐。凯撒因为迷恋克娄巴特拉，欣然答应。凯撒和克娄巴特拉整天厮守在一起，说不尽的温柔爱意，道不完的风流情韵。
遇刺身亡
凯撒于公元前45年9月回到罗马，他的到来在罗马城内引起了空前的反响。拥护凯撒的人全身升腾起崇拜的狂热情绪，而反对凯撒的人，却被一种深深的恐惧所笼罩。此时的凯撒，从军事上粉碎了自己的敌对势力，已经没有什么太大的顾虑了。他现在已不是一个青年人，而是一个57岁的知天命的政治家了。他自信完全能够左右罗马政坛。
公元前44年底，凯撒第五次成了独裁官，这次与以往不同的是，他是终身独裁官。与此同时他还当选了为期10年的执政官。他的地位看来是没有争议了，元老院明令授予他的新的荣誉已经不单是能与国王身分相比，而且等于是公开的神化了。
正当对凯撒想当国王的传说甚嚣尘上的时候，维护传统民主政体的派别正在加强活动，并不断扩大自己的力量。反凯撒的力量核心是原来的旧元老势力，他们仍然占据着大量的土地，是罗马政治、经济上旧体制的代表者。反对派的势力自知直接与凯撒硬拼肯定不是他的对手，于是，他们决定采用最卑鄙的手法——谋杀。这种做法成功的可能性很大，因为凯撒的一些亲密朋友和过去的部下已经倒向反对派，凯撒对此还蒙在鼓里。这些人随时可以接近凯撒，给行刺带来很大方便。
阴谋者选定3月15日在庞培议事堂召开元老院的会议（因为这一议事堂是庞培倡导修建的，因而以庞培的名字命名），作为执行他们计划的日期和地点。
会议进行当中，一个阴谋者上前向凯撒请求一件事情，他用双手抓住凯撒的外袍，这是动手的信号，第一个凶手冲上前去向凯撒刺了一刀，凯撒高叫：
“坏蛋，你干什么！”
凶手赶紧招手喊：
“兄弟们，来帮忙啊！”
预先商量好的阴谋者一拥而上，．抽刀向凯撒刺去。当凯撒拼命抵抗时，他看到他的亲信也向他杀来，他知道完了，停止了抵抗，悲哀地说：
“还有你，我的孩子！”
凯撒身中21刀，倒在了血泊中，这个不可一世的独裁者，就这样结束了他的一生。凯撒是古罗马一位伟大的人物，他年轻时就想登上权力的顶峰，这个愿望终于实现了，他也为此献出了生命。