和鄂尔勒克死后，他的儿子书库尔岱青成为土尔扈特部的首领。土尔扈特部来到伏尔加河后，实行的是分散的游牧经济。经济的分散导致了政权的分散，特别是面对俄罗斯那样一个虎视眈眈的国家，政权、经济的分散会很容易被灭亡。书库尔岱青审时度势，他清楚而又谨慎地看到局势发展的危险性，认为集中政权才是唯一的生路。
书库尔岱青在内部巩固自己的势力，排除了一切不拥护他的台吉，对那些不支持他的政策和策略的台吉，不给分配游牧地或取消游牧地。书库尔岱青十分清楚在笃信藏传佛教的游牧民族中，取得西藏喇嘛在神权上对他最高统治权力承认的重要性。这样，书库尔岱青在1646年去了西藏，得到了西藏喇嘛对他汗权的认可。书库尔岱青建立起了一支强大的军队，由相应的兀鲁思行政长官札固尔齐领导，部落的常备军骑兵也发展到约八万人。
到17世纪60年代，随着书库尔岱青权力的集中，又建立起了一个以土尔扈特部落为中心的游牧民族的封建汗国。权力的集中与汗国的形成，使书库尔岱青成为土尔扈特汗国最高的统治者。根据俄国使臣戈罗霍夫1660年出访土尔扈特汗国时写道：“在书库尔岱青营帐（小木房）之前设立了一个大厅，大厅里面围坐着二百多人，小木房门边，站着十五个身着花绸子和缎子男长衣的人，两个佩宝剑的人在走动。只要走进小木房，就可以看到书库尔岱青，坐在对面自己的座位上。他的座位离地一俄尺多，四周有一俄丈，铺着红地毯，一端放着枕头，座位旁边放着中国制的彩绘箱子。他的膝上盖着貂皮外套，身上穿着绿色的印花长衣，手捻念珠。就在小木房里，在他旁边，约有二十个身穿皮袄和花缎长衣的亲信、领主坐在地毯上，还有十个人站着。”这段描述是对书库尔岱青称“汗”后作为最高统治者形象的写照。
1667年，书库尔岱青去世，其第四子朋楚克继承父业，担任土尔扈特部的首领。朋楚克进一步集中权力，竭力削弱部落里的敌对势力。朋楚克执政期间采取了一系列对内对外的有力措施，使土尔扈特汗国立足于伏尔加河流域。经过和鄂尔勒克祖孙三代生生不息的奋斗，终于建立起了一个独立自主的汗国。
1670年朋楚克去世，汗权交给了长子阿玉奇。阿玉奇生于1642年，卒于1724年，执政54年。他继位后，着手团结内部各种势力，统一分裂的汗国。由于他卓越的政治才能和领导才能，土尔扈特部获得了极大的发展，进入了前所未有的鼎盛时期。
阿玉奇汗执政初期，正值土尔扈特部蒙古初步建立政权时期。虽然经过先辈们的艰苦创业，土尔扈特部占据了水草丰美的伏尔加河下游大草原地区，但是汗国的内外局势仍然是险象环生。汗国内部由于和硕特部阿巴赖台吉迁牧于雅依克河畔，造成了汗国分裂割据的局面。在汗国外部，还时时受到沙皇俄国的威胁。阿玉奇登上汗位后，针对汗国面临的内外交困的局面，采取了一系列强有力的措施，维护了汗国的统一，反击了沙俄的威胁。
当时在汗国内部对阿玉奇威胁最大的是和硕特部阿巴赖的势力。阿巴赖是和硕特部落的台吉，是和硕特部落首领鄂齐尔图车臣汗的异母兄弟。阿巴赖性情暴躁，与兄弟们长期不和，由于认为分配父亲拜巴嘎斯的遗产不均，多年来心怀怨恨，终于爆发了武装冲突，双方各有三万军队在喀敏河对峙。鄂齐尔图车臣汗有准噶尔首领僧格与辉特部首领索尔多支持，而阿巴赖则有和硕特部昆都伦乌巴什儿子们的支援，因而这场和硕特内部的矛盾扩展为卫拉特各部的混战，战争的结果是阿巴赖惨败。他只好率部众投到昆都伦乌巴什叔父所在的雅依克左岸一带放牧。阿巴赖一到雅依克河流域，就占领周围部落的游牧地，又洗劫了杜尔伯特部达赖的牧地，并与土尔扈特汗国开战，占领了汗国的兀鲁思。
同时土尔扈特部内部也发生了内讧，两个对阿玉奇不服气的台吉即阿玉奇的堂弟杜加尔和勒克也进行了分裂活动，他们于1670年先后脱离阿玉奇。阿玉奇对杜加尔和勒克采取了隐忍的态度，反复说服劝导他们，力争和他们团结一致。1672年阿玉奇和兄弟们联合起来与阿巴赖决战。阿玉奇采取果断措施，英勇出击，打败了阿巴赖并俘虏了他，收回了他夺去的牧地，并把他的兀鲁思归属于“汗”。
阿玉奇战胜了阿巴赖后，1673年又着手对汗国的分裂势力发动统一战争。阿玉奇采取主动攻势，一举击败了杜加尔和勒克分裂势力，将杜加尔和勒克的兀鲁思归属于“汗”。
阿玉奇卓越的政治才能、高超的战略战术和武功战绩，使他成为当时闻名遐迩的游牧民族领袖。在他执政后的短短几年中，就控制了土尔扈特汗国在伏尔加河流域所有的卫拉特诸部的兀鲁思。在他执政时期，土尔扈特汗国不仅颇具军事实力，而且还是坚持抵抗俄国侵略压迫的中坚力量。