黄龙三关是与惟信见山三阶段同样闻名禅林的公案。黄龙室中常问僧：“人人尽有生缘，上座生缘在何处？”正当问答交锋，又伸手说：“我手何似佛手？”又问诸方参请宗师所得，垂脚说：“我脚何似驴脚？”这样共三十余年，参学者没有人能够契会他的意旨。即使有所酬对，黄龙也从来不置可否，禅林目之为黄龙三关。禅宗所谓破三关，乃指破初关、破重关、破牢关。参禅者一般都要经过破三关的阶段。禅宗开悟的三个阶段，即是本参（初关）、重关、末后关。由参话题引出无漏慧（远离一切烦恼错误的纯真无垢之智慧），由无漏慧，明本心，见本性，名为初关。既见本心，用无漏慧对治烦恼，使烦恼调伏而不起现行，才是重关。但烦恼的调伏，还需要种种对治功用，要到烦恼完全消除，任运无功用时，才是透过末后一关。
黄龙三关，壁立万仞，所以三十年来很少有人能过此关。黄龙自己吟颂三关的诗偈，为参悟黄龙三关透露了一线灵光。
其一，破初关。黄龙诗云：
生缘有语人皆识，水母何曾离得虾？
但见日头东畔上，谁能更吃赵州茶？
破初关时，是破本参第一关，是一切皆空的景象。黄龙三转语中，“生缘”为初关，表层意义是每个人对自己的出身、经历都很熟悉，但禅宗所说“生缘”的深层意义，却不是指上述意义上的“生缘”，而是指生命的根本来处，即“本来面目”，所谓“人人尽有生缘，个个足方顶圆”。诗意谓没有明心见性之人，对此“生缘”难以认识，因为他们只一味倚靠别人的言论，而没有自己的见解，如同水母借虾为眼，所谓“人人尽有生缘处，认着依前还失路”。每个人徒然看着日出月落的景象，却不能歇却机心，去品味赵州茶，感悟生命的空明宁静，正如慧南《赵州吃茶》所叹：
相逢相问知来历，不拣亲疏便与茶。
翻忆憧憧往来者，忙忙谁辨满瓯花？
破初关时，参禅者觉悟出山河大地、十方虚空并皆消殒，此时有的只是否定性，而没有肯定性，所以仍要继续前进。
其二，破重关。黄龙诗云：
我手佛手兼举，禅人直下荐取。
不动干戈道出，当处超佛越祖。
“生缘断处伸驴脚”，过了初关便进入重关。此时，我脚驴脚不二，处于绝对的不生不灭、不来不去状态中，步步踏着无生。一即一切，一切即一，万物同体。障蔽心灵的浮云迷雾悉皆收卷，看破世间假相，杲日当空，光明澄澈，悟心如朗月高悬，辉映万里，处处纵横，头头达道，“无一物非法身”，每一物都是绝对本体的显现，既是显现法身的特定的一物，山只是山，水只是水，同时又“无一物是自己”，每一物都可以是他物，山是水，水是山。在此阶段，既有肯定性，又有区别性，物物之间，圆满交融互摄，而又各住自位，不失其本相。
其三，破牢关。黄龙诗云：
我脚驴脚并行，步步踏着无生。
会得云收日卷，方知此道纵横。
我手佛手，喻悟入性空境后，再进一步，见山河大地，色声境界都是自己本分。烦恼也好，诸佛也好，都是自性的表现形式。一切都是法身的显现，都与自己同一，我即佛，佛即我。认得物我不二，内外无殊，不需拟议就可“超佛越祖”。黄龙还作了一首总颂：
生缘断处伸驴脚，驴脚伸时佛手开。
为报五湖参学者，三关一一透将来。
按照雍正的说法，达到“前后际断”、体证到前念后念间的一段空白心地，从而感悟心性空寂为破初关；“大死大活”后，体证到一切都是真性的妙用为破重关；尽破无明，达任运现成、无修无证为踏末后关。这一说法对近三百年来的禅宗界影响颇大。但是雍正的说法也存在着不足之处，正如有的论者所指出的那样：“这三关问题，世宗只说得个‘然’，却未说得着‘所以然’，而且所说重关末关简直无可分别，尚嫌带漏逗乱统之病。”
黄龙慧南的诗偈，意为破了牢关，就能自觉本来是佛，超越一切。黄龙宗禅人指出自性的圆满自足，使学人树立起人人皆是本性佛的自信：“大丈夫大丈夫，灵光烜赫阿谁无”“人人顶门上，杲日当空。个个脚跟下，清风匝地”“人人尽握灵蛇之珠，家家尽抱荆山之璞”；自性圆满自足，人佛无二。
黄龙三关的意旨在于强调“直下荐取”，启发学人触机即悟，不死句下：“闹里何妨佛手开，拟议之前出驴脚。任是碧眼胡儿，也须路头迷却！”禅师在学人心国喧闹、拟议寻思之际，开佛手，出驴脚，斩钉截铁，孤峭万仞。对这种掣电之机，任是达摩祖师，也难以应付！克文说：“洞山门下，无佛法与人，只有一口剑。凡是来者，一一斩断，使伊性命不存，见闻俱泯，却向父母未生前与伊相见。”为了剿绝情念，黄龙禅还设置了触背关，以逼拶学人透过。祖心举拳问僧：“唤作拳头则触，不唤作拳头则背，唤作什么？”庵什以拂子示众：“唤作拂子，依前不是。不唤作拂子，特地不识。汝唤作什么？”这些触背禅机，与黄龙三关一样，都是将学人逼到理智的悬崖，促其悬崖放手，大死大活。
与见山三阶段、黄龙三关的诗禅感悟相应，黄龙宗禅诗呈现出一系列美感特质，这主要表现在以下几个方面。