动态资本结构的另一个重要发展是构建内生的动态资本结构模型，也即在动态模型中把一些影响资本结构的变量由外生变量发展为内生变量，综合考虑了各个变量之间以及各个变量与资本结构之间的相互影响。比如，Hennessy和Whited（2005）的模型把资本结构的选择、现金流分配和实际投资水平均视为内生变量，这些变量受企业所得税、个人所得税、红利分配政策、财务危机成本和权益波动成本等因素的影响，企业的投资或者融资决策都取决于企业未来的融资需求预期。Titman和Tsyplakov（2007）发展了一个企业能够动态调整资本结构和投资水平的连续时间模型，模型中企业的市场价值、投资选择和资本结构均为内生变量。企业的市场价值决定于企业的收益，而企业的收益决定于企业的投资选择和外生的产品市场价格变化；企业的投资选择内生决定于产品价格、资金存量和资本结构选择；企业的资本结构选择由税收、破产成本、股东与债权人之间利益冲突导致的代理成本和财务危机成本等内生决定。
另外，几乎所有的动态资本结构研究在构建数理模型的同时，都采用实证数据或模拟数据对模型的变量进行实证检验，并将实证检验的结果与现有的实证结论进行比较，以验证模型对现实的解释能力。事实上，动态资本结构理论模型及其实证结果也的确解释了静态平衡、优序融资和市场时机等理论所不能解释的企业融资行为。
但是，动态权衡理论尚处于发展的初期阶段，尚有许多问题需要从理论和实证上作进一步的研究。正如上一节所提到的，以静态平衡理论为代表的旧资本结构理论仅仅考虑了“外部因素”，而新资本结构理论则更多地考虑了“内部因素”。所以，动态资本结构理论的发展，除了考虑税收效应、破产成本、调整成本等外部因素之外，需要引入经济主体的利益冲突和信息不对称下的逆向选择或道德风险等内部因素，以期构建一个融平衡理论、优序融资、市场时机、宏观战略等各要素于一体的动态资本结构分析框架。
二、动态资本结构理论的内容
目前，动态资本结构理论还不成熟，与其说是“理论”不如说是“理念”，目前还没有哪一篇文献对其进行系统总结，下文就动态资本结构理念的几个“关键词”对其进行阐述。
1.目标资本结构（target capital structure）
企业的目标资本结构，类似或者等同于企业的最优资本结构。按照教科书上的定义，最优资本结构是指在适度财务风险的条件下，使预期的综合资本成本率最低，同时使企业达到预期利润或价值最大的资本结构。企业应当选取最优资本结构作为其目标资本结构。在同时考虑企业的风险条件和预期收益的情况下，企业总价值达到最大与企业综合资本成本达到最小是等价的。
之所以称“目标”资本结构而不是“最优”资本结构，是因为当前人们“习惯”于把企业可观察的实际资本结构当作其最优的资本结构，特别是在一些考察资本结构影响因素的实证研究中，“理所当然”地把企业的实际资产负债率作为其最优资产负债率。另外，“目标资本结构”的提法也给人一种“可连续变化”的感觉，而“最优资本结构”却给人一种“固定且唯一”的感觉。显然，目标资本结构的表述让人确信企业的确存在一个最优的资本结构，但企业目前的资本结构不一定就是最优的，企业也正在根据其内外因素不断地调整其实际资本结构以达到最优状态。
企业的目标资本结构同样在于负债带来的好处与成本之间的权衡，但与静态平衡理论相比，其考虑的因素更加全面，既包括了企业外部因素也包括了企业内部因素，既包括企业微观层次的因素也包括中观层次和宏观层次的因素。企业特征、公司治理、产业特性和宏观环境等各个层次因素决定的也是是企业的目标（target）资产负债率而不是企业可观测的（observed）资产负债率。Marsh（1982）曾指出，企业对融资工具的选择取决于它现有负债比率和目标负债比率之比，但目标负债比率本身是不可观测的，所以必须要考虑目标负债比率的决定因素。Heshmati（2001）进一步争论说，资本结构理论并不是来解释可以实际可观测的资本结构之间的差异，而是来解释不同企业间的最优资本结构，也称为目标资本结构之间的差异。
所以，企业实际可观测的资本结构之间的差异分为两类：一类是其目标资本结构（由企业层面、市场层面和宏观层面等多层次影响因素决定）本身就存在差异；另一类是由于市场缺陷而导致的企业实际资本结构与目标资本结构的偏离。正因为如此，在对企业实际的资本结构进行横截面分析检验时，应详细说明企业间资本结构的差异是因为它们有不同的目标资本结构，还是因为实际资本结构偏离目标资本结构造成的。
2.动态资本结构（dynamic capital structure）
资本结构是一个多变量、多层次、多因素集约而成的复合性系统，在一定时点上观察，企业的资本结构呈现出静态特征，表现为负债与权益二者之间的比例关系；从一段时期上观察，资本结构又表现为明显的动态属性。现代资本结构理论主要是从静态角度，以各种假设前提为基础，分析企业债务与权益的比例关系，认为只要企业资本总量不变，己实现的最优资本结构就应保持不变，并未考虑外界经济环境与企业自身生产经营条件的变化对资本结构的影响。
事实上，影响资本结构的诸多因素都是变量，即使资本总量不变，企业也不能以不变的资本结构应万变。动态资本结构则是企业依据获取的资金特征及时合理地调整各类资金来源的“即时结构”。由于企业资金总是处于川流不息的运动中，因此静态资本结构往往只是动态资本结构在某一时点上的体现，或者说是动态资本结构运行的结果。所以，动态资本结构理论认为企业的资本结构最终是企业财务活动的行为结果，而企业财务行为不仅受制于其所处的宏观市场制度条件，还是相关利益主体相互之间对利益、控制等要求权的权衡和博弈过程。显然，合理的资本结构应该是灵活的、富有弹性的，能够根据外部环境的变化和企业战略的需要进行适时的调整，达到运动中的“目标”。
假定衡量资本结构优劣的重要标准是企业价值（纵轴），在一个静态时点，企业价值与资产负债率的关系。又假定企业的实际负债率是A点，显然此时企业并没有处在最优资本结构状态，提高资产负债率）可以提高企业价值。企业在T1到T2年间要调整其实际资本结构到最优状态，其目标就应该向着变化了的最优负债率而不再是原来的最优负债率。若把不同时点的最优资产负债率）连接起来，就构成了最优资产负债率曲线，类似于经济学原理中的成本最低包络线。
3.资本结构调整（capital structure adjustment）
企业资本结构是企业长期以来融资行为的结果，向目标资本结构的调整也是一个长期渐进的过程。企业融资行为不仅受制于其所处的宏观市场制度条件，还是相关利益主体相互之间对利益、控制等要求权的权衡和博弈过程；另外，由于交易成本、不对称信息和监督补偿等市场缺陷因素的存在，使得资本结构的调整存在一定的成本，这些存在的复杂要素加入到资本结构决策中，使得企业资本结构的调整变得复杂起来。