南斯拉夫位于巴尔干半岛，战略位置十分重要。其国内情况和周边情况又极为复杂。1990年，南斯拉夫实行多党制地方选举后，克罗地亚政权被民族主义政党控制，而塞尔维亚共和国仍由共产党（后改为社会党）人掌权。克罗地亚新政权采取了一系列措施，使境内塞族人感到不安。1991年初，克罗地亚当局突然收缴塞族聚居区警察（大多为塞族人）的武器。3月，双方正式发生武装冲突，而且愈演愈烈。
1991年6月25日，南斯拉夫斯洛文尼亚和克罗地亚两共和国单方面宣布独立。斯洛文尼亚武装力量与南人民军发生武装冲突。经欧共体调停，双方于7月7日达成停火协议，武装冲突暂告平息。不久，克罗地亚当局同境内的塞族流血冲突再起。
斯、克两共和国宣布独立后，另有一些共和国相继宣布独立，二战后重建的南斯拉夫联邦制国家已逐渐解体。1991年7月7日，斯、克两共和国虽然同意推迟“独立”，但并未放慢独立步伐。10月8日，两共和国正式宣告独立。随后，波黑共和国和马其顿宣布独立。这样，南斯拉夫6个共和国中有4个宣布独立了。
在波黑436万人口中，穆斯林族占43.7％，塞尔维亚族占31.4％，克罗地亚族占17.3％。波黑穆斯林族和克罗地亚族领导人1992年2月29日至3月1日就是否赞成波黑为独立主权国家进行全民公决。这一公决遭到塞族人的坚决抵制。
3月1日，投票结果公布，有过半数的波黑公民赞成波黑为“独立的主权国家”。夜间，武装的塞尔维亚平民在萨拉热窝附近的公路上设置路障，武装冲突由此开始。
正当战火在波黑境内蔓延之际，欧共体国家和美国却分别宣布承认波黑为独立主权国家，使波黑内战骤然升级。随即波黑塞尔维亚共和国宣布为独立国家。穆斯林族、克罗地亚族同塞尔维亚族为争夺地盘爆发了内战。
旷日持久的南斯拉夫内战造成大量人员伤亡和巨大物质损失，迫使大批难民离乡背井，给南斯拉夫人民带来灾难性的影响。内战也直接导致了南斯拉夫的分裂和瓦解，也最终导致了科索沃战争。
科索沃是南联盟塞尔维亚共和国的一个省，90%以上人口是阿尔巴尼亚族，其余是塞尔维亚族、黑山族等。由于历史原因，塞、阿两族长期不和，互不让步。从1998年2月开始，科索沃局势急剧恶化。
科索沃的民族矛盾正好被以美国为首的北约所利用。美国希望通过扩大北约的职能范围，使其成为自己独霸全球的工具。
因此，美国从一开始就积极卷入科索沃危机。1999年1月，美国以武力强迫科索沃冲突双方按照美国的方案进行谈判。南联盟拒绝了北约军队进驻科索沃的条件，谈判最终破裂。3月24日，北约以“保护人权”之名，对南联盟发动了空袭行动。
北约的空袭大致分为三个阶段。第一阶段目标集中在南联盟的防空体系、指挥和控制中心、军工厂以及在科索沃的塞族军队。3月28日，北约开始了第二阶段空袭，目标转为对南人民军地面部队和军用物资进行攻击。4月13日，对南联盟的空袭进入第三阶段，空袭范围扩大，强度增加。北约对南联盟境内的所有军事目标进行24小时不问断轰炸。
据统计，北约的轰炸造成南联盟1800多名平民丧生，6000多人受伤，近百万人沦为难民，直接经济损失达2000多亿美元。
以美国为首的北约集团，绕过联合国，对一个主权国家大打出手的做法遭到国际社会的强烈反对。迫于压力，北约不得不重新回到联合国的渠道和政治解决的道路上来。
6月10日，联合国安理会通过了由西方7国和俄罗斯提交的决议。表决之前，南联盟开始从科索沃撤军，北约宣布暂停对南的空袭。6月20日，北约正式宣布结束对南轰炸。
科索沃战争的规模虽属局部，但影响却十分深远联合国宪章和国际法准则受到了粗暴的践踏，联合国的权威大大受损。以美国为首的北约开了干涉别国内政的先例。