“克拉克先生，现在几点了？”其实没有时钟的不只是水果店，因为那个时代，在一定的时刻集合一起做事的，只有学校或教会而已。格兰萨姆镇没有工厂或公司，当然也没有火车。镇民只要日出而起、日正当中时吃午饭、日落而息就可以了。驿马车在出发前，会吹喇叭，上课或教堂开始礼拜也都鸣钟通知，所以，普通人家不必备置时钟。这种麻烦的东西，只要教会、学校和驿站置备了就行。
当时的时钟多半是沙漏时钟，克拉克药局里也有一具。沙漏时钟是将装有砂的容器上下叠置而成。沙通过两容器间的细管，从上方容器落入下方容器内。沙漏时钟的主人，每天早上，听到学校的钟声一响，就把下方容器内的砂全部倒进上方容器内。于是砂就开始流动，在下方容器的刻度上表示出时间。
牛顿仔细观察克拉克药局的沙漏时钟，发现了种种问题。他想，水漏时钟会不会比沙漏时钟好呢？沙漏时钟很难使砂流的速度维持不变。上方容器内的砂量多少，足以影响砂的流动速度。砂量多时，砂粒间相互强力挤压，影响了流入细管内的运动，同时，沙漏时钟内砂的流动，有愈来愈快的倾向，这是很大的缺点。
这一方面，水漏时钟似乎比较精确。只要尽可能开一个非常小的洞，让水一滴一滴地慢慢滴下来，上方容器中水的深浅几乎没什么影响，水的流动容易保持一定。
“我想做水漏时钟，这个箱子不用的话，能不能给我？”牛顿指着早就注意的空木箱，向克拉克夫人要。
“水漏时钟？不是沙漏时钟吗？”
“是的，原理和沙漏时钟一样。”
“你发明的吗？”
自从制作了白老鼠的磨粉车以后，他被人们认为是发明家。
“不，不是我发明的，是在您家的书里看到的，是几千年前就有的时钟。”
药局主人有许多藏书。牛顿借读的时候知道了水漏时钟的事情。
“你要做古代的时钟？”
克拉克夫人完全不懂牛顿的想法。
“可能比贵店的沙漏时钟还好也不一定。”
“哦？真的吗？”牛顿向克拉克夫人讨来了差不多有自己身高的细长木箱后，请史托丽帮忙，搬入二楼的房间，开始制作水漏时钟。
水漏时钟需要上下两个水槽。把木箱竖起来，在箱内较低的地方，做了上下重叠的两个水槽。
上槽底开一小洞，在上槽装入的水，就一滴一滴地滴入下槽中。
牛顿没有在下槽做表示水深（也就是时间）的刻度，却在下槽中放置了一块几乎盖住整个槽面的木板，下槽中积了水，木板就会往上浮升。他又在这块木板的中心，竖立了一根把手似的长木棒，把它牢牢地钉住。当木板往上浮动时，木棒也就跟着上升。牛顿是想利用这根竖立的长棒，转动钟盘上的指示针。
接着，牛顿开始着手制作数字圆盘。他在木箱外表较高的地方凿一个圆圈，然后在圆上标示刻度和数目字。他又在圆圈中心开了一个较大的洞，嵌入钉上指针的圆柱。当然在箱后面木板上的同一位置也开个洞，以便放置圆柱的后端。圆柱由前后两洞支撑住，针就在数字圆盘上指向刻度。他用手指转动，针与柱就一齐圆滑地转动了。
“这样好了。”
牛顿在即将燃尽的蜡烛旁边，竖立了一根新蜡烛，然后点上了火。在联结针与浮板上的长棒之前，凝视着数字圆盘上整齐的数目字。
牛顿在下槽浮板上直立的长棒顶头钉上铁钉，再把细绳的一端紧系于钉头上，另一端绑一块小石块，挂在钉上了针的横向圆柱上，由于石头下坠的力量，使细绳紧紧地附着圆柱，向下直了。
“已经完成了，真好！”
向窗外一望，天已微明，牛顿不知不觉熬了个通宵。
牛顿用手按着数字圆盘上的针，想要转动。
这次与刚才不同，指针很有分量，那是因细绳与横向圆柱摩擦所致。
牛顿非常满意，开心地笑了。于是躺在床上，等待教会钟响。不知不觉地沉沉入睡了。
“当当，当当……”
钟声响起，牛顿马上从床上跳下。很快地把水装入上槽中，把针指向6点。
那一天正好是星期天。牛顿随着克拉克夫妇和史托丽到教会去做礼拜。
教会中的牛顿，本就不大像个信徒，而这一天更是厉害。他不断地唱错歌词，不时地向外张望。
礼拜完毕，牛顿撇下克拉克家人，飞奔回药局的二楼。
针正指着7时24分。
“妙极了！”
对于牛顿，没有比这个时候更高兴的了。这一新设计的时钟，能正确指示时间到“分”的程度，这是沙漏时钟绝对无法办到的。
兴奋的情绪略为平静之后，可以听到微小的水滴声，那是水滴在刻划时间的声音。牛顿不禁走近时钟，凑上耳朵静听。
“牛顿先生，你怎么了？”
史托丽喘着气奔进来。
“终于完成了我的水漏时钟。你看，现在是7点29分了。”
牛顿的手指按在钟盘上，慎重地读出时刻。史托丽佩服地仰望着他的脸。
没多久，牛顿的水漏时钟就在镇内出了名。连没有必要知道时刻的人，也跑到药局的二楼来参观，史托克校长也来了。所有的人都赞叹不绝。
最有趣的是，赶集那一天，克拉克药局人潮汹涌。
来观赏白老鼠的风车和水漏时钟的附近乡下人，络绎不绝。白老鼠密尔在屋顶阁楼工作。参观者带来了玉米、小麦等饲料作为礼物，他们爬下小阁楼后就在药局买药，这一天的生意鼎盛，前所未有。
但是，牛顿的水漏时钟发生了不正常的现象。一两个月后，时钟的时间愈来愈慢了。牛顿伤了好几天的脑筋，终于找出了原因。原来是上槽槽底的小洞，积聚了水中的污垢，以致流速减弱。
牛顿做梦也没想到，这个时期的沙漏时钟和水漏时钟的研究，会在三年后被杂志公开地介绍。