九寨沟风景名胜区自正式对外开放以来，旅游影响力在国际上日益提高。为了规划、建设、管理和保护好这个世界级的风景名胜区，使一流的景区与一流的硬件设施相配套，九寨沟管理部门对整个自然保护区制订了详细的管理措施，并投巨资改造、建设了许多与之配套的游览设施和基础工程，规范了游人和工作人员在景区内的活动，多管齐下，收到了良好的效果。
（一）制定详细的景区规划
1985年10月，有关管理部门完成了对九寨沟风景名胜区的总体规划。1987年1月，该规划得到了四川省城乡建设和环境保护部门的批准。1999年，管理部门又对《九寨沟风景名胜区总体规划》进行了重新修编。2003年6月，修编后的规划正式获得四川省有关部门的审批。
该规划对整个景区在保护培育、核心景区、风景游赏、典型景观、建筑景观、游览设施、基础工程、居民社会调控、经济发展引导和土地利用协调等多方面进行了调研，确定了风景名胜区的发展目标。同时，规划还对景区范围、性质和目标，景区的分区、结构和布局，景区的容量、人口和生态原则等重要问题作了明确界定。
随后，九寨沟有关管理部门加大建设力度，不断健全旅游基础设施和旅游服务设施，已完工的有游客中心、景区栈道、生态厕所、诺日朗旅游服务接待中心工程等一批重点建设项目，还有正在施工的蓝天停车场及附属工程、景区公路整治工程等，共投入基建经费约五亿元。在改善景区交通、通讯和保护生态等方面取得了显著成绩。
（二）积极打造硬件设施
诺日朗处于九寨沟风景名胜区中心位置的三叉路口，大量的游客须在此旅游中转、休息和用餐。为此，九寨沟有关管理部门投入了大量资金修建了诺日朗旅游服务中心及附属工程，该工程总用地3.6万平方米，集景区投诉、救护、治安、消防管理、旅游纪念品销售、游客休息和餐饮于一体，高峰日要满足上万人的就餐需求，是九寨沟景区的综合性服务场所。
另外，为避免污水对环境带来的不利影响，诺日朗旅游服务接待中心产生的污水以罐装形式运至沟外牙扎污水处理站处理，达到零排放。该工程在施工的过程中，正好遇到九寨沟的冬季。当时，由于天寒地冻，现场作业面狭小，材料运输困难，因此，管理部门决定，将整个建筑全部采用轻钢结构构成主体。这样，既保护了环境又缩短了工期，不仅结构形式独特，更加符合景区环保的需要。后来，这项工程获得了全国钢结构协会颁发的金钢奖。
为了加强对景区厕所的建设与管理，九寨沟有关管理部门与森奇瑞环保产业公司合作，率先在景区内大规模引入“绿色生态旅游厕所”，并在2001年10月前拆除了景区内所有的旱厕，一年内在长海、镜海等游人较密集的地方建立了国内先进的智能型全自动免水冲环保型生态厕所。该厕所采用电子监控、自动更换保洁用袋，排泄物通过自动打包后，由专用清洁车运往景区外粪便处理场进行处理，达了景区环保的要求。
为满足要求，景区农电网建设和景区智能化管理系统建设工程于2001年开始动工。智能化建设主要针对游客、景区容量、景点设施等对生态环境的影响，通过较为先进的方法进行监测分析，以便及时调整和保护。
景区农电网工程完工以后，既能保障沟内旅游、智能化建设等的用电需求，同时也替代了影响景观的散乱电线。在整个工程中，管理部门要求，施工不能破坏景观，尤其是九寨沟景区内的地貌、植被、水体等。一旦局部地方对树木和灌木、花草有所破坏，要做到及时恢复，并严禁就地取沙和石料。
随着游客数量逐年增加，原有景区公路的路面狭窄，一些路面破损严重，九寨沟有关管理部门相继对这些路段进行了加宽和路面整治，但零星的整治已不能满足日益增长的客流量的需求，特别是黄金周，车辆拥挤，人车混杂，大大降低了车辆的运行能力，存在安全隐患。
为此，九寨沟有关管理部门又于2003年开始对整个38公里长的景区公路进行了整治，整治后的公路等级为山岭重丘区二级公路。在施工过程中，为了保护景区环境，提出了“最小程度的破坏、最大程度的恢复”，在保质量、保进度、保安全的条件下，达到“舒适、生态、精品、示范”的目标。
该公路的建成切实改善了车辆运行堵塞的状况，缓解了营运压力，并有效地减少了因车辆运行带来的尘土污染，提高了游客观赏的质量，从根本上改善了风景区的交通安全状况。
为实现人车分流，保障游客安全，减少尘埃和游人活动对海子的影响，景区架设了六十余公里的木质人行栈道，既方便了游客观景，又有效地保护了景区的生态环境。
为了彻底解决景区内环境污染问题，保持九寨沟原有古朴的村寨风貌，防止九寨沟出现缓慢城市化现象，根据总规要求，将景区内的居民经营活动外迁并拆除所有经营性房屋，拆除后的房屋空地全部建成绿化带，恢复原始地貌，创造了良好的生态环境氛围。
为了保护好九寨沟，及时进行生态监测、火情监控和打击偷猎野生动植物资源的违法分子，九寨沟有关管理部门在沟内分别修建了长海、原始森林、则渣洼、扎如四个气象观测站和日则、长海、树正、荷叶及扎如五个保护站。
此外，针对九寨沟泥石流等山地灾害的治理，1984年管理部门制定了第一次综合治理规划方案。1985至1997年先后重点治理了14条有危害的泥石流沟，修建拦挡坝工程52座，包含有拦沙坝、格栅坝、栅拦坝、缝隙坝、滤水坝和谷坊坝等。排导槽长500米，停淤工程172米，公路便桥两座以及生物措施等。通过治理，各泥石流地段的生态正在恢复正常，大大避免了地质灾害的破坏，取得了显著的生态效益。
（三）规范景区内的活动
为进一步深入贯彻“沟内游、沟外住”的指示精神，管理局首先于2002年4月31日关闭了景区内的所有家庭旅社；每年专项拨款作为景区居民的基本生活补助费。
为有效保护景区生态环境，更好地帮助居民致富并带动地方经济发展，管理局已在景区外征地，筹建专门的经营场所，即“九寨沟藏族民俗文化村”。
为保护景区内环境，对景区内乱搭乱建的摊点、铺面进行清理，2003年管理部门拆除了荷叶、树正和则查洼三个村寨全部经营性铺面和居民的经营性房屋建筑，以及职工宿舍。
管理部门还严禁在景区乱摆摊设点，清退了部分景区外的经营人员。取消了原始的森林租马、长海租牛活动，迁出了数百头用于经营的牲畜，对诺日朗商品售买区、长海、五花海、熊猫海的租衣、照相等经营活动进行了统一管理，使居民的个人经营行为逐步走上集体管理、统一经营之路。
随后，管理部门重点整治了景区的餐饮业和零售业，对下属企业和个体经营户严格管理，严禁无照经营，严禁出售假冒伪劣商品，并对景区经营户进行定期和不定期的全面检查；严禁无证兜售商品，杜绝强买强卖、拉抢游客等。这些措施使经营活动做到了明码实价、文明经商、公平交易和热情服务等。