哈尔西接到命令之后，立刻就向所罗门群岛的航空部队司令米切尔通报了山本五十六的日程安排，要求他想尽一切办法将山本五十六击毙。米切尔接到命令之后，马上召集米歇尔和兰菲尔等将官讨论行动计划，最后米切尔把任务交给了米歇尔。
会议结束之后，米歇尔回到自己的帐篷，找来自己的情报参谋麦奎甘上尉，他们一起研究截击山本五十六的路线。不久之后，瓜岛第347战斗机大队的大队长维克塞洛上校也赶来了，米歇尔指着绘制出来的航线图，对维克塞洛道：“天气预报说明天的天气是晴天无风，山本五十六从拉包尔到布干维尔岛的卡希利机场的航程大约为560公里，一式陆上攻击机巡航的时速是290公里，如果不是顶风，他就会提前5到10分钟到达，我们在他到达前10分钟飞过海岸，如果一切顺利，我们飞入布干维尔岛时就能很快发现山本五十六，我估计山本五十六的飞行高度不会超过3000米，因为以这样的高度飞行比较舒适。我断定山本将从西面飞来，正降低高度准备着陆……”
没有等米歇尔把话说完，麦奎甘就打断道：“你凭什么肯定他从西面飞来？”
米歇尔回答道：“经过近两个小时的长途飞行，飞行员肯定希望尽快着陆，这样的话，肯定选择最近的航线，那么就会从西面飞来，如果他不从西面飞来，我就到东面去搜索，如果这样还没有发现，那么就直接到机场上去寻找。”
维克塞洛听了之后，感到非常满意，称赞了一句：“好！”麦奎甘也没有提出什么反对意见，于是截击计划就这样定了下来。接着，米歇尔把计划报告给了米切尔，米切尔经过研究之后，同意了这个计划。接着米切尔把计划报告给了尼米兹，尼米兹回复道：“完全同意！”
午夜时分，米歇尔在机场上召集飞行员，为了不被发现，米歇尔挑选了18名飞行员，在宣誓保密后听取了作战计划。其中以兰菲尔等6人为攻击组，以不惜一切的代价在低空击落山本。米歇尔亲自指挥12人作为掩护组，在高空牵制日军的护航机。
4月18日凌晨，米歇尔召集飞行员，下达了出击命令。米切尔前来送行，并且向飞行员又重复了一遍：“无论付出多大的代价也必须完成任务。”
7时30分，18架飞机开始隆隆作响，一架架的飞机满载着油料和炸弹，差不多超出了飞机的负荷能力，飞行员要使用襟翼来增加升力，并且一直滑行到了跑道尽头才勉强升空。米歇尔第一个起飞，为了不被日军雷达发觉，他们保持着10米左右的超低空飞行。
而在山本五十六那边，4月18日早上，太阳刚刚出来，拉包尔机场的跑道上，停放着两架日本海军三菱一式双发陆基轰炸机，它们的马达正在轰鸣，等待着起飞升空。
山本五十六戴着白色的手套，穿着绿色的陆军制服，在联合舰队参谋长宇垣将军等八人的陪同下准备登机。山本五十六等四人登上了一号机，宇垣等五人登上了二号机。
早上6时整，两架轰炸机破空而出。跟着护航的是六架战斗机，它们分为两队，在山本五十六的左右两侧护航，一同向着东南方飞去。一个半小时后，已经飞到了布干维尔岛的西海岸，飞行员看到岛上一望无边的热带丛林，松了一口气，写下一张纸条递给了山本五十六：“可望于7时45分飞抵布因机场。”
岂料，正在这个时候，一架担任护航任务的战斗机突然偏离航线，加速前进，机上的飞行员抬手指向一侧。山本五十六座机的飞行员马上意识到情况不对，急往后看，大惊失色，原来美军的8架战斗机正疯狂扑来。
于是，六架护航机急速上升，跟米歇尔的掩护机群缠斗起来。兰菲尔的攻击组朝着两架座机发动了猛烈的攻击，两架座机见势不妙，急忙快速下降，兰菲尔攻击组紧追不放。
这个时候，担任掩护的日军战斗机发现自己上当了，于是3架战斗机冒死冲了下来。可是已经晚了，山本五十六的座机已经被击中起火了，化为一团火球坠入布干维尔岛的丛林中去了。
火焰包围着山本座机的机翼和机身，飞机快速地下落，见此情景，宇垣吓得什么话也说不出来，只是呆呆地拉着航空参谋的手，颤抖着指向坠下的飞机。这个时候，美军飞机的炮弹在宇垣的飞机旁边掠过，飞行员急忙曲折飞行，以避开敌人的炮弹。
当宇垣的飞机急转的时候，宇垣看到了从丛林中冲天而起的黑烟，不禁吓得一身冷汗。就在这个时候，又一架美军飞机攻了过来，宇垣的飞机被击中了，机上的人员负伤倒地，机尾和机翼也被打断了，飞行员极力让飞机向海面飞去，希望在海上降落，但是一不小心，飞机一头栽进了海里。最后，除了宇垣等三人获救之外，其余人全部死亡。
4月18日中午，拉包尔知晓了山本五十六遭遇袭击的消息，但山本五十六究竟是已经死了还是依然活着，大家对此并不清楚。在拉包尔把消息发到东京之后，作战参谋渡边十分着急，要求立即赶赴山本遇难的现场。可是，一方面由于天气不好，另一方面没有准备好飞机，所以最后还是拖到了第二天。
4月19日，渡边与东南方面舰队军医长大久保信一起乘坐陆基轰炸机飞往布因，当他们到达事发地点的时候已经是8时了。他们走下飞机之后，立即就奔往宇垣所在的宿舍。当宇垣见到渡边的时候，忍不住流下了眼泪，此时的宇垣仍然在发着高烧，急切地让渡边去寻找山本五十六。
于是，渡边马上乘坐水上侦察机飞往山本遇难的上空，他认为飞机坠毁的地方一定有起火燃烧的痕迹，所以应该是比较容易寻找的。这时候，渡边还期望有人活着，所以他事先准备了很多橡皮球，橡皮球里面有纸条，纸条上写着这样的话：渡边参谋来接，请向空中挥动手帕。现在他把这些橡皮球投放到了地面之上。
可是过了很长时间，地面上寂静如常，什么响动也没有。于是，渡边只好命令降低飞行高度，贴着密林飞行，以求近距离观察。可是经过多次反复搜寻，依然没有发现山本五十六的踪迹，渡边感到非常沮丧和失望。
最后，山本五十六的尸体还是被一支陆军搜寻队发现了。当他们到达飞机坠毁现场的时候，发现的是这样的情形：一架毁坏的飞机的尾翼树立着，主翼和螺旋桨已经被摔得破烂不堪了，飞机的机体在印有太阳旗略微靠前的地方折断了；在飞机的周围散落着几具尸体，其中有一个人坐在那儿，身上穿着绿色军服，胸前佩戴着绶带，手上戴着白色手套，左手握着军刀，他左手手套的食指和中指用细线缝合在了一起，肩膀上嵌有三枚金质樱花。他们从这具遗体上找到了一个笔记本，上面写着山本五十六的名字。
4月18日，对日本来说，的确是一个倒霉的日子。在1942年的4月18日这一天，日本遭受了第一次空袭。1943年的4月18日，日本最出色的海军统帅被劫杀。对于这位海军统帅的死，日本人如丧考妣，为他举行了国葬，他的骨灰被安葬在山本家族的坟茔地。山本五十六无疑是日本***的代表人物，虽然他在战前也曾预感到日本将置身于一场毫无胜利希望的战争之中，因而反对轻率地对美英开战，但在日本国内狂妄的战争叫嚣中，他仍然挖空心思，积极为日本***卖命，并通过偷袭珍珠港，亲手点燃了太平洋的战火，对亚洲各国人民犯下了滔天罪行。而他本人也因此而永远被钉在人类历史的耻辱柱上。
近年来，******有所抬头，不顾各邻国的反对，首相等政要公然参拜靖国神社，极大地伤害了曾经饱受日本****侵略的广大国家和人民的感情，引起无数人的强烈愤慨。假如日本政府不能很好地反省自身的历史，并因此影响它对自身现实的判断，那么将加剧它与亚洲许多国家之间的矛盾，成为中日关系向前发展的一大障碍。