16世纪初的佛罗伦萨人文主义气息已经相当浓厚，拉斐尔受共和政治、民主精神和人文主义思想的共同影响，开始学习达芬奇和米开朗琪罗的画作，并在摸索中逐渐形成了自己的风格，并迅速与他们齐名。拉斐尔的风格与米开朗琪罗完全不同，米开朗琪罗笔下的人物多是健硕、刚毅的，就连女性都透着男性气息，但拉斐尔笔下的人物，尤其是圣母，大多具有母性的温柔以及青春健美，体现了浓厚的人文主义思想。他绘制的大型油画《西斯廷圣母》，全画呈现了一种稳定的三角结构，分别由圣母和圣徒组成，显得庄重均衡，表现了母爱的伟大。此外，《椅上圣母子》、《阿尔巴圣母》也被人们津津乐道。
拉斐尔喜欢研究各画派大师的绘画特点，其中他最喜欢的就是达芬奇的构图技巧和米开朗琪罗的人体表现方法，最终形成了自己极具古典美同时又清秀、圆润、柔和的艺术风格，成为继达芬奇和米开朗琪罗之后的又一艺术巨匠，形成了三足鼎立之势。拉斐尔圣母形像的创作了显示出了非凡的艺术领悟力，在他创作的这些画作中较为有名的是《圣母的婚礼》、《草地上的圣母子》、《带金莺的圣母》、《花园中的圣母》、《福利尼奥的圣母》、《椅中圣母》、《西斯廷圣母》、《美丽的女园丁》、《阿尔巴圣母》等。
拉斐尔最成功的作品就是那幅《西斯廷圣母》油画，这是他为圣母歌唱的一首赞歌，而在《小椅子圣母》作品中，圣母的形象更加人性化，并且具有了异域风情。整幅画色彩绚丽，沟通完整，充分体现了拉斐尔的绘画才艺。他最有名的壁画是为梵蒂冈绘制的《雅典学派》，这幅画作汇集了古希腊的50多个著名的哲学家和思想家，其中包括柏拉图、亚里士多德、毕达哥拉斯、苏格拉底等，歌颂了人们对于真理的追求以及人类的创造力。在这幅画中，位居画面中心的是以手指指着上天的柏拉图和伸出右指指着前方的亚里土多德，在两人的两侧分别是一些著名学者，整幅画作构图紧凑，毫无凌乱之感。
《圣玛利亚的婚礼》这幅画其实是拉斐尔在模仿老师的基础上再融进了自己的独创，在构图和人物的分配上都有意模仿佩鲁基诺的《基督将天门的钥匙交给彼得》。除了具备老师优雅的风格外，他还加进了自己独特的柔美的风格。背景是一个多边形的洗礼堂，运用大量的水平线、垂直线和半圆形曲线，使整幅画刚柔相济、简洁又富于变化，此外他还加进了透视法造成空间的深邃感。在人物分配上讲究对称，代表神意志的主教主持了这场神圣的婚礼，玛利亚有诸多的求婚者，每一个人都有一根棍棒，规定谁的棍棒顶端开出鲜花就是玛利亚的未婚夫，而约瑟的棒顶开出了美丽的鲜花，这就代表了这场婚礼是神授予的，而其他求婚者因为自己没有能够成为玛利亚的未婚夫而痛苦不堪。画中的人物不论男女都清秀俊美，而且细节处理都很到位，人物的表情、衣服的褶皱都有细致的描绘，而拉斐尔对这幅画也相当满意，这也是他第一次在画作上签上自己的名字。
《圣乔治与龙》是拉斐尔故乡的乌尔宾诺公爵委托他创作的，当时英国国王亨利七世授予了公爵“嘉德勋章”，为了答谢英王，于是他委托拉斐尔绘制一幅英王守护圣乔治的小型图画，并要求他表现出圣乔治杀死毒龙的场面，而这幅画没有让公爵失望，他将圣乔治举刀欲砍毒龙的动作画得十分优雅，而且以对角线形式安排整幅画，但是美中不足的是拉斐尔过多的关注整幅画的造型，没有深入挖掘人物内心精神，使整幅画缺乏表现力度。《雅典学派》将不同时期的学者汇集到一幅画中，他们来自于不同的时代、不同的民族、操着不同的语言，可谓是古今齐聚一堂。拉斐尔将这幅画画得十分宏大，位于中心的两大哲学家是柏拉图和亚里士多德，围在两人身旁的是50多位学者、名人，他们分别代表了七种学术：语法、修辞、逻辑、数学、几何、音乐、天文，他们进行着激烈地讨论，呈现出了一派百花齐放、百家争鸣的氛围，凝聚了古代文明的智慧。拉斐尔想要通过这幅画赞颂人类对智慧的追求以及对古代文明的颂扬。柏拉图和亚里士多德在进行着激烈地讨论，一上一下的手势代表了他们不同的学术观点，而旁边的学者有的在侧耳倾听，有的跃跃欲试想要表达自己的观点。左面的一组的中心是身着长袍，打着手势在阐述自己的学术观点的苏格拉底，还有专心写作的大数学家毕达哥拉斯，其中最惹人注意的是中心台阶上躺着的一个半裸老人，他就是犬儒学派的代表，哲学家狄奥根尼，他们学派主张除了自然需要之外其他一切都是无足轻重，所以他只穿了一件可以遮体的白袍，而在索多玛的背后露出半个头的人就是拉斐尔，这说明他肯定了自己的同时也认为自己与这些先贤们还有一定的差距，所以只给自己画了半个头，这幅画是以圣彼得教堂为背景，采用对称画法和透视画法，使人物看起来像是从长长的走廊走出来，显得整幅画高大深远。在这幅画中，拉斐尔还突出了台阶的作用，将人物错落有致地安放在台阶上，这样整幅画显得非常富有层次感的同时，又不会显得很凌乱，而且直线型的廊柱与人物的神态遥相呼应，使整幅画柔中带刚，富有古典文化气息。
《椅中圣母》是拉斐尔圣母画中的又一代表作。在这幅画中，他特意突出了圣母的目光。眼睛是心灵的窗户，而透过这个窗户可以看到圣母纯洁的灵魂。据说这幅画的诞生还有一个故事，有一次拉斐尔从梵蒂冈出来，见到一位抱着婴孩的少女，这个少女长得非常像他的心上人芙纳蕾娜，而最打动他的就是她那温柔的目光，这激发了他的创作灵感，可惜没带纸笔，他拾起身边的一块木炭，环顾四周，只有一个空桶，于是他将这个空桶反过来，在桶底画下了这神圣的一刻，这就是这幅作品的来源。拉斐尔在这幅画中运用了他十分擅长的曲线塑造形象，人物的神态、衣着甚至衣服的褶皱都用长短不同的曲线表现出来，使整幅画显得丰满、圆润。而在色彩配置上，他仍按照基督教的习惯用红蓝两色作为主色调。在基督教中，红色代表着圣爱，蓝色象征着真理，所以大多数的宗教画都是用这两个颜色作为主色调的，《椅中圣母》也不例外。在这幅画中，圣母的斗篷是蓝色的，上衣为红色，怀抱中的小耶稣的衣服是黄色的，这样红黄蓝的对比强化了整幅画的华贵，使色彩饱和、艳丽。
在那个时代，主张美是永恒不灭的，要追求艺术中的理想之美，所以很多人文主义画家笔下的美都具有现实性，是一种来源于生活的美。过去拉斐尔塑造的圣母形象都是美丽、完美无缺的，而《西斯廷圣母》在原来的基础上突出了圣母的救世主的形象，为了拯救世人，她甘愿牺牲自己的儿子，这幅画完全没有矫揉造作之感，给人以朴素的感觉，拉斐尔将整幅画当做了舞台，序幕缓缓拉开，圣母站在云端上，徐徐飘来，西斯廷二世摘下桂冠虔诚地迎接圣母的到来，圣女渥瓦拉代表平民迎接圣母，她沉浸在自己的想象当中，转过头用母亲般仁爱的眼神望着圣母身边的小天使，似乎要与他们分享思想的秘密。如果追随小天使的目光会发现最终与圣母的目光交汇，圣母的庄重美丽令人动容，轻启的双唇似乎在祝福人间。
拉斐尔不仅擅长圣母像，也喜欢画人物肖像，《巴尔达萨雷伯爵像》就是他为自己的挚友巴尔达萨雷伯爵所画。在这幅画中画家不仅将伯爵的体貌特征进行了细腻的刻画，同时也运用了色彩的微妙变化，更加深入地挖掘了人物自身的沉稳、善良、充满智慧的内在气质，而且采用了正三角形的构图方法，使整幅画庄重、沉稳，与人物自身气质十分符合。
《披纱巾的少女》是拉斐尔为他的情人菲娜丽娜所画，在画中不仅描绘了姑娘的多情善良，还运用了色彩语言，将菲娜丽娜的面孔和酥胸刻画的细致入微，华贵衣裙上的褶皱同朴素的披纱形成了鲜明的对比，将肉体的温柔与美丽衬托的淋漓尽致，银灰色的衣裙、白皙的皮肤给这幅画作增添了纯洁的的旋律，失去了宗教的神秘意味，更具有了真实性。《教皇利奥十世与两位红衣主教》是教皇利奥十世即位之后，邀请拉斐尔为其作画，颂扬他的事迹，他要求拉斐尔在他的梵蒂冈的办公室作画，这就使得拉斐尔分身乏术，不得不请助理来协助自己完成这幅壁画。这幅图的大部分都是他起草后由助手完成的，他只是略加修饰而已。由于教皇身份的特殊，所以他绘制了教皇的肖像。这幅画主要人物是利奥教皇，教皇穿着猩红长袍坐在中央，两侧是两位红衣主教，他们的脸各有朝向，人物的受光范围也不一样，所以整幅画呈现出一种深邃之感。桌子上散放着书籍杂物，据说利奥教皇十分喜欢研究哲学，拉斐尔抓住了这一点，将利奥教皇思考哲学时的痛苦、疲惫的神态表现了出来。
拉斐尔不愧是“圣母的歌颂者”，他留世的画作中很大一部分是有关圣母的，《金翅雀圣母》是他圣母画作中的又一代表作。这幅画没有一丝宗教的意味，拉斐尔将耶稣和约翰化成了幼儿的形象，圣母就像凡间的母亲带着自己的两个孩子。在这幅画中，他采用了金字塔式的构图方法，这一方法他是仿效达芬奇的，这样的画法使整个画面更具有稳定感。圣母的红色上衣与紫蓝色的披风同幼儿的皮肤相称而使整个画面更加稳定。拉斐尔对色彩的纯熟运用表明他的创作已经进入了成熟期，在这幅画中难以掩盖的是他对达芬奇的模仿，也许是因为他太崇拜达芬奇的缘故。1504年，拉斐尔来到佛罗伦萨之后，他把主要精力投入到了圣母的创作当中，而这些圣母也给他带来了巨大的荣誉，以至于他的圣母画作一经展出，就会出现万人空巷的场面，大家竞相观赏他的画作，观赏者流连忘返。他笔下的圣母带有意大利女性特有的魅力，并且充满着母爱，让观赏者如沐春风。当时的意大利人赞美一个女性都会说：“就像拉斐尔笔下的圣母一样。”可见他的影响力。除了这些圣母之外，他还经常画一些圣女的形象，《圣切奇莉亚》中的切奇莉亚是一位基督教虔诚的信女，她抗拒家中为她安排的婚姻，在自己的家中建立了一个祈祷室，要保持自己终身的贞洁，她的事迹被当地人传为圣迹，在她死后，教皇将她的遗物埋在了罗马特拉斯特弗的祭坛底下，以示对她的尊敬。拉斐尔根据这个故事绘制了一幅有寓意的作品，使整幅画蒙上了一层神秘色彩，虔诚的基督教信女，受到了神的启迪，聆听到了天堂的音乐，世间一切乐器所发出的声音都不能与之相比，于是乐器散落一地，拉斐尔用他的画笔向这位虔诚的信徒表达了最高的崇敬。
拉斐尔笔下的人物无论是圣母还是教皇，无论是伯爵还是主教，他都能抓住他们的特点，用自己娴熟的画笔表现出来，而且每个人身上都具有自己不同的特点，观赏者可以从人物的衣着、神态上轻易地猜出画中人物的性格、职业。应该说拉斐尔是一个继往开来的画家，既吸取了前人的绘画特点，又有自己的一套独创绘画技巧。他是当之无愧的“圣母的赞颂者”，将圣母温柔、慈祥的气质表现得淋漓尽致，而且这些圣母各自有着自己不同的特点。虽然拉斐尔的生命很短暂，但他用自己智慧的双手为后人留下了一座宝贵的艺术宝库。