6月3日邓小平在与中央领导谈军工体制问题时指出：“我们的军工体制主要是学苏联的，多少年没变，这种体制不能发挥生产能力。搞了一些民品，应该搞，但都是一般的，没有技术提高，没有突破国民经济水平的东西。搞洗衣机、电冰箱、摩托车没有提高国民经济水平。军工体制讲了几年，不能再拖。如果不这样做，不能纳入国家计划，就是很大浪费。军工科学家最多，装备好，一年花钱最多，如何把这支力量纳入国家计划，发挥他们的力量，发挥作用。搞民品不错，但不限于搞简单商品，要统一集中搞民品，不是平行搞。军工体制问题要快解决。”
6月4—10日国际标准化组织ISO/TC20/SC4航空航天紧固件分委员会在北京召开第28届会议，北京航空综合技术研究所筹备组织会议。中国、法国、美国、英国、联邦德国、瑞典、加拿大和意大利等8国42名代表参会。
6月5日彭真委员长视察洛阳空空导弹发展中心，并指示：“要把国内外两种导弹的优点结合起来，设计出更好的空空导弹。”还为该中心题写单位名称。
6月5—8日空军、海军、民航总局、航空工业部、航天工业部、国家体委在北京共同举行东北老航校建校40周年纪念活动。
6月11日南京航空学院研制生产的AD100“旅游者”号超轻型飞机，从广州起运，销往澳大利亚。7月8—13日，在澳大利亚的布里斯班进行飞行表演。该机为鸭式气动布局，总重235千克。
6月16日—7月4日航空工业部同意大利飞机制造公司（Aeritalia）签订改装强5飞机火控系统的合同，将该公司AMX攻击机上的导航攻击系统移植到强5上。意方承担部分研制经费，取名为CI工程，对外用名为A5M（强5M）。研制阶段总投资额为2000万美元。
6月18日航空工业部高技术战略研究小组开始工作，方宝瑞任组长。高技术战略研究是国家制定中长期规划的前期工作。9月，首次高技术研讨会在京召开，确定20个论证题目。
7月1日国务院、中央军委决定，航空工业部划归国务院直接领导。5月10日邓小平听取莫文祥汇报时曾指出：“你们归国务院直接领导，就可以放开手脚大干民用产品。你们技术力量很强，设备好，应该为国民经济建设多做贡献。”
7月1日西工大等单位自行设计的中国第一代低速超临界翼型NPU-100进入工程可行性论证阶段。该翼型除有良好的巡航升阻特性和比较宽的低阻范围外，还比美国翼型GAW-1减少20%的低头力矩。
7月2日北京精密机械研究所研制成功XDM测角装置和控制网偏距测量仪。测角装置是装于卫星上，在卫星发射前对卫星姿态控制系统进行检测的专用装置；控制网偏距测量仪用于正负电子对撞机工程。
7月3日经中共中央宣传部批准，航空工业部主办的《航空时报》在北京创刊。该报是以信息类内容为主的四开四版报纸，一共出版了153期。1989年7月5日，《航空时报》与原航天工业部主办的《航天报》合并为《中国航空航天报》，由航空航天工业部主办，并向国内外公开发行，共出版338期。1993年7月起更名为《中国航空报》，它是伴随着中国航空工业总公司成立而出版的行业报。该报发挥指导性和信息性两方面的作用，坚持为航空产业的发展服务，为基层单位服务。
7月4日航空自动控制研究所与空军领航学院联合研制的LHM16-1型领航轰炸模拟器，在西安通过技术鉴定。该模拟器节省了训练费用和人力，填补了中国领航轰炸模拟器领域的空白。
7月25日全国政协常委、原航空工业部副部长、顾问刘鼎逝世，享年83岁。
7月26—31日航空工业部在哈尔滨召开第二次企业管理现代化座谈会，讨论如何适应企业升级的需要，加快推进企业管理现代化的措施。
7月28日南京航空降落伞厂研制的热气球在澳大利亚3个地方进行15场飞行表演，效果良好。
8月8日西安飞机公司制造的西飞牌铝合金跳水板获得国家体委体育器材设备审定委员会颁发的正式使用审定证书，从而结束了国际上清一色使用美国洛克希德飞机公司制造的跳水板的历史。该跳水板荣获1985年国家银质奖。
8月8日中美联合开发工业/船舶用FT-8大型燃气轮机合同在美签字。1986年11月正式批准。合同确定FT-8项目，由成都航空发动机公司与美国涡轮动力和船用系统公司（TPM）采取联合设计、联合研制、联合生产和联合销售的方式进行合作，成都航空发动机公司分工承担燃气发生器中经改型设计的部件和全部动力涡轮的制造任务。
FT-8燃气轮机是具有国际先进水平的航空发动机改轻型燃气轮机，是由美国普·惠公司的JT8D-219航空发动机改型研制的，具有体积小、重量轻、性能高、寿命长、可靠性好等特点，可作为发电、机械传动等的动力装置，经适当改动，亦可用作舰船动力。
8月15日胡耀邦总书记在听取国家科委副主任吴明瑜汇报时指出：“……航空工业……几十万人的队伍，要搞国内干线上用的大飞机，要讲振国威，这就是振国威嘛！”赵紫阳总理在9月8日听取高技术问题汇报时指出：“研究航天飞机，对民用航空制造业会有好处。我们把力量组织起来，把航空制造业带起来，搞航天飞机；退而求其次，把大飞机搞上去也是好的。”
8月20日航空工业部下达贵州航空微型电机厂迁贵阳与贵州航空电器厂合并建设的设计任务书。
8月22—25日西安飞行试验研究中心成功完成1架歼8Ⅱ、1架歼教7飞机夜航试飞任务。这是中国航空工业新机定型试飞史上的首次夜航试飞。
8月30日航空工业部表彰周尧和等28名“教书育人、为人师表”的优秀教师。
8月30日赵紫阳总理到青岛某基地，观看水轰5飞机飞行表演，他指出：“水轰5飞机应该走运7飞机的道路，买国外先进电子设备、反潜设备，加装完善。利用国内劳务价格便宜的特点，创造条件，争取出口。”
8月31日—9月7日中国首次参加在英国范堡罗举行的第27届国际航空博览会，展出了歼8Ⅱ、歼7M、强5、歼教5、歼教7、运7、运8、运12和直9直升机模型以及霹雳5B型、飞龙1型、霹雳7号空空导弹模型。共3万多人次参观中国展台，其中包括英国首相和外交大臣，苏联航空工业部副部长等。
8月中航技与巴基斯坦航空联合企业签订协议，共同投资合作研制K8喷气式教练机。该机是一种轻型串座、两侧进气、装配单台涡轮风扇发动机的喷气教练机，主要用于飞行员的基础训练和部分高级训练科目，并兼有近距攻击能力。其研制特点是：面对国内、国外两个市场，中外合作，多方集资，并具有一定风险；选用英美等国多家公司的发动机和机载设备共9项、43个附件，具有国际先进水平，但给技术协调和质量管理带来一定难度。
9月4日军工产品定型委员会批准洛阳空空导弹发展中心研制的霹雳5乙空空导弹设计定型，总设计师黄彬。12月投入小批生产。该导弹是中国研制的第二代被动式红外寻的制导空空导弹，装用于歼7、歼8飞机。
9月24—26日航空工业部在北京召开首次高技术研讨会。
9月底西工大研制的侦察5无人侦察机交付陆军部队试装服役。该飞机总重145千克，装有侦察照相机和电视传输装置，可在60千米半径的范围实施侦察，是中国陆军航空侦察史上的第一代无人侦察机。
9月航空工业部在四川召开某系统工程预研技术总结交流会。出席会议的有部内外20多个单位的126名教授、专家等。这是中国首次开展航空发动机大型科研项目。
9月南京航空学院全面展开研制超低空靶机靶5Ⅲ。1988年1月13日进行科研试飞，转入设计定型试飞。
10月9—18日应航空工业部邀请，国家计委、国家经委、国家科委、国务院重大装备办公室、海关总署、物价总局、税务总局、财政部、中国银行、中国建设银行、中国工商银行等11个单位的70名领导和代表乘坐运7-100飞机，分两批赴陕西地区主要航空工业工厂考察。
10月20日煤炭工业部、航空工业部在辽宁联合召开大型鉴定会，北京航空测试技术研究所与煤炭工业部合作研制的KJ-4煤矿安全监测系统在会上通过技术鉴定。
10月30日美国提出的歼8Ⅱ飞机改装报盘建议书（LOA）经中美双方正式签字生效。1989年，美国单方面暂停该项工程，1990年4月工程终止。
10月南昌飞机厂研制的海鹰1甲舰用导弹通过技术鉴定，并投入生产。1987年开始交付部队使用。
11月1日中国向斯里兰卡交付6架运12，其中1架用做总统座机。这是中国首次出口民用飞机。
11月7日军委副主席杨尚昆、国务院副总理乔石、总参谋长杨得志参观1986年北京国际防务展览会，并先后参观航空工业部展台。杨尚昆在航空工业部展台题词：“多创外汇。”
11月10日姚依林副总理视察上海飞机制造厂，并题词：“发展我国民用飞机制造工业。”11月22日，胡耀邦总书记视察上海飞机制造厂。姚依林、胡耀邦先后对中美合作生产MD-82飞机给予关注。
11月27日航空工业部颁发《航空工业部计量工作管理条例》。条例规定航空工业计量检定系统实行三级传递，北京航空计量检定研究所为一级，区域计量站为二级，厂所、院校计量机构为三级。
11月27日—12月17日运12飞机按照美国适航条例，在国内首次成功进行风险大，难度高的防冰、自然结冰等科目试飞。运12飞机飞越太行山、祁连山、贺兰山、天山四大山脉，穿越茫茫戈壁沙漠，赴新疆完成民用飞机首次自然结冰和防冰试飞。
12月4日国务院召开常务会议，讨论研制干线飞机问题，确定中国研制民用飞机的方针是立足国内，充分利用对外开放的条件，走与外国合作生产的道路，逐步实现现代化、国产化。
12月8—14日1986国际航空及机场设备、飞机维修设备展览会在上海举行。该航展由英国国际贸易和展览公司（ITE）主办，中航技上海分公司等单位给予赞助，是迄今为止在中国举办的最大规模的航空展览。展出面积近1万米2，来自23个国家和地区的300多家公司参展。
12月20日国家科委批准航空工业系统国家级有突出贡献的专家13名。他们是：李未、黎典、朱克昕、张彦仲、刘夏石、高歌、吕庆风、张立同、李烽、马凤山、徐培麟、唐德尧、丁培璠。
12月25日中国民航总局向哈尔滨飞机厂颁发运12飞机生产许可证，这是中国第一架按适航证要求取得生产许可证的民用飞机。
12月截至1986年底，航空文献收藏量已达570万册，航空工业登记的刊物已达100多种，拍摄、收藏科技片、录像片1000多部。
本年度航空工业坚持眼睛向内，认真抓好“改革、开放、调整、改造”4个环节。至1986年底，部属企事业单位236个，其中工业企业116个，职工人数519325人。工业企业固定资产原值722619万元；全年完成基建投资39729万元；工业总产值32．8亿元，其中民品产值20亿元；交付飞机143架，发动机303台，导弹134枚；实现工业利润19539万元；销售收入26．7亿元；全年出口成交2．2亿美元，创汇1．53亿美元。航空院校毕业生7602人，其中研究生381人（含博士生14人）、大学本科生3445人、专科生1178人、中专生517人，技工生2081人。
1987年
1月12日航空工业部在首都京丰宾馆举行新闻发布会。新华社、中国新闻社、人民日报等首都新闻单位20余人参加。会上发布3条新闻：一是我国研制成功歼8Ⅱ型新式高性能歼击机；二是我国第一代携带空舰型导弹的轰炸机轰6丁研制成功；三是我国自行设计制造的3种飞机（强5C、歼教7、运12Ⅱ）将参加1987年6月举行的巴黎国际航展。
1月13—21日航空工业1987年企事业单位领导干部会议在北京召开，国务院副总理李鹏参加了闭幕式。莫文祥部长在工作报告中进一步明确航空工业的发展方针：军民结合，以民为主，航空为本，多种经营；科研先行，质量第一；面向国际，集团竞争。同时对坚持“航空为本”做出阐释：“我们这样大的国家，不能只靠国外买飞机来装备部队和满足民航运输的需要，航空工业大发展是必然趋势；发展航空的决心始终不能动摇。”还指出：“航空工业发展的根本出路是改革，改革的总思想是航空（产品）集中，民品开放；横向联合，形成集团；简政放权，搞活企业；理顺机关，转变职能。”并提出：“如果把以军为主的航空工业作为第一次创业，那么，建立军民结合的航空工业就是第二次创业。”