永乐四年，置苑马寺凡四：北直隶、辽东、平凉、甘肃。五年，增设北直隶苑马寺六监二十四苑。（顺义、长春、咸和、驯良四苑，隶清河监。水州、隆萃、大牧、遂宁，隶金台监。汧池、鹿鸣、龙河、长兴，隶涿鹿监。辽阳、龙山、万安、蕃昌，隶卢龙监。清流、广蕃、龙泉、松林，隶香山监。河阳、崇义、兴宁、永成，隶通州监。六年增甘肃、平凉二寺监。每寺各六监二十四苑。）十八年，革北京苑马寺，并入太仆。正统四年，革甘肃苑马寺，改牧恩军于黑水口，隶长乐监。弘治二年革平凉寺丞一员。十七年，都御史杨一清奏请行太仆、苑马二寺员缺，简选才望参政、副使补升卿，参议、佥事补升少卿，以振马政。十八年又请添设寺员。嘉靖三十二年，以辽东寺卿张思兼辖金、复、盖州三卫军民。四十二年，又命带理兵备事。
都转运盐使司。都转运使一人，（从三品）同知一人，（从四品）副使一人，（从五品）判官无定员。（从六品）其属，经历司，经历一人，（从七品）知事一人，（从八品）库大使、副使各一人。所辖，各场盐课司大使、副使，各盐仓大使、副使，各批验所大使、副使，并一人。（俱未入流）
都转运使。掌盐监之事。同知、副判分司之。都转运盐使司凡六：曰两淮，曰两浙，曰长芦，曰河东，曰山东，曰福建。分司十四：泰州、淮安、通州隶两淮，嘉兴、松江、宁绍、温台隶两浙，沧州、青州隶长芦，胶莱、滨乐隶山东，解盐东场、西场、中场隶河东。分副使若副判莅之，督各场仓盐课司，以总于都转运使，共奉巡盐御史或盐法道臣之政令。（福建、山东无巡盐御史，馀详《食货志·盐法》中。）
盐课提举司。提举一人，（从五品）同提举一人，（从六品）副提举无定员。
（从七品）其属，吏目一人，（从九品）库大使、副使一人。所辖，各盐仓大使、副使，各场、各井盐课司大使、副使，并一人。提举司凡七：曰四川，曰广东海北，（廉州）曰黑盐井，（楚雄）曰白盐井，（姚安）曰安宁，曰五井，（大理）曰察罕脑儿。又有辽东煎盐提举司。（提举，正七品，同提举，正八品，副提举，正九品。）其职掌皆如都转运司。
明初，置都转运司于两淮。吴元年，置两浙都转运司于杭州，定都转运使秩正三品，设同知，（正四品）副使，（正五品）运判，（正六品）经历，（正七品）知事，（正八品）照磨、纲官，（正九品）盐场设司令，（从七品）司丞，（从八品）百夫长。（省注）洪武二年置长芦、河东二都转运司，及广东海北盐课提举司，寻又置山东、福建二都转运司。三年，又于陕西察罕脑儿之地置盐课提举司，后渐增置各处。建文中，改广东提举为都转运司。永乐初复故。十四年，初命御史巡盐。景泰三年，罢长芦、两淮巡盐御史，命抚、按官兼理。已复遣御史，其无御史者，分按察司理之。又洪武中，于四川置茶盐都转运司，（洪武五年置，设官如都转运盐使司。十年罢。）纳溪、白渡二盐马司，（洪武五年置，以常选官为司令，内使为司丞。十三年罢，寻复置。十五年，改设大使、副使各一人。）后并革。又有顺龙盐马司，亦革。
市舶提举司。提举一人，（从五品）副提举二人。（从六品）其属，吏目一人。（从九品）掌海外诸蕃朝贡市易之事，辨其使人表文勘合之真伪，禁通番，征私货，平交易，闲其出入而慎馆谷之。
吴元年，置市舶提举司。洪武三年，罢太仓、黄渡市舶司。七年，罢福建之泉州、浙江之明州、广东之广州三市舶司。永乐元年复置，设官如洪武初制，寻命内臣提督之。嘉靖元年，给事中夏言奏倭祸起于市舶，遂革福建、浙江二市舶司，惟存广东市舶司。
茶马司。大使一人，（正九品）副使一人，（从九品）掌市马之事。洪武中，置洮州、秦州、河州三茶马司，设司令、司丞。十五年改设大使、副使各一人，寻罢洮州茶马司，以河州茶马司兼领之。三十年，改秦州茶马司为西宁茶马司。
又洪武中，置四川永宁茶马司，后革，复置雅州碉门茶马司。又于广西置庆远裕民司，（洪武七年置，设大使一人，从八品，副使一人，正九品。）市八番溪洞之马，后亦革。
府。知府一人，（正四品）同知，（正五品）通判无定员，（正六品）推官一人。（正七品）其属，经历司经历一人，（正八品）知事一人。（正九品）照磨所，照磨一人，（从九品）检校一人。司狱司，司狱一人。（所辖别见）知府，掌一府之政，宣风化，平狱讼，均赋役，以教养百姓。每三岁，察属吏之贤否，上下其考，以达于省，上吏部。凡朝贺、吊祭，视布政使司，直隶府得专达。凡诏赦、例令、勘劄至，谨受之，下所属奉行。所属之政，皆受约束于府，剂量轻重而令之，大者白于抚、按、布、按，议允乃行。凡宾兴科贡，提调学校，修明祀典之事，咸掌之。若籍帐、军匠、驿递、马牧、盗贼、仓库、河渠、沟防、道路之事，虽有专官，皆总领而稽核之。同知、通判分掌清军、巡捕、管粮、治农、水利、屯田、牧马等事。无常职，（各府所掌不同，如延安、延绥同知又兼牧民，馀不尽载。）无定员。（边府同知有增至六、七员者。）推官理刑名，赞计典。（各府推官，洪武三年始设。）经历、照磨、检校受发上下文移，磨勘六房宗卷。
明初，改诸路为府。洪武六年，分天下府三等：粮二十万石以上为上府，知府秩从三品；二十万石以下为中府，知府正四品；十万石以下为下府，知府，从四品。已，并为正四品。七年，减北方府州县官三百八人。十三年，选国子学生二十四人为府州县官。六月罢各府照磨。二十七年复置。自宣德三年弃交阯布政司，计天下府凡一百五十有九。
州。知州一人，（从五品）同知，（从六品）判官无定员，（从七品。里不及三十而无属县，裁同知、判官。有属县，裁同知。）其属，吏目一人，（从九品。所辖别见。）
知州，掌一州之政。凡州二：有属州，有直隶州。属州视县，直隶州视府，而品秩则同。同知、判官，俱视其事州之繁简，以供厥职。计天下州凡二百三十有四。
县。知县一人，（正七品）县丞一人，（正八品）主簿一人，（正九品）其属，典史一人。（所辖别见）
知县，掌一县之政。凡赋役，岁会实征，十年造黄册，以丁产为差。赋有金谷、布帛及诸货物之赋，役有力役、雇役、借债不时之役，皆视天时休咎，地利丰耗，人力贫富，调剂而均节之。岁歉则请于府若省蠲减之。凡养老、祀神、贡士、读法、表善良、恤穷乏、稽保甲、严缉捕、听狱讼，皆躬亲厥职而勤慎焉。
若山海泽薮之产，足以资国用者，则按籍而致贡。县丞、主簿分掌粮马、巡捕之事。典史典文移出纳。如无县丞，或无主簿，则分领丞簿职。（县丞、主簿，添革不一。若编户不及二十里者并裁。）
吴元年，定县三等：粮十万石以下为上县，知县从六品；六万石以下为中县，知县正七品；三万石以下为下县，知县从七品。已，并为正七品。凡新授郡县官，给道里费。洪武元年，征天下贤才为府州县职，敕命厚赐，以励其廉耻，又敕谕之至于再。三十七年，定府州县条例八事，颁示天下，永为遵守。是时，天下府州县官廉能正直者，必遣行人赍敕往劳，增秩赐金。仁、宣之际犹然，英、宪而下日罕。自后益重内轻外，此风绝矣。计天下县凡一千一百七十有一。
儒学。府，教授一人，（从九品）训导四人。州，学正一人，训导三人。县，教谕一人，训导二人。教授、学正、教谕，掌教诲所属生员，训导佐之。凡生员廪膳、增广，府学四十人，州学三十人，县学二十人，附学生无定数。儒学官月课士子之艺业而奖励之。凡学政遵卧碑，咸听于提学宪臣提调，府听于府，州听于州，县听于县。其殿最视乡举之有无多寡。
明初，置儒学提举司。洪武二年，诏天下府州县皆立学。十三年，改各州学正为未入流。（先是从九品）二十四年，定儒学训导位杂职上。三十一年诏天下学官改授旁郡州县。正统元年始设提督学校官，又有都司儒学，（洪武十七年置，辽东始。）行都司儒学，（洪武二十三年置，北平始。）卫儒学，（洪武十七年置，岷州卫，二十三年置，大宁等卫始。）以教武臣子弟。俱设教授一人，训导二人。河东又设都转运司儒学，制如府。其后宣慰、安抚等土官，俱设儒学。
巡检司。巡检、副巡检，（俱从九品）主缉捕盗贼，盘诘奸伪。凡在外各府州县关津要害处俱设，俾率徭役弓兵警备不虞。初，洪武二年，以广西地接瑶、僮，始于关隘冲要之处设巡检司，以警奸盗，后遂增置各处。十三年二月，特赐敕谕之，寻改为杂职。
驿。驿丞典邮传迎送之事。凡舟车、夫马、廪糗、庖馔、裯帐，视使客之品秩，仆夫之多寡，而谨供应之。支直于府若州县，而籍其出入。（巡检、驿丞，各府州县有无多寡不同。）
税课司。（府曰司，县曰局。）大使一人，（从九品）典税事。凡商贾、僧屠、杂市，皆有常征，以时榷而输其直于府若县。凡民间贸田宅，必操契券请印，乃得收户，则征其直百之三。明初，改在京官店为宣课司，府州县官店为通课司，后改通课司为税课司、局。
仓。大使一人，（府从九品，州县未入流）副使一人，库大使一人。（州县设。）
织染杂造局。大使一人，（从九品，州织染局未入流。）副使一人。
河泊所官，掌收鱼税；闸官、坝官，掌启闭蓄泄。洪武十五年，定天下河泊所凡二百五十二。岁课粮五千石以上至万石者，设官三人；千石以上设二人；三百石以上设一人。
批验所。大使一人，副使一人，掌验茶盐引。
递运所。大使一人，副使一人，掌运递粮物。洪武九年始置。先是，在外多以卫所戍守军士传送军囚，太祖以其有妨练习守御，乃命兵部增置各处递运所，以便递送。设大使、副使各一人，验夫多寡，设百夫长以领之。（后汰副使，革百夫长。）
铁冶所。大使一人，副使一人。洪武七年初置。凡十三所，每所置大使、副使各一人。（初，大使，正八品，副使，正九品，后俱为未入流。）
医学。府，正科一人。（从九品）州，典科一人。县，训科一人。洪武十七年置，设官不给禄。
阴阳学。府，正术一人。（从九品）州，典术一人。县，训术一人。亦洪武十七年置，设官不给禄。
府僧纲司，都纲一人，（从九品）副都纲一人。州僧正司，僧正一人。县僧会司，僧会一人。府道纪司，都纪一人，（从九品）副都纪一人。州道正司，道正一人。县道会司，道会一人。俱洪武十五年置，设官不给禄。