最最没有想到的是李定国居然兵败被俘。
由于李定国身材高大，破城之后更是重点围攻的目标，这不被一个中队的人马团团围住，自杀不成最后被捆住来见杨轩。
看着比自己高出半个人头的李定国，杨轩亲自走下去解开其身上索子道：“各位，李将军是我最为尊贵的客人，谁人如此大胆，竟然敢捆了李将军，真是可恨可恨。”
李定国怔怔的看着杨轩道：“蓬侯，你要杀我？”
杨轩微微一怔，瞪着李定国道：“你害怕吗？”
李定国摇摇头，说道：“自从做了流寇，那天不是在死亡边缘打滚，有什么害怕不害怕的。”
杨轩呵呵一笑，拍了拍李定国肩膀，对众人说道：“宁宇将军真是妙人，人不畏死奈何以死惧之？
将军虽起于草莽之间，但我认为唯有李将军有古将军风范，被人赠以小尉迟的美名。
我今日不喜得昆明城，而喜得能够与宁宇将军一聚啊。”
李定国睁大眼睛，不敢置信的看着杨轩道：“蓬侯，你这是？”
杨轩笑道：“宁宇将军不要慌张，你可以在这里喝酒吃饭，我给你三天时间考虑，三天后你可以决定归顺本督，大家一起杀鞑子将鞑子赶出关内。
或者收拾你被俘的人马，前往投奔孙可望。
宁宇将军，不论你选择那样，我都不会拦阻。”
旁边马万年颇为心急道：“姐夫，你不要放过这个歹人，这个歹人射杀神弩张令，张令公与我们家可是深交啊。”
杨轩狠狠瞪了一眼马万年道：“万年，军中无姐夫与小舅子，要记住，在军中我是主将，你是我贴身护卫。
各位，将军最大的心愿不过是马革裹尸而已，张令将军当日与宁宇将军一战，这是强者与强者对话。
战场上刀枪无眼，这只能说明宁宇将军才学远在张令公之上啊。”
王祥也劝诫道：“蓬侯，我等知道你爱惜人才，但这李定国可是仅次于孙可望的人物，若是放回去，恐惹来更大杀戮啊。”
杨轩叹息道：“哎，王将军，本督虽知如此。
但大丈夫应该言而有信，我早上与宁宇将军约定，若晚上更改，如此别人恐耻笑我啊。”
当即不顾，令人好生安置李定国，安置其被捕获的将领。
永历2年（公元1648年12月下旬），义勇军攻陷昆明城，擒获流寇定西将军李定国，斩杀杀害杨展的元凶武大定，另一元凶袁韬逃走。
除此之外，孙可望早已经挟持南明黔国公沐天波携印逃走，留在昆明的大小官员，如明朝云（南巡抚吴兆元，明朝吏部侍郎雷跃龙、进士严似祖，御史任纂、举人金维新、龚铭诸人，杨轩都一一委任其官职。
在占领昆明之后，杨轩令殷承榨署理云楠知府。
以雷跃龙为按察使
顺庆府知府范文广为云楠府知府（含今日昆明）
康定知州傅元修为楚雄府知府
成都令杨有仁为乌蒙府知府
潼川州知州唐阶泰为曲靖知府
严似祖为寻甸州知州。
御史任纂为昆明县县令。
其余的，如前任巡抚吴兆元、金维新、龚铭诸人都有任用。
分派兵马追击逃敌，而自己则留在昆明黔国公府坐镇指挥各部，而令曹章警卫镇、杨秉义第5镇、冯有庆第10镇攻打临近的广（西）府、广南府、临安府。
令曹勋在夺取镇雄府之后，杨璟新率领所部攻打旁边的丽江府，而其率部攻打西南的大理府。
由于过去张献忠常常采用诱敌深入，就地设伏战术，杨轩令各部需要小心谨慎，避免为对方伏击。
各路兵马携带蓬侯信函，凡是阻挡大军的土司，凡是敢公开拒敌的土司，一律夷灭三族，所部土司一律改为州县。
看到各部奉令出征，前云（南巡抚吴兆元甚为不解道：“大人，云（南本为偏远之地，不知王化，很多土司迫不得已，如此方投降孙可望。
国公爷，如今义勇军大败流寇于滇中，大人可以委派各个文官携带印绶，如此云（南全境之乱不难平定啊。
杨轩摇头道:吴老先生，以德报怨，何如？”
吴兆元微微一怔，摇头道：“国公爷，你在考卑职学问。此言出自论语“或曰：“‘以德报怨，何如？’子曰：“‘何以报德？以直报怨，以德报德。””
杨轩呵呵一笑道：“是啊，吴老先生学问虽然好，但孔夫子话的意思则不明白。如今天下纷纭，那些拥兵自重的云（南土司无不闻风而起。
先是吾必奎叛乱，接着是沙定洲，如此无不显示土司力量强大，中央集权式微。
若不改变这种状况，我率军北伐，若后方再出现几个吾必奎，沙定洲之流啊。”
吴兆元笑道：“侯爷，吾必奎，沙定洲不过是少数，大多数土司还是安于现状，很少像吾必奎、沙定洲这样想反叛朝廷的。
大人，云（南三大土司，如丽江木府，武定凤氏、广南侬氏雄踞一方，自比公侯，这些大的土司为了维持自己统治，怎么可能造反呢？”
杨轩深思片刻，细问道：“吴先生，这土司到底是何种制度，与我们汉家的郡县制度有何不一样。”
吴兆元顺口答道：“侯爷，土司就是世有其地、世管其民、世袭其职、世统其兵。
在其统治下，除了土司内部因为继承权发生争执，或者不同土司之间发生械斗，或者反叛朝廷之外，我们汉官一般不会介入。”
杨轩重复念了一遍，眉头皱成一个川字型道：“哦，这样不是国中之国吗？
虽然地盘小一点，但比起朝廷亲王什么权利大多了。
你想想很多亲王虽然俸禄丰厚，但基本上不管事啊。”
吴兆元笑了笑说道：“是啊，侯爷。
土官以世袭故，对内异常残暴，不但征收朝廷赋税十倍以上的税赋，而且恣肆虐杀百姓，为患边境。
更为严重的一些人屠戮汉人，出现“汉民被其摧残，夷人受其荼毒。
自正德年间以来，朝廷推行改土归流政策，自正德年间逐渐施行改土归流政策，如此减少土府（土州）数量。
过去云（南省内知府很多，到现在减少到26个府，其中16个是土府。
但云（南地方有瘴气，根本不敢前往就任，如此虽然改土归流，很多土司权利还没有变小。
但其间不断反复，有的地方刚刚派上流官，随后流官呆不下去，就换成了土官啊。”
杨轩慢慢渡着步子，陷入一片沉思之中后说道：“哦，是这样。那你说说，朝廷如何改改土归流的。”
吴兆元沉思片刻，说道：“国公爷，改土归流不外乎两种方法：
一种是从上而下，先改土府，后改土州。
二是抓住一切有利时机进行，如有的土官绝嗣，后继无人，或宗族争袭，就派流官接任；
土官之间互相仇杀，被平定后，即派流官接任；有的土官犯罪，或反王朝被镇压后，以罪革职，改由流官充任
但土司势力非常强大，中间常常反复啊。
一方面是朝廷着力推行改土归流，一方面土司则拼命反对啊。”
杨轩呵呵一笑道：“反对是正常的，虎口夺食，不可能不反对啊。吴先生，朝廷改土归流政策是对的，但是施行起来就有问题了。
土官为害在什么地方？在与自成体系，有的更是当上土知府，如此更是国中之国啊。
除此之外，土官世统其兵，有了统兵权，如此云（南土司不知朝廷，只知道沐国公。
土人不知道有沐国公，只知道有土司啊。”
吴兆元点了点头，看着杨轩道：“侯爷，正是如此啊，那你说说怎么办？”
杨轩沉思良久，突然转过身道：“如今我们敌人是鞑子，而不是这帮土司，只要他们不反对朝廷，只要不屠戮汉人，只要允许自由通商，只要允许自由婚嫁，土司制度还是可以保留的。
当然，我们要逐步改变土知府、土知州现状，土知府、土知州雄踞一方，在内地那可比郡王还要实权大啊。
其次，要保护我们汉人权益，保卫我们汉人居住权，自由通商权，自由婚假，保证我们汉人不被随意屠戮的权利。
我们要坚决镇压，该夷灭三族的一定要夷灭三族。
对废掉的土司，我们要酌情考虑。
对汉人居多的地方，直接改土归流。
对汉人较少的地方，则分封一到有功的将领为侯爷，授予其世有其地、世管其民、世袭其职的权利，让他们帮忙稳定局势啊。”
吴兆元进士出身，宦海沉浮多年，杨轩这点阴谋当然看得出来，看着杨轩道：“国公爷，你准备改变政策，分封有功将领，就相当于吴起给楚王开的药方，让功勋将领在外面开疆拓土？
是啊，封侯与流官概念不一样啊，流官在地方没有根底，而侯爷不但有朝廷支持，而且还有可以独立支配的财源，可以豢养军队啊。”
杨轩意味深长的说道：“如今天下大乱，对有功之士若不封赏，必然寒心众人啊。
你们研究研究，那几个地方土司势力比较强大，而周围又是州县的，到时候我可以向朝廷请封啊。”
吴兆元一听连声称是，沙定洲反叛之时被其胁迫，后来大西军入境又成为阶下囚，现在义勇军光复云（南，害怕被清算整天提心吊胆的。
现在看来这个杨轩对自己信任有加，居然让自己与新任云楠巡抚詹天做不整死詹天颜、云（南知府范文广等人一道谋划。
如今义勇军控制四（川全部、云楠大部、贵（州、陕（西一部，杨轩以集中处理政务为由，各省未曾任命巡抚，只在四（川、云楠任命布政使，贵（州、陕（西任命都指挥使，代行巡抚职责。