而此时各地土地清丈，人口清理工作也逐步开展，看着统计上来的数字，杨轩大为惊讶，湖北各地有户数 156万，有口800余万（据大明户口册，洪武十四年湖广省有户78万，口460万，洪武二十四年77万，口470万，还不到江西省的一半。但在明朝时期，湖广地区已经得到开发，有湖广熟天下足之说，再加上明末清初湖广填四（川，如此更证明明朝末年湖广地区人口颇多。
结合如今湖南有6500万人口，湖北有5700万人口，远远超过江西的4400万人口，如此推断，即使有战火摧残，湖南、湖北地区人口也应该超过江西地区的人口），其人口数比四（川还要多，在遭遇张献忠、豪格等人祸乱之后，四（川人口才600余万，每年田赋超过240万担，丁赋超过80万元银币，商赋130万银币，按照分成比例，每年需向蜀蜀王府上缴130万担，115万元银币，以作军需之用。
在地方建立衙署清理湖口，清丈土地，推行新政的同时，前方战事持续向前进行。
在攻占武昌以后数月，前线各个兵团高飞猛进，在鞑子未反应之前不断将战线向前退役。
到这年10月，靳统武第10镇已经占领武胜关、控制了大别山地区十余县，陈兵淮西地区。
枢密院佥事刘文秀率部沿长江而下，连续三次大败岳乐所部，如今已经占领鄂州、武穴，大军进抵九江。
在偏远战场，枢密右使李定国率领所部大败驻守常德的徐勇，走出湘西。
到11月上旬这一天，杨轩正在召集枢密军事会议，商讨未来战略。
在占领武昌之后，义勇军上层存在两种争论。
一种战略就是继续东征，兵伐江南，在鞑子还未完成反扑之前夺取南直隶，然后再攻取闽浙、湖广诸地。
另一种就是兵伐湖广，彻底解除鞑子对西南地区威胁，然后再举兵东征。
下面谋士将领争论不休，一时半刻之间，杨轩难以确定。
就在这时，突然看到承运门前一骑翻身下马，杨轩定睛一看，来者竟然是第12镇游击将军王国玺。
在一个侍卫带领下，王国玺满脸灰尘的来到坐前，跪下大哭不已。
原来就在忠义军攻陷武昌城的同时，尚可喜、耿仲明攻陷广州，并且制造了骇人听闻的广州大屠杀，孔有德占领桂林，南明督师瞿式耜自杀殉国。
自永历三年（公元1649年）10月开始，伪平南王尚可喜、伪靖南王耿继茂率军杀到广州城下，广州民众在南明两广总督杜允和率领下，大家据城死守不出。
尚可喜、耿仲明最先率军攻城，但广州城墙颇为高大，再加上鞑子向来不善于攻城，经过两天厮杀，广州城内明军杀退尚可喜、耿仲明进攻，力保城门不失。
在这种情况下，尚可喜一面令人在广州城门四周广挖壕沟，将广州城团团围住，而另一方面则大规模的铸造大炮。
在永历四年8 月1日这天，清军集中73门火炮轰击广州城墙的西北角这一点，清军不怕疲劳、不惧炸膛的清军炮手们，竟然整整轰了一天一夜。
到第二天，奇迹终于出现了，坚固的广州城墙被轰塌一道三十余丈的大口子。
苦苦等待了多时的尚可喜亲自率着清军敢死队，冲进了广州城。
如此广州失守，杜永和只得率领数千大军登上大小船只撤至海南岛的琼州。
在占领广州城后，尚可喜、耿仲明制造了骇人听闻的广州大屠杀，据意大利传教士卫匡国撰写的回忆录中记载，在这场完全是汉人屠汉人的杀戮中，共有二十多万男女老幼，悲惨地死于同族人的刀下。
与此同时，“孤胆汉奸”孔有德也从全州发起攻击，在永历4年8月，孔有德率部杀向桂林，守卫桂林的就剩下曹志建和焦琏了。
曹志建率军迎敌，连战连败，被斩杀近万人，所部也被逼近徭峒中。
在击溃曹志建之后，孔有德率部继续逼近桂林城。
大敌当前，能担当起桂林守卫重任的也只剩下了开国公赵印选、卫国公胡一青手下的滇军了。
但赵印选、胡一青认为有恩于他们的何腾跤已死，大家没有义务去用鲜血和生命，去保卫那个“素无交情”的桂林留守瞿式耜，两人一琢磨，决定率部前往投奔贵州的忠义军，而被殷承柞整编为4部兵马
滇军的不战而遁，让瞿式耜直气得捶胸顿足骂道：““朝廷平时以高爵侍你们，百姓以膏血养你们，你们今天却不发一矢就四散而逃，可知头顶三尺有神灵”。
大骂之后瞿式耜决定以死报国，与张同敞一起取酒同饮，明烛达旦，然后在9月5日被大摇大摆进入桂林城的清军所俘获。
但瞿式耜、张同敞表现出传统士大夫的气节，一心求死的他们见孔有德根本不敢杀他们，最后竟然使出反间计让孔有德将他们自个儿杀死了。
在广州、桂林相继失守之后，南明顿时陷入空前危机，很多投机分子纷纷跳出来，以便分最后一杯羹。
先是永历帝亲信大将，假传圣旨的庆国公邦传看到瞿式耜已死，瞿式耜手下大将宣国公焦链靠山已倒，不顾蛮清大军压境之际，与儿子陈曾禹一道以宴客为名，斩杀前来做客的焦链，兼并其部众，成为南明兵力最强，最有实力的军阀。
陈邦传兼并行动引得很多正直将领非议，有的更是要治陈邦传之罪，在这种情况下陈邦传突然发兵准备劫持永历帝，如此退可以将永历帝作为礼物献给蛮清，自己高官厚禄，进可以劫持南明朝廷，以号令各位诸侯。
但永历帝朱由榔是天生的逃跑帝，在行军过程中发觉异常，当即率领侍卫逃出陈邦传围捕，向南宁方向逃去。
广州失守、桂林失守本来就非常惊爆，现在又爆出南明军队内讧，陈邦传派兵劫持永历帝朱由榔的事情，众人听后一片哗然。
兵政司侍郎赵荣贵摇头道：“如果我们情报无误，杜永和、李元胤可有十万大军，怎么能够困守孤城让鞑子轻易的攻破广州城呢？
还有，曹志建也有大军2万，赵印选、胡一清也有1万大军，焦链有2万大军，陈邦传有3万大军，孙可望有2万大军，大明在广西可足足有10万大军，怎么能够任由鞑子猖狂如斯？”
王国玺叹息道：“侍郎，南明军队你不是不知道，军队大多是老弱妇孺，真正能堪一战的不足一半，算得上精锐的更少啊，他们怎么像我们忠义军这样全都是精挑细选的忠义之士啊。
王爷组建忠义军，各部将士多为精锐死士，在战场上我们大家都可以身先士卒，但南明那帮老爷兵则不这样啊，还没有交战他们常常跑得老远啊。”
殷承柞摸着那半截胡须道：“王爷，如此观之，大明已亡亦。
说说也是，刚从肇庆回到梧州后不思进取，马上进行清洗，将袁彭年、金堡、蒙正发、刘湘客等人全部罢黜。
这次瞿式耜被杀之后，陈邦传马上兼并瞿式耜手下军队，南明如此行径让人寒心啊。
王爷，鞑子三王主力正在围攻两广，王爷应该率领主力东进，占领南京，截断长江，阻断鞑子主力归路啊。
钱邦芑嚷道：“王爷，鞑子三顺王倒行逆施，王爷当解救万民于水火啊。
东征万万不可，如此作为将影响王爷清誉亦。
虽然我等都知道大明已经连亡四次，但王爷一直奉大明为正朔，我等与永历帝有君臣之名啊。
如今孔有德、尚可喜、耿仲明大军压境，皇帝处于困境之中，王爷应该兴义师以援之，如此以全君臣大义，也为天下臣工做出君臣的表率啊。
再说了鞑子在江南集结重兵，若贸然进攻恐陷入敌人围攻之中，如此胜负难料亦。微臣为王爷计之，恳请王爷率部南征，以解救两广之围亦”。
杨轩思潮翻滚，突然竟走下台阶握住钱邦芑的手，声言蛮清鞑子与尚可喜、耿仲明所部都为兽军，自进入中土以来，烧杀**，丧心病狂，禽兽不如。
为了鼓舞士气，杨轩口述鞑子、尚可喜、耿仲明兽军处置条例，在一一列举其罪状之后下令所俘获兽军，全部进行审判，甄别犯有屠杀罪的，一律处以斩刑。
尚可喜、耿继茂率部屠戮我广州子民，丧心病狂，与禽兽无二，着令有司将其二人逮捕归案，对尚可喜、耿继茂二人凌迟处死。
尚可喜、耿继茂以屠城手段对我大汉平民，其家九族，都在不赦之列，着令有司，在条件成熟的时候，将其逮捕归案，明正典刑。
尚可喜、耿继茂所部各把总以上军官，泯灭天良，丧失人心，屠戮族人，禽兽不如，除证明非直接参与屠杀者，一律判处斩立决，在条件成熟时，有司可将其逮捕归案，明正典刑。
着令忠义军各部，在匡复广州后，在民众乱骨埋葬之处，建立纪念塔，在纪念塔下，仿照杭州岳王庙的跪象，用铜铁铸造尚可喜、耿继茂等罪魁祸首的铜像，让其永远跪在那里，以向民众谢罪。
通知刑政司成立专案小组，对尚可喜、耿继茂屠戮广州民众罪行进行公开调查，并将调查报告编撰成册，以警惕后人。
对情节较轻的，一律处以阉割，剁大拇指等刑罚，对其随军家眷，男的卖为奴婢，女的充作营妓。
本来以为这种条例会争议颇大，但大家想到鞑子种种大屠杀，想到那讨厌额鼠尾巴，一个个高叫不已。