轩辕氏大酋长姬邦卉，就是史书上所说的“黄帝”。
史书中的“黄帝”是一个神话帝王，司马迁把黄帝政权几百年的时间全都浓缩在“黄帝”一人身上，让他活了一百五十多岁，这是十分荒唐的。其实，历史上真正与蚩尤大战的并非黄帝，而是黄帝的父亲姬邦卉。姬邦卉生前并没有称帝，只是后人追认他为黄帝。就像后世三国时的和西晋时的司马懿一样，他们为后代打下了江山，没来得及称帝就死了，他们的帝号都是后人追加的。
最后一次涿鹿之战正值夏日的雨季，姬邦卉见蚩尤城正处于灵山河谷的山口处，便命神武将军应龙带着数百人绕道进入灵山河谷的上游，垒石筑坝，蓄积灵山河水。
蚩尤闻灵山河水减少，心生疑惑，便使人往上游察看。察看的士兵中途遭到了轩辕军的劫杀，只好退回。
蚩尤与部下商议，正准备再派几名精明强干的士兵前往探查，忽然间天空阴云密布，哗哗啦啦地下起了瓢泼大雨。
暴雨连降数日，应龙的拦河坝中蓄水已满。
应龙便命令士兵掘开大坝，放水淹灌住在低洼处的蚩尤族人。大坝很快被掘开，汹涌的河水排山倒海般扑向下游，直奔蚩尤氏的都城。洪水一路披荆斩棘势不可挡，冲毁了蚩尤军营，冲乱了蚩尤军队，冲倒了蚩尤氏的许多民房，人们被突如其来的大洪水吓得惊惶失措，体壮者挣扎着逃命，体弱者皆葬身于水中。
轩辕军乘机占据高地，劫杀逃往高地的蚩尤人。
蚩尤军伤亡惨重。
幸好此时正在山上三个寨子里访察的蚩尤得到消息，率部分军队赶回来救援，同时派人火速赶往桃花寨，请求夸父急速派兵增援。
蚩尤军兵败后逃往阪泉之野。
阪泉之野是一个五华里的狭长平川，南北走向，南端有阪泉，是涿水的源头，有沟壑通蚩尤城。此时轩辕军已扼守阪泉之野东面的高地，派六军（熊、虎、罴、貅、貔、貙）阻截蚩尤军的去路，情况十分危急。幸得夸父和风伯、雨师及罗堰十二国（部落）援军赶到，蚩尤军民才得以脱身。
蚩尤二十五年（丙午，前4515），轩辕氏大酋长姬邦卉（黄帝）决心要灭掉蚩尤氏，他调集了强大的兵力，并联合炎帝神农氏的军队追击和围剿溃败中的蚩尤氏军队。
远古时代的人特别相信神灵，不仅每个部族都有自己的图腾（崇拜物），而且都在祖宗祭地供养一种象征祖灵的动物。祖灵生，家族旺；祖灵死，家族衰。蚩尤氏的祖灵是一只巨大的独角虁牛，尊为灵虁，也称夔龙。传说虁牛是一种远古水生动物，蚩尤命人在灵山祖宗祭地开挖了一个大水池，称作龙池，将灵虁养在其中，使专人饲养护卫。
为了瓦解蚩尤军心，姬邦卉派人潜入灵山，刺杀了灵虁，并将虁牛拖出龙池，剥其皮，制成虁鼓，在军中击打，使蚩尤军士惊恐万分，伤心不已，战斗力大减。蚩尤见军心慌乱，知道大势已去，只好率众突围逃走。姬邦卉又派应龙率领一支精兵紧追不舍，同时分派六军阻截蚩尤的援军。蚩尤在得不到外援的情况下，率残部边打边退，苦战了七天七夜，最后只剩下数人被包围在解村（今河北冀州市小寨乡北），终因疲劳过度，寡不敌众而被俘。
轩辕氏大酋长姬邦卉深恨蚩尤，下令将他押往黎山之丘处死。
正在驻守冀南宫南社的蚩尤氏柱下史（史官）刑天，闻帝蚩尤被俘，化妆成轩辕军士混入刑场准备营救。但轩辕军防守严密，待他们靠近时，蚩尤已被处死，尸身被切割得血肉模糊惨不忍睹。刑天等人拼死冲入刑场，将蚩尤的尸体抢了出来，秘密运往濮阳西水坡，以帝王之礼葬之。（此节参阅王大有先生《三皇五帝时代》编写）
史书记载：“黄帝杀蚩尤于黎山之丘”（《云笈七签》卷一百《轩辕本纪》）。黎山之丘在今河南鹤壁市浚县东南，与河南濮阳市西水坡十分接近。因此，王大有先生认定西水坡王墓遗址为蚩尤古冢是可信的。墓中出土的“蚌塑苍龙白虎图”完全符合蚩尤的身份。
传说黄帝因恼恨蚩尤，命将他的头砍下，与尸身分葬两地，头颅葬在寿良（今山东泰安市东平县西南），名蚩尤冢。躯体葬在山阳（今河南焦作市东北），为蚩尤肩髀冢。这似乎不太可信，黄帝与蚩尤有不共戴天之仇，怎么会做出如此决定呢？但三国时魏刘劭等人编撰的《皇览，冢墓记》也说“蚩尤冢在东平郡寿张县阚乡城中，高七尺，民长于十月祀之，有赤气出，如匹降帛，民名为蚩尤旗。”这里所说的寿张，也就是寿良，因“良”字与东汉光武帝的叔父刘良犯讳，故改成寿张。看来山东寿良确有蚩尤冢在，不过这一蚩尤冢很可能是寿良的阚姓居民所立，因为阚姓民是蚩尤族的一个重要支脉，他们是为了纪念先祖而在此地设立了“衣冠冢”，墓中未必实有其人。
蚩尤十七岁即帝位，在位执政虚记二十六年（王大有《三皇五帝时代》），卒于蚩尤二十五年（丙午，前4515），终年四十三岁。死后遗体葬在山阳东（今河南濮阳市濮阳县城西北西水坡），尊号帝蚩尤。
蚩尤在位年表
前4539（壬午）元年
前4538（癸未）二年
前4537（甲申）三年
前4536（乙酉）四年
前4535（丙戌）五年
前4534（丁亥）六年
前4533（戊子）七年
前4532（己丑）八年
前4531（庚寅）九年
前4530（辛卯）十年
前4529（壬辰）十一年
前4528（癸巳）十二年
前4527（甲午）十三年
前4526（乙未）十四年
前4525（丙申）十五年
前4524（丁酉）十六年
前4523（戊戌）十七年
前4522（己亥）十八年
前4521（庚子）十九年
前4520（辛丑）二十年
前4519（壬寅）二十一年
前4518（癸卯）二十二年
前4517（甲辰）二十三年
前4516（乙巳）二十四年
前4515（丙午）二十五年