彭宠自称燕王已有一年。光武帝本想御驾亲征，大司徒伏湛上书阻止，光武帝打消了亲征的念头，只令建义大将军朱祐、建威大将军耿弇、征虏将军祭遵、骁骑将军刘喜等，出兵攻打北方。涿郡太守张丰响应彭宠，成为彭宠的屏障。祭遵认为不除掉张丰，就无法消灭彭宠，于是领兵先行。祭遵赶到涿郡城下，奋勇攻城，城中大乱，功曹孟厷抓住张丰，献给祭遵。祭遵立即下令将张丰斩首，然后据实上奏。光武帝听说张丰被杀，当然欣慰。只因岑彭攻打秦丰，几个月也没有传来捷报，于是将朱祐调去帮助岑彭，留祭遵屯兵良乡，刘喜屯兵阳乡，让耿弇进攻渔阳。耿弇因父亲耿况与彭宠同立战功，怕遭到猜忌，不敢单独行动，于是上书请求回洛阳，希望将渔阳的功劳让给祭遵。光武帝立即下诏：“将军曾带领宗族归顺，因公忘私，功劳卓著，现在又会有什么嫌疑呢？”耿弇接到诏令，就给父亲写信，请耿况为国效力，夹攻彭宠。
耿况看到儿子的书信后，便派耿弇的弟弟耿国入都。光武帝为嘉奖耿况的忠诚，晋封耿况为隃糜侯。彭宠兵分两路，分别攻打祭遵、刘喜：一路由彭宠领兵数万攻打祭遵；一路由弟弟彭纯领着几千匈奴骑兵，攻打刘喜。彭纯走到军都县，忽然遇到一队人马头杀来，彭纯措手不及，慌忙后退。彭纯手下的两个匈奴将领，不知利害，向前迎战，谁知上谷骑兵比胡骑还要厉害，无人敢挡。还有一位青年骁将，一马当先，挥槊杀入，刀锋所到之处，无不鲜血淋漓，两个匈奴将领都做了他槊下的无头鬼。其余的人自然逃散，彭纯也逃了回去。这位青年骁将就是耿况的次子耿舒。耿况曾派人到渔阳打探消息，得知彭纯出发后，就派次子耿舒率兵前去拦截。彭纯不曾防备，被耿舒打败。军都县本已归附彭宠，此次耿舒乘胜进攻，将它唾手得来。彭宠听说彭纯战败，军都县失守，不禁胆战心惊，连忙领兵折回，又担心祭遵、刘喜与耿况合兵攻来，因此日夜不安。渔阳城内的百姓，也担忧得很。
蹉跎了几个月，已是建武五年。子密等三人见彭宠心烦意乱，不能成就大事，就暗中密谋，计划将彭宠夫妇杀死，投降汉朝。三人等彭宠躺在床上时，进去把彭宠绑住，然后出去宣告说大王斋戒，令众人回去休息。等外吏离开，三人又假传彭宠的命令，召来彭宠的妻子。彭宠的妻子不知是何原因，见彭宠被捆住，忍不住惊叫道：“有人造反！”刚说到“反”字，已被人揪住头发。子密一巴掌向她脸上扇去，扇得她面目红肿，不敢出声。彭宠慌忙大声说：“快去为各位将军准备行装，不要多说！”子密等人才将她释放，跟她进去取金银珠宝，只留一个下人看守彭宠。
子密等取来珍宝，又将彭宠的妻子赶进卧室，逼她缝两个布袋。彭宠的妻子不敢不从，等布袋缝好，已经半夜了。子密又逼着彭宠写下一封书信，命令守城的将士开门。彭宠已像傀儡一般，写好之后，子密便将他的人头割下，转身又给彭宠的妻子一刀。他们将彭庞夫妇二人的人头装入那两个布袋中，带着彭宠的书信，直奔洛阳。
彭宠夫妇死后，尚书韩立等人立彭宠的儿子彭午为王。才过几天，国师韩利又割下彭午的头颅，献给征虏将军祭遵。祭遵进入渔阳，杀光彭宠的族人，然后派人据实上奏。光武帝封子密为不义侯。
北方平定后，只有东南一带还没有肃清。征南大将军岑彭与秦丰的部将蔡宏相持几个月，不分胜负。光武帝派朱祐前去援助，并下诏斥责岑彭。岑彭又怕又气，不等朱祐到来，便一鼓作气，打败秦丰，秦丰逃回黎邱，蔡宏被岑彭的部下杀死。彭岑逼近黎邱，秦丰的部下赵京出城投降。岑彭据实上奏，光武帝加封岑彭为舞阴侯，封赵京为成汉将军。岑彭带领赵京一同围攻黎邱，建义大将军朱祐也领兵赶到，与岑彭一起攻打秦丰。秦丰的部下田戎，自称扫地大将军，听说秦丰被围，惊惶得很，便想归顺洛阳。秦丰有好几个妻子，其中一个妻子母家姓辛，兄长叫辛臣，在田戎帐下做事。田戎让辛臣坚守夷陵，自己率兵到黎邱，打算到岑彭那里投降。不料辛臣盗取珍宝，抛弃夷陵，率兵从小路投降岑彭。田戎怕辛臣进谗，因此不敢投降汉朝，只说是前去营救秦丰。
岑彭留下朱祐围城，自己领兵攻打田戎。田戎支撑不住，连战连败，部将伍公投降岑彭，田戎逃回夷陵。光武帝亲自到黎邱慰劳将士，封赏一百多人。后来探知城中只有一千兵马，粮食也快没有了，光武帝就留下朱祐单独攻打黎邱，让岑彭与积弩将军傅俊一起讨伐田戎，自己起驾回都。
岑彭与傅俊攻打夷陵，田戎出兵迎战，伤亡无数，于是将夷陵舍去，向西逃走。岑彭追到秭归，因田戎翻山越岭，直奔蜀地，不便追赶，只好班师回去。朱祐围攻秦丰，秦丰自知危险，忙向外郡求援。秦丰的部将张康从蔡阳前来增援，与朱祐打了几十天，并将粮食输送给秦丰，城内得到粮食后，拼命坚守。朱祐分兵绕到张康营后，然后带领部下直捣张康大营，张康进退无路，被朱祐一刀砍死。
到建武五年夏天，秦丰兵尽粮绝，无计可施，只得与母亲、妻儿出城投降。光武帝因他负隅顽抗，罪无可赦，下令将秦丰正法。另派捕虏将军马武、骑都尉王霸，攻打刘纡。刘纡向海西王董宪求救，董宪正准备率兵支援，不料兰陵守将贲休举城投降，董宪怒不可遏，于是率兵围攻兰陵。虎牙大将军盖延正屯兵楚郡，听说兰陵被围，就与平狄将军庞萌一起支援兰陵。光武帝下诏：“董宪的巢穴在郯城，如果直捣郯城，兰陵自然解围。”盖延接到诏令，马上领兵出发，只因途中接连收到兰陵的警报，不得已先去兰陵。董宪只派遣偏将迎战，盖延率兵将其击退，进入城中。
过了一夜，董宪纠集大队人马围攻兰陵，盖延才知中计，于是领兵冲出，去攻打郯城。光武帝得知后，传令责备盖延：“朕让将军前去攻打郯城，无非是想趁他不备去偷袭。将军却先去解救兰陵，还没有打退敌人，又想去进攻郯城，郯城的敌人已有防备，兰陵更加危急，岂不是越弄越糟吗？”盖延此时已到郯城，不能再返回，只好全力猛攻，果然久攻不下。
不久，兰陵被董宪攻陷，贲休战死。刘纡见董宪不到，就让苏茂出去招集党羽。苏茂得了四千人，回来解救垂惠，趁机截击汉军的粮道。马武前去解救，交战的时候，城中又冲出周建。马武腹背受敌，只好冲开一条血路，逃到王霸营中求救。王霸装聋作哑，不肯出兵。马武见王霸不肯出兵解救，下令与苏茂、周建决一死战，喊杀声惊天动地。过了两三个时辰，王霸营中的壮士路润等人忍耐不住，请求发兵相助，王霸这才出兵。苏茂、周建正与马武打斗，不料后边来了一位金盔铁甲的大将军。周建急忙回马接战，不到三个回合，就受了重伤，于是掉转马头逃走。苏茂看到后，也退了回去。马武见来将打退苏茂、周建，心中十分欢喜，仔细一看，竟是王霸。
又过了两天，苏茂、周建率兵到王霸营前挑战，王霸安坐营中，与将士饮酒作乐，谈笑自如，并对将士们说：“苏茂率兵前来解救垂惠，因为粮食不够，才一再挑战。现在我们闭营休息，以逸待劳，定会大获全胜。”将士似信非信，好容易等到晚上，营外已没有动静，敌人全部退去了。半夜有人进来禀报，说苏茂、周建不能进城，逃往别处去了。
过了一夜，城中守将周诵递来降书，王霸慨然答应，与马武一起进城。刘纡本来在城中，听说周诵投降，急忙率领卫士逃往西防，投靠佼强。周建负伤逃跑，在途中死去。苏茂逃到下邳，与董宪合兵。
那时候，盖延还没有攻下郯城，屯兵城外。平狄将军庞萌起了歹意，竟率兵袭击盖延的营垒。盖延猝不及防，仓皇逃走。庞萌平时谦逊有礼，光武帝很信任他，就封他为平狄将军。现在他与盖延一同讨伐董宪，竟然反叛，光武帝非常气愤，传令众将：“我曾说庞萌是社稷之臣，不料他竟然反叛，希望你们厉兵秣马，聚集睢阳，等我亲自督战。”光武帝御驾亲征，走到蒙城，听说彭城失陷，太守孙萌被庞萌抓住，差点儿被杀。光武帝顾不上休息，留下军用物资，率领骑兵赶往任城。
庞萌自称东平王，听说皇帝御驾亲征，便去禀报董宪。董宪让刘纡进入兰陵，让苏茂、佼强援助庞萌。庞萌屯兵桃城，拦住光武帝。桃城距任城仅有六十里，庞萌以为定有一场恶战，谁知等了三天，毫无动静。他吃惊地说：“听说皇帝日夜兼程，远道而来，现在竟住在任城，不发一兵，究竟是什么意思？真是令人不解！”
正疑惑的时候，光武帝亲自率领大军前来，吴汉、王常、盖延、马武、王霸等身经百战的良将，全部到来，直抵桃城。庞萌只得硬着头皮迎敌，仿佛以卵击石，飞蛾扑火，不到半天，部下已死了一半。苏茂、佼强领兵先撤，庞萌也落荒而逃。