珊瑚墓地那感人至深的一幕深深地印入了我的脑海，这次海底旅行的第一阶段到此结束。现在开始的是第二阶段的旅行。正是如此，尼摩船长的毕生都将在这浩瀚的海洋中度过，他甚至早已在那深不可测的海底中为自己准备好了坟墓。在那里，“鹦鹉螺号”上这些生死与共的船员的安眠，不会受到任何海怪的侵扰。“同样绝对不会有人来骚扰我们。”船长补充说道。
对于人类社会，这位船长总是持着他那种一直无法改变的愤世嫉俗和不信任的情绪。
至于我，我再也不满足于那些令康塞尔满意的各种猜测了。这个小伙子坚持认为，“鹦鹉螺号”的这位指挥官是怀才不遇的学者，他用蔑视的态度看待人世间的世态炎凉。他还是一位不为世人所理解的奇才，正是因为对陆地上的一切非常失望，才不得不逃避到这个人类无法到达，而他的本性却可以自由发挥的地方。但是，在我看来，这种猜测只能解释尼摩船长性格的一个侧面。
事实上，在我们被羁押在牢房中并被强迫睡眠的那个神秘的晚上，船长非常粗暴地从我手中夺走了我准备用来观测天际的望远镜，“鹦鹉螺号”受到无法解释的撞击从而使那个水手受到致命伤害，这一切情况都促使我用一种合理的角度去解释问题。不，尼摩船长不止在逃避人类！他那神奇的潜艇不仅是在为他追求自由的天性服务，而且还可能用来帮助他实施一种可怕的报复。虽然目前一切还尚未清楚，我只是看到了一些蛛丝马迹。可以这么说，我只是在记录发生过的事情。
再说，我们没有受到尼摩船长的任何约束。因为他知道任何人都不可能逃出“鹦鹉螺号”。我们甚至不用履行什么诺言，我们算不上是囚犯。可是，我们只是礼貌上的客人，而实际上，我们仍旧是俘虏或者说是囚犯。因此，尼德·兰并没放弃恢复自由的希望。只要一出现偶然的机会，他也肯定会第一个牢牢抓住。我当然也会跟他一样。可是，假如我把慷慨的船长让我们了解的“鹦鹉螺号”的秘密带走，这对于我来说，将没有任何遗憾！总之，对于这个人，我究竟是该痛恨，还是该赞美？他到底是一个受害者，还是一个刽子手？再者，坦白地说，在永远离开他之前，我想完成这次海底旅行，因为它的开始是那么的奇妙。我期盼能观察这一系列隐匿在地球海底里的奇观。我期盼看看这些人类还没看过的东西，即使要我付出生命来满足我那强烈的好奇心，我也在所不惜！可是，我们在太平洋底航行了6000法里，到目前为止我发现了什么？什么都没有，或者说几乎没有。
然而，我清楚地知道：“鹦鹉螺号”正在逐渐驶向有人居住的陆地。一旦我们有逃离的机会，要我为了自己的好奇心而牺牲自己的同伴，那未免也太残忍了。我必须跟他们一起逃走，甚至带领他们逃走。但是，会有这种机会吗？作为一个被强行剥夺了自由的人，我急切地盼望着这个机会的到来；而作为一个学者或者好奇心强的人，我这时却犹豫不决。
1868年1月21日中午，大副从潜艇里走出来测量太阳高度。我也登上平台，点了一支香烟，看着他操作。在我看来，这个人显然听不懂法语，因为我好几次都大声地说出我的想法，假如他能听懂，他或许会下意识地做出某些反应，可是他却依旧面无表情，一言不发。
当大副用六分仪观测时，“鹦鹉螺号”上的一名水手--在克利斯波岛，我们进行第一次海底漫游时，一直跟着我们的那个身强力壮的人--也过来清洗探照灯玻璃。于是，我仔细观察起这个灯的构造。这个灯里有一些凸状镜片，像灯塔的玻璃那样放置着，它们把灯光聚集在一个有效的反射面上，使亮度骤增百倍。灯设计得如此完美，使它的照明功能发挥得淋漓尽致。事实上，灯光是在真空的环境下产生的，这就使它的稳定性和强度得以保证。而且，真空的环境也可以减少碳的消耗，灯的弧光正是在两根碳棒之间产生的。对尼摩船长来说，节约非常重要，更换碳棒并不是一件轻而易举的事情。但在真空的环境下，碳棒的损耗速度是难以察觉的。
当“鹦鹉螺号”准备继续它的海底旅行时，我回到了客厅。舱门再次被关上了，“鹦鹉螺号”径直朝西航行。
我们在印度洋55亿公顷的广袤海域中劈波斩浪，海水如此清澈透明，令人俯身看着水面时会产生眩晕感。接下来的几天，“鹦鹉螺号”都是在距离印度洋面100米到200米的水层中航行。我对海有着深厚的情感。对于那些和我不一样的人来说，时间显得漫长枯燥。而我每天在平台上漫步，呼吸海洋的新鲜空气，透过客厅玻璃窗观看水中各种奇观异景，阅读图书室里的书籍，撰写我的论文。这些事情占去了我所有的时间，使我没有空余时间偷懒或自寻烦恼。
我们的身体状况都很好，能够完全适应潜水艇上的特殊伙食。出于抵触的情绪，尼德·兰绞尽脑汁地弄出各种菜式，在我看来，这实在没有必要。另外，在这种恒温的环境下，我们甚至连感冒也不会患上。再说，石珊瑚草树，也就是法国普罗旺斯有名的“海茴香”，在潜水艇上还有一定的存货，把它与煮烂的珊瑚虫掺和在一起，还是一剂止咳化痰的良药。
这几天，我们看到了大量的水鸟、蹼足类动物、大海鸥和海鸥。我们巧妙地捕杀了几只水鸟，再将它们精心烹制，制成一道令人垂涎欲滴的水禽野味大餐。那些从各块陆地飞来的、长途迁徙的海上水鸟，由于长途跋涉，身体疲惫，停在波涛上休憩。在这些水鸟里，我发现了属于长翼类的美丽的信天翁，与此不协调的是，它们的阵阵嘶鸣就像驴叫那样刺耳。蹼足类动物的代表是擅长在水面快速捕鱼、飞行速度极快的军舰鸟和数目繁多的鹲，或一种叫“稻草尾”的鹲，尤其以赤灰鹲居多。这种鹲身披红色条纹，大小如鸽子般，白色的羽毛中略带玫瑰色，较好地烘托出了它羽翼上的黑色。
“鹦鹉螺号”的渔网还捞起了好几种玳瑁属的海龟。它们的背部隆起，龟甲十分珍贵。这类擅长潜水的爬行类动物，只要关上鼻腔外孔的肉阀，就能长时间地待在水里。有几只海龟被捉住时，正缩在龟壳里睡觉呢。它这一招还使它免受海里动物的袭击。总的来说，这些海龟的肉吃起来感觉还过得去，可是它们的蛋却是美味佳肴。
至于鱼类，我们透过敞开的舷窗观察它们神秘的海底生活时，都不由自主地发出声声惊叹。我发现了好几类我以前从没有见过的鱼。
在这里，我特别要提及的是红海、印度海和赤道美洲一带的海域里盛产的牡蛎。这类海底动物像海龟、犰狳、海胆、甲壳动物一样，身上披有一层护甲，这种护甲既不是白垩质也不是石质的，而是货真价实的骨质甲壳。它们甲壳有的呈立体三边形，也有的呈立体四边形。在立体三边形甲壳的牡蛎中，我可以数出其中几个种类，它们身长半分米，肉营养美味，尾部呈棕色，鳍部呈黄色。我甚至想把它们放入不少海鱼都能很容易适应的淡水中养殖。我还看到了一些立体四边形的牡蛎，它们背部有4个粗节。一些牡蛎的身体下部有花白斑点，可以像鸟类一样被驯养；一些三角牡蛎身上的骨质甲壳凸起呈刺状，它们因为能发出奇特的呼噜声，而被称为“海猪”；还有一些单峰牡蛎肉质丰厚且粗硬，骨质甲壳似锥形的驼峰。
我还可以列举出康塞尔的日记中所记录下的这一带海域中特有的单鼻鲀类动物，如赤背、身上有3道纵纹的白腹针鱼，长7英寸、色彩艳丽的电鱼。其次是其他鱼类的代表，身上有白色条纹、没有尾巴，犹如一只黑褐色的蛋的卵鱼；堪称真正的海底豪猪的鱼虎，它浑身都是刺，身体一鼓，便成了一个长满利刺的刺球；各大洋都有的海马；鳍像翅膀一样宽大，虽不能飞行但至少会飞跃的长吻海蛾鱼；尾部布满鳞片，体形扁平的鸽子鱼；长25厘米，色彩鲜艳，肉质鲜美的长颌鱼；头部凸凹不平的青灰色美首鱼；腹鳍长，能在水面以惊人的速度滑行的黑纹鳚鱼；味道鲜美，扬起风帆状腹鳍顺流而下的风帆鱼；造物主用黄色、天蓝色、银色和金黄色各种艳丽色彩点缀的彩鱼；鱼翅呈丝状的绒翼鱼；身上沾着泥，能发出某种声音的杜父鱼；肝脏有毒的鲂鳆；眼睛上鼓一个会动的大眼泡的波帝恩鱼；最后是嘴如长管的哨子鱼，它是海洋中真正的猎手，有着一杆连夏斯波公司或雷明顿公司都设计不出的长枪，每次只要从它的嘴枪里射出一滴水，就能杀死一只虫子。