达尔文理论是当代生物学的主流理论，其支持者不少是学富五车的饱学之士。可当人们看看他们的写作，就会发现他们非常片面，基本上是“报喜不报忧”。为了自己认定正确的理论，他们往往挑出一些科学上棱模两可，似是而非的例子不厌其烦地引证；而对一些常识性又对自己不利的东西，便隐而不发。科学上你会因造假抄袭得到惩罚，但无法为装不知道定罪，“揣着明白装糊度”是什么罪？在此，我就举一些例子来说说达尔文理论的权威们不愿让人们知道的事。
1.否定达尔文理论并不否定生物进化
达尔文理论不仅仅说有新物种产生或生物是进化的，它说的是生物是如何进化的，是关于新物种如何产生（进化）的理论。否定达尔文理论只是说达尔文所说新物种产生的机制是错的，就是说“生存竞争”，“自然选择”后会产生新物种的观点是错误的，并不是说没有新物种产生，也不是说所有的生物是几千年前由超自然的力量创造的。
2.否定达尔文理论并不是否定自然选择
自然选择是一个生物界普遍存在的现象，一个生物的群体不可能都是一样，它们对自然环境的适应性必然是不同。这种不同会导致生育机会的不同，使物种本身组成的改变。但这种变化是物种内部组成的改变，不会产生什么新物种；而达尔文理论认为自然选择会导致新种的产生。否认达尔文理论并不否定自然选择的发生，只不过说自然选择不会导致新种的产生。把达尔文理论等同于生物进化或自然选择是达尔文支持者有意或无意给人们的一个错觉。
3.没有任何支持达尔文进化机理的证据
达尔文支持者总不厌其烦的告诉公众有大量的“科学证据”支持他们的理论，实际上他们那些“科学证据”没有一个能支持他们的理论。如“过度化石”“遗迹器官”“同源器官”“分子生物学研究”即使这些例子是真的，充其量也就是说物种是进化而来，它们并不能说明进化如何而来。而“地理适应性”“抗药菌的产生”等等就是说有自然选择发生，而没有新物种产生。在这许多的例子两，生物进化和自然选择本来就是独立发生，跟本不在同一事件中共同存在。即使它们同时发生并不表明它们之间有任何因果关系。有地震发生，也有老鼠同时叫，并不能证明是老鼠叫引起地震。
4.目前已知的新种都是新达尔文理论相反
达尔文理论一个重要的论点是新物种有经过很长很长时间才能形成，这个很长很长的时间要以百万千万年计算。如这个理论正确的话，人的一生是不会看到新物种的生成的。与达尔文理论家预言的恰恰相反新物种被大量发现，每年都有1.5—2万个新物种被发现。美国亚利桑那州立大学的生物学家就搜集世界上发现了什么新种；在2008年就有18，225千多个新物种被发现()。当然，这些发现的新物种可能是以前没有被发现，只是那时才被人们发现他们，但还有一些物种确确实实新的物种形成。比如上个世纪60年代，有人初把阿氏犬齿非鲫放在非洲的Malawi 的人工湖中，这个人工湖开始只放清水，任何鱼都没有。20年后，人们发现湖里已经进化出两种不同的新种，这显然与达尔文理论不符，当代达尔文理论家对此无法解释。
Talk.origins 是美国一个主流达尔文派生物学家控制的网站，里面有一页列举了很多发现的新物种，可以说没有一例是确定支持达尔文理论的，这些例子中绝大多数都是表明新物种是一代产生的，和新达尔文理论所预言的正好相反()。用反达尔文理论的例子来支持达尔文理论，应是科学史上的一大奇观。
5.出尔反尔，反复无常
恩斯特.迈尔是哈佛大学教授，也是新达尔文理论既现代合成论的创始人之一，被他哈佛大学同事说成20世纪最伟大的生物学家。上个世纪40年代提出地理隔离理论，他认为认为新种群形成一定要有地理隔离，这个理论的缺陷是什么我在本书的另一文章中已讨论过，在此就不去重复。但人们至少还有一个方法去验证这个理论是否正确，就是看看新的物种同它们原种之间有无被河流或山谷所分开。后来的科学研究发现了许多新物种，而它们可能的原来种之间根本就没什么河流或山谷，是同处一地。迈尔不再提他那河流或山谷的理论了，转而又说新物种是由于建立者作用（founder effect）所致，而这种建立者少到可能只是一个。如此一来，人们就无法研究看观察到河流或山谷来验证这个理论是否正确，只能通过丰富的想象来揣测这种建立者，凭信仰接受这一理论。类似的例子在他的书里还很多。
缺乏过度化石一直是生物界的一大困惑。1972年由美国古生物学家N.埃尔德雷奇和SJ 古尔德提“间断平衡”。他们的意思是：不必去找什么过渡型的化石，生物进化就应该是一时变化很快，一时又基本上没什么变化，所以化石就应该是间断的。可它没有一个合理的生物学模型说出生物进化为什么会以“间断平衡”的方式发生？
达尔文的理论是个地地道道的生物缓慢进化的理论，从中无法找到生物一会跳跃进化，一会缓慢进话的痕迹；“间断平衡”的观点是典型的生物巨变论的说法，只不过是换了一个说法，和达尔文理论预言的正相反，这个理论一出现就引起占主流派的新达尔文生物学家的不满。其实科学上的标新立异是很正常的事，是科学发展的自然过程。令人不解的是，古尔德自己又宣布他说个坚定的达尔文支持者，这种自虐性的曲意奉承实在令人感到不解。用“间断平衡”理论来证明达尔文理论的正确就像用阿婆罗登月飞船来证明腐朽的资本主义正在没落一样荒唐。
6.新达尔文理论抛弃了欧卡姆剃须刀
欧卡姆剃须刀是科学的基本原则。它说的是科学的理论是越简单越好。人们能用一个答案解释问题就不必用两个，更不必把以知的答案放在一边，再去找未知的秘密去解同一问题。已知爱滋病是由HIV 病毒引起，当然就没有必要去再去找另一个未知的还会引发爱滋病的病毒。已知美国的艾滋病是由HIV 病毒引起，就可推论中国，日本，英国及全世界的已知艾滋病都是由HIV 病毒引起。同理，以多倍体为代表证明新物种就是一代生成，为生物学家所公认，即使生物学家对它如何发生的具体过程不完全清楚，但它是实实在在，不容置疑，有成千上万的例子。人们可以推论所有两性生物都是通过类似过程产生的，跟本不必要再假设进化过程是由一些人们无法证实的机理实现。
7.达尔文论是个反人性的理论
“兔死狐悲，物伤其类”是生物共有的天性，也是人类的的天性。人类对弱者是有天生的同情心，比如说很多国家把最好的车位，座位让给残疾人，父母会对有残疾的子女以更多的爱心，这种不弃不舍，共赴危难的互助精神正是人类得以经过种种困难得已生存至今的保证。