在回埃及的路上，摩西再次遇见上帝。因为摩西没有给儿子施割礼，上帝愤怒得要将他杀死，这时，他的妻子西坡拉赶紧在路边捡起一片锋利的石片，将儿子的阳皮割下，上帝这才消了气。
上帝安排亚伦去迎接摩西。在上帝山，久别的兄弟相见后，紧紧拥抱，畅叙阔别之情。摩西将上帝的旨意详细地告诉了亚伦后，他们就将以色列的众长老召集来，将上帝的旨意传达给他们，并在百姓们面前施行上帝传授的神迹，获得了百姓们的信赖，人们纷纷跪伏在摩西的面前。
接着，摩西与亚伦一道去见法老，对法老说，以色列人的上帝要他让以色列人走三天的路程，到旷野里去祭祀上帝，否则会遭到瘟疫和刀兵的攻击。法老说：“上帝是谁？我又不认识他，他怎么能叫我让以色列人旷工，到旷野里去祭祀呢？”法老认为，这是以色列人想偷懒而找的借口。
当天，法老吩咐督工，不但不减少以色列人做砖的数目，而且还要叫他们自己去捡草烧砖，加重他们的工作，来惩罚他们。尽管以色列人的官长苦苦哀求法老，但一点也不起作用。于是已苦不堪言的以色列人开始抱怨摩西，说是他使他们引火烧身。
摩西为此感到非常内疚，便向上帝祷告，上帝表示，要惩罚埃及法老，逼他放以色列人离开埃及。摩西将上帝的这些话传达给了以色列人，但心灰意懒的以色列人根本不相信他的话。上帝便再次要摩西和亚伦去见法老，要求法老放以色列人到旷野去祭祀上帝，并告诉摩西和亚伦，他要使法老的心变硬，坚决不放以色列人，然后他再严惩埃及，通过这些，让埃及人知道上帝的厉害。
尽管这时摩西已八十岁，亚伦已八十三岁，但他们还是照上帝的旨意，去拜见法老。
见到法老后，法老让他们行一件神迹来证实他们的话，于是亚伦按照原先上帝的吩咐，将手杖丢在法老和大臣们面前，手杖立即就变成了蛇。
于是，法老召来埃及的博士和术士，让他们用邪术也丢下自己的手杖变成蛇，但亚伦手杖变的蛇吞下了他们手杖变的蛇。
但是，法老仍不放以色列人离开。于是摩西和亚伦按照上帝的吩咐，开始降灾给埃及，迫使法老屈服。
摩西和亚伦按照上帝的旨意，在法老和众臣面前举杖击打河里的水，河里的水都变成了血，鱼都死了，河水腥臭难闻，埃及遍地都是血，连木器中、石器中都有血。但固执的法老毫不理会，埃及人无水可喝，只好在河边挖井，汲水供人畜饮用。血灾持续了七天，随后河水才变清澈。
摩西和亚伦又按照上帝的旨意去见法老，法老依然不准。于是亚伦用手杖指向江河湖泊，那里的青蛙全都跳了出来，弄得宫殿、房屋、床上、人们的身上，甚至厨房、锅里到处都是青蛙。法老无奈，找来摩西和亚伦，答应了他们的要求，要他们赶快让青蛙都死去。摩西见法老妥协，便向上帝祈祷，第二天，所有的青蛙才都死了。埃及人将死青蛙堆积起来，一时弄得臭气熏天。但是，蛙灾刚过去，法老就立即变卦了。
于是，上帝指示亚伦用杖击地，使尘土变成无数虱子，使全埃及人和牲畜身上都爬满虱子，但是法老仍然不肯妥协。
接着上帝降下了蝇灾，除了以色列人住的歌珊，埃及到处都飞满了讨厌的苍蝇，法老无奈，就把摩西找来，答应了他的要求。
但是蝇灾刚过，法老立即又变了卦。上帝接着就降下了畜疫之灾，于是埃及瘟疫流行，埃及人的牲畜几乎都死了，但以色列人的牲畜一头也没死。
法老仍然不妥协，上帝就开始降疮灾。他吩咐摩西取了几捧炉灰，在法老面前向天上扬起，随后埃及人及牲畜的身上都起了泡疮。
接着上帝又降下雹灾。摩西按上帝的吩咐向天举杖，顿时雷电交加，大块的冰雹砸伤了埃及人及其牲畜，除了未长出的小麦和粗麦，埃及人的农作物几乎全部被毁。
迫于无奈，法老开始求饶，上帝这才止住了冰雹。但冰雹刚住，法老接着就反悔。于是摩西按上帝的吩咐警告法老，如果再不让以色列人去旷野祭祀上帝，上帝就让铺天盖地的蝗虫吃光田间所有的庄稼和树木，并且爬满宫殿和埃及人的房屋，造成空前的灾难。
在众臣的规劝下，法老召见摩西和亚伦，问他们有多少人要去祭祀上帝。摩西说，男女老幼都去，并且带着所有的牲口。但法老只同意让壮年人去，随后便把摩西和亚伦撵了出去。
于是摩西按上帝的吩咐向全埃及伸出手杖，一天一夜之间，刮起了东风，吹来了无数的蝗虫，布满了天空，整个埃及昏天黑地，田间刚长出的一点农作物和雹灾后树上剩下的一点果子全部都被吃完，连一点青的也没留下。
法老急忙召来摩西和亚伦，向他们求饶，接着上帝便调转风向，将蝗虫全部吹入红海，一只也没留下。
当最后一只蝗虫被吹走后，法老继续翻脸不认账。摩西按上帝的吩咐，向天空伸出手杖，整个埃及顿时一片黑暗，三天三夜，伸手不见五指，只有以色列人的家中才有亮光。
这时法老召来摩西，同意让以色列人去祭祀上帝，但必须将牛群和羊群留下。然而摩西却坚持要带走全部牲畜，以侍奉上帝，这下触怒了法老，他吼叫道：“立即给我滚出去，再让我见到你，我就要你的命！”摩西也反唇相讥道：“说得好，我也绝不会和你再见面了。”
在第十次降灾埃及之前，上帝晓谕摩西和亚伦，要他们告诉以色列人：要以本月为正月，本月初十，每家要按人口比例选一头羊或几家合选一头羊，在十四日那天宰了，把血涂在门框和门楣上。就在这天夜里，上帝巡行击杀埃及人，凡门楣和门框上有血的，就越过这家，把埃及人所有头生的人和牲畜统统杀了，不论是太子还是囚徒的儿子。（后来，每年的这一天，以色列人都要举行庆祝活动，这就是逾越节的来历。）
接着，埃及举国上下哭声震天，这回法老终于彻底妥协了。他连夜召来摩西和亚伦，对他们说：“去吧，把你们的以色列人带出去侍奉你们的耶和华吧，就照你们所说的，连羊群牛群也都带走吧！”
这时，埃及人都迫不及待地催着以色列人离开，说如果他们再不走，埃及人都要死光了。以色列人整顿好行装后，按照摩西的吩咐向埃及人索取金银首饰和衣服，由于埃及人急着要以色列人离开，因而被以色列人索去了大量的财物。