撒母耳对以色列人说：“你们如果一心侍奉上帝，就把外邦的神和亚斯他录从你们中间除掉，他必救你们脱离非利士人之手。”以色列人听从了他的话。
这天，以色列人聚集在米斯巴，打水浇在耶和华面前，并禁食一天，撒母耳为他们向上帝祷告。非利士人听到这个消息后，带兵前来袭击。撒母耳把一只吃奶的羊羔作为全牲燔祭献给上帝，为以色列人呼救，上帝应允了他，以雷击非利士人，使非利士人大败。以色列人追杀非利士人，从米斯巴一直到伯甲附近。
在撒母耳当士师期间，上帝惩治非利士人，使以色列人收复了从以革伦到迦特的以色列人的城市及其周边地区，并与亚摩利人和睦相处。从此，非利士人被制服，不敢再侵犯以色列人。
撒母耳每年巡视伯特利、吉甲、米斯巴，然后回到拉玛处理以色列人的事务。在拉玛，他还为上帝建造了一座祭坛。
撒母耳年老后，立他的儿子约珥和亚比业为士师。但这两个儿子都不行正道，贪财图利，收受贿赂，冤枉正直，激起了以色列人的公愤。以色列的众长老聚集在一起，来见撒母耳，说：“您年纪大了，您的儿子又不走正道，请您为我们立一个王治理我们，像我们的邻国一样。”众人的话刺疼了撒母耳，他就向上帝祷告，上帝对他说：“百姓对你说的一切话，你只管依从，因为他们不是厌弃你，而是厌弃我，不要我作他们的王。自从我领他们出埃及到如今，他们常常离弃我，侍奉别的神，他们所为，一贯如此。你就顺着他们吧，但你要告诫他们，他们将来的那王会怎样管制他们。”
撒母耳将上帝的话都传达给众人，对他们说，将来有了国王，人民就要成为他的奴隶，必派你们的儿子为他当兵，种地，打造军器，必使你们的女儿为他制造香膏，做饭烤饼，必取你们最好的田地、葡萄园、橄榄园赐给他的臣仆，你们每年的收获和牲畜的十分之一要交给他，你们的仆人、婢女以及牲口都要供他的差役，到时候你们就会后悔。
但百姓竟不肯听他的话，坚决要求像邻国一样立一个王，带领他们打仗，治理国家。
撒母耳将百姓的这些话向上帝陈明后，上帝要他顺从民意，让百姓各自归城。