刘邦率大军征讨陈稀后，韩信的一个门客向吕后告发，说韩信是陈豨的内应，准备在夜间趁都城空虚，先打开监狱，释放囚犯，再袭击皇后和太子。吕后得到密报后，非常惊慌，急忙把萧何找来商量对策。两人谋划好对策后，由萧何来实施。第二天，萧何便向朝中的大臣们宣布，今天已经接到前线传来的捷报，说高祖刘邦率领的大军已经打败了叛军陈豨，就要班师回朝了，让大家都要前去向吕后道贺。众大臣接到命令后都去向吕后贺喜，只有韩信自称有病，紧闭家门不见任何人，没有前去向吕后道贺。萧何便借着探望韩信病情的理由来到韩信的住所，韩信自然不能再拒绝会面，只好走出卧室与萧何见面。萧何上前一边亲热地拉住韩信的手，一边对他说：“你不过是偶感风寒，不要有太大的精神压力，慢慢调养就会好的。今天皇上派人从前线传来捷报，说已经打败了叛军陈豨，众位王侯大臣都已经进宫去向吕后贺喜去了，只有你一个称病不上朝，也不去向吕后道贺，你又是陈稀的好朋友，这已经引起了大家的猜疑和吕后的不满。咱们两人是无话不谈的老朋友，为了你的切身利益着想，我还是劝你随我一同进宫，早一点向吕后道贺，这样就可以消除大家的怀疑和不满。”韩信听着老朋友萧何的话句句在理，情真意切，也就不好再推辞，只好随着萧何一道进宫。谁知到了吕后的内宫，四周早已经埋伏下不少武士，韩信刚一进门，这些武士们如狼似虎地一拥而上，七手八脚地把韩信捆绑起来。韩信高声呼喊萧何来救他，可这时萧何已经悄悄地躲起来了。武士们把韩信押到了长乐殿中，只见吕后阴沉着脸，怒目圆睁地坐在椅子上，对着韩信大声呵问：“大胆的韩信，你为什么要和叛军陈稀暗中联合谋反，你还要在城中做内应，妄图加害我们母子，你要从实招来。”韩信辩解说：“您这话是从哪里听来的，这是无中生有的假话，我是冤枉的，请皇后明察。”吕后严厉地斥责韩信说：“我现在已经接到皇上的诏书，说陈稀已经被捉拿了，经过审问，他已经招供了，他交代说是听了你的唆使，才起来造反的，而且还有你家里的门客，已经来向我告发你，你暗中串通陈稀谋反的信件都在我这里。你们同谋反叛有确凿的证人证词，现在你还有什么话可说吗！”韩信还想再为自己申辩几句，但是吕后已不容韩信再说，喝令武士们将韩信拉出去处死。武士们将韩信拖到大殿旁的钟室中，将韩信乱刀砍死。一代大将就这样命丧于钟室，死于一个妇人之手。而出了这个计策的人正是萧何。想当初，萧何举荐韩信，劝刘邦登坛拜韩信为大将军，将韩信推到了一人之下，万人之上的位置。现在又是萧何，为吕后献策，诱杀了韩信，将韩信无情地置于死地。所以后来人在看到这段历史的时候，哀叹说：成也萧何，败也萧何。
为博信任自污名节
萧何设计诛杀了韩信之后，刘邦对萧何更是恩宠有加，不仅把萧何进封为相国，而且为萧何加封了五千户的俸禄。同时还派出一名都尉率领五百名士兵到相府保卫萧何。朝中的王侯大臣们都去相府为萧何祝贺，萧何为能得到刘邦的宠幸也很是得意。但是这时萧何府中有一个叫做召平的谋士，却身穿白衣白鞋前来吊丧，说：“丞相您快要大祸临头了。”萧何听到了这样的话非常震惊，忙问这话从何说起。召平说：“皇上连年率兵出征打仗，枪林弹雨，风餐露宿，非常辛苦，而丞相您一直留守在都城，没有汗马功劳，没有特殊的政绩，现在却授予您那么高的奖赏。我暗自揣度皇上的意思，表面上是皇上对您越加恩宠，实际上是皇上开始怀疑您了，您不想一想，淮阴侯韩信足智多谋，为高祖刘邦得天下立下了汗马功劳，现在不是也被杀掉了吗？难道您丞相的功劳能与淮阴侯相比吗？现在皇上又派了卫队来保护您，表面看是关心您的安全，实际上是监视防范您。”萧何听了这一番话，觉得很有道理，就问如何去掉皇上的疑心，保全自己脱离祸患呢？召平又说：“丞相可以向皇上辞去封赏，把自己家中的全部财产都捐献给国家，用作军队打仗的费用，这样就可以排除皇上对您的怀疑，就不至于大祸临头了。”萧何便按照召平的建议，恳请刘邦撤回圣命，不接受封赏五千户的俸禄，只接受相国的职衔，并表示要拿出全部的家财去支援军队打仗。这一招果然灵验，刘邦听了非常高兴，并在群臣中表扬了萧何。
同年秋天，英布谋反，刘邦再一次亲自率兵征讨。
刘邦在前方作战，时刻还惦念着朝中的事情，所以每次萧何派人往前线输送军粮的时候，刘邦都要问：“萧相国在长安忙什么呢？”使者当然每次都如实回答：“萧相国，除了尽力办好供应前线的军需外，无非是做些安抚、体恤百姓的事情，京城里的百姓没有一个不说萧相国好的。”可是刘邦听后并没有露出满意的表情，每次都是默不作声。使者很奇怪，回来后告诉给萧何，萧何也不知道高祖刘邦是什么意思。有一天，萧何和他的门客坐下来闲谈，萧何向他们说了这个事情，其中一位门客说：“您不久就要被满门抄斩了。”萧何听了大惊失色，忙问是为什么，那个门客接着说：“您现在的位置是百官之首，可谓是一人之下，万人之上，高祖刘邦还有什么职位可以再封给您呢？况且您自从入关起就体恤百姓，关心农耕，制定律令，深得百姓的爱戴，到现在已经十多年了。现在您还是一如既往地爱民如子，可以说在百姓中的声望非常高。现在皇上身在前线，却总是关心您的近况，就是害怕您借助关中的民望做出一些反叛的事情啊！您设想一下，如果您一旦借助自己的威信，把百姓号召起来，闭关自守，那皇上不就处于进退两难的境地了吗？如今解决的办法倒是有，不知道您是否愿意一试？”萧何向这个门客讨教解决的办法，门客说：
“您可以故意把自己的名声搞臭，比如您可以贱价强买民间的田宅，故意让百姓骂您、怨恨您，把名声弄得越坏越好，这样皇上一看您也不得民心了，才会对您放心啊。”萧何听了这个办法，说：“我怎么能去剥削百姓，做那些伤天害理的事情呢？”门客说：“您这样做也是为了保全自己，百姓如果知道会体谅您的。”萧何也知道，门客的主意完全是对自己好，并且萧何也明白，对于一般的小官，高祖不怕他们有野心，如果他们犯了贪赃枉法的行为，一定会遭到严惩。但是对自己这样的朝廷重臣，如果干一些贪赃枉法的小事，就显得不是那么重要了，并且如果因为这样的话失去了民心，高祖或许还会对自己更放心。所以，为了消除刘邦对自己的猜忌，萧何不得已违心地做了一些侵夺民间财物的坏事来败坏自己的名声。果然，不久当有人把萧何的所作所为上告给刘邦时，刘邦只是微微一笑，也并未深究。
当刘邦从前线凯旋时，百姓向刘邦控告萧何凭借权势强夺、贱买民间的田宅，价值数千万，恳请刘邦将萧何法办。刘邦回到长安后，见到了前来拜见的萧何，把百姓的上书交给萧何，批评他说：“你身为相国，不做些安民的事情，怎么能利用强权与百姓争夺利益呢？你自己做了错事，自己解决吧。”刘邦表面上是批评了萧何，可是内心里对萧何失掉了民心非常高兴，自此，对萧何的怀疑也逐渐解除了。