就在希腊文明不断发生变化，甚至开始对宇宙产生探索时，就在希伯来人意识到民族精神时，另外一个帝国也在对米堤亚人和波斯人进行联合之后，成立了世界上规模最大的国家——波斯帝国。其实，早在居鲁士时期，巴比伦与吕底亚就已经被划入波斯国的领土之内了，而生活在腓尼基人旧址以及小亚细亚的希腊人，都是向波斯称臣的，埃及也在臣服国家之内。至大流士一世登位，他几乎认为波斯帝国应该包括全世界，而他就是所有人类的统治者。他派出使者，向埃及、中亚、印度等各处传达命令。生活在意大利、西班牙等地并未被波斯国统治的希腊人也愿意接待大流士派来的使者，并回以真诚的敬意。在当时，只有塞西亚人不肯对波斯称臣。塞西亚人是雅利安族系，其祖先还在游牧时，就有着侵略他人的习惯。
当然，波斯国领土广阔，人口众多，居民不可能都是波斯的本土人，本土波斯人多为征服者，他们对生活在波斯帝国的其他种族有着统治权力。而那些臣服于波斯的人们必须要放弃自己的语言，重新学习波斯语。这时的经济与贸易大部分都被闪米特人掌握着，他们不断在海上漂泊，并因为与希伯来人的接触，而由其民族精神及《圣经》中发现了团结、互助的好处。渐渐地，希腊人不断涌入波斯帝国，闪米特人遭受到了空前的冲击。而且，希腊人公正，富有生机，这让他们显得格外智慧、能干，从而坐上波斯国的官员之位，参与政务管理。
大流士最开始侵略欧洲，完全是因为塞西亚人的不肯合作。所以，他便产生了打击塞西亚人，并同时将他们的家乡俄罗斯南部收入自己管辖范围的想法。于是，他组织了人马，历尽千难万险，来到塞西亚人的家乡。这一路，大流士的部队非常辛苦，不但大部分人只能通过步行前进，还要为了跨河而搭建桥梁。但塞西亚人对他们的到来并不直接回应，这些人骑术非常好，总是骑马绕于大流士部队的后方，对他们进行偷袭，甚至破坏粮草。这让大流士无法进行正常征战，最终以失败撤兵。
大流士将部队驻守于马其顿和色雷斯，自己则回到首都苏萨。可就在这时，居于亚洲地区的希腊人开始了叛乱。很快，欧洲的希腊人也加入战争。不过，大流士并不将这些叛乱者放在眼中，他认为平息这些人毫不费力。所以，在公元前490年，他开始向希腊的雅典城进攻。但让他没想到的是，当部队于城市北面的马拉松靠岸时，引来希腊人的大力回击，致使大流士的船队溃不成军，一路败退。
就在这场战争中，发生了一件不同寻常的事。因为雅典当时正与斯巴达进行城邦间的战争，但当面对大流士的进攻时，他们达成了一致，共同应对外敌。大流士的船队一靠近雅典马拉松岸边，雅典就派出了长跑运动员去斯巴达送信。运动员在不到两天的时间里就跑了100多英里山路，正是这件事，成了日后马拉松比赛的开始。斯巴达在接到求援之后，用3天时间到达马拉松。可这时，他们却发现，大流士的船队已经败走，马拉松岸边也恢复了平静。波斯帝国对于希腊的第一次征讨最终以惨败收场。
大流士听到这个消息之后，没过多久便离开了人世。又过了4年时间，大流士的儿子薛西斯成为波斯帝国的统治者。在这4年间，他一直思考着如何征讨希腊。也正是在这段时间里，希腊人已经意识到了危险的临近，变得异常团结。相比而言，波斯帝国的队伍绝对比希腊队伍壮大，但是，他们的士兵来自于不同的部落、种族，远没有希腊士兵之间关系密切。薛西斯在公元前480年带着大队人马向希腊进军，当他们穿越塞尔比雷甬道时，斯巴达国王李奥尼尔早在这狭窄的通道做好了准备。但李奥尼尔的队伍只有1400人，与薛西斯大军相比人数相差悬殊。最终，他们虽然重创波斯军队，但自己也全部战死。这让薛西斯愤怒不已，他带领人马直奔雅典和底比斯。雅典人在无力抵抗的情况下逃出城去，而底比斯则无条件臣服。薛西斯命令士兵放火焚烧了雅典城。
这场波斯与希腊的战争，以希腊失败告终。但之后，这一结果却出现快速反转，希腊人似乎又成了胜利者。当时，希腊舰队只有波斯的三分之一，在数量上远远不足。可是，薛西斯负责运粮的船队被希腊击败，致使薛西斯军队补给不足，他只能带一半人马回到亚洲境内。留下的一部分人马，在公元前479年又一次被希腊打击，而他们的船队，也在米卡尔全军覆没。
至此，亚洲地区的希腊城市得到了胜利，来自波斯帝国的威胁暂时落幕。希腊的学者希罗多德便把这次战争写进一本叫作《历史》的书中，并画了很多生动的图画。为了完成对这本书的记录，希罗多德先后游历了埃及、巴比伦等地，对资料进行收集，并全面了解战争的经过。
波斯帝国在经历了麦卡利战役之后，国内权力争夺出现空前混乱，薛西斯也在公元前465年被刺死。于是，那些曾经臣服于波斯的国家重新独立出去，比如叙利亚、埃及等，如此，波斯帝国便被完全分裂开来。《历史》这本书，主要就揭示波斯帝国从强大走向分裂的原因，希罗多德认为，波斯帝国的国力其实非常弱，它不过是外面看起来风光而已。现在，很多人会认为，《历史》其实是希腊人的宣传书，它告诉所有希腊人，不要害怕波斯这样看似强大的国家，要勇敢面对挑战。希罗多德在书中就配上了阿里斯达哥拉斯的人物画，因为他曾经对希腊人说过：“野蛮的波斯人并不会打仗，但你们却擅长攻击……世界上财富最多的就是波斯帝国，而他们的财富都应该是你们的。”