在玄奘之前，中国虽然已经译出不少经典，但大多采用意译法。意译的经典，在文字的表达上固然有其优点。可是，如果用真正的翻译标准来权衡，多多少少是与原著有出入的。玄奘为改正这一弊端，乃改变古人的传统译法，另用一种新的译法，可与原著相对照，不失原义。他的这一创新改革，为中国译经史上开创了一个新纪元。后世的佛教学者，将玄奘以前的翻译称为旧译，而将玄奘及其以后的翻译称为新译。玄奘在译经期间，一面自立功课，不费寸阴，每晨圈读预译的梵文经典，以作事前准备。白天译经之余，并为大众授课，讲解经论，诠释法义，致力于培植后进，如窥基、普光、圆测、彦棕、辩机等，都是出自玄奘门下之一时俊杰。另一方面，他从事中印文化的交流工作，将中国老子的《道德经》翻译成梵文，流传印度；并将印度已经失传的佛典，如《大乘起信论》等，再译回印度。而他最伟大的工作，是关于世亲论师的《唯识三十论》，将其十大论师的诠释，撷取精要，以护法论师的注释为主，结合自己的见解，编著为《成唯识论》一书。
由于玄奘之学根于护法，传自戒贤，而弘扬无著、世亲之法统，糅合唯识十大论师之精义以为唯识新学，而折衷于护法之《成唯识论》为《唯识三十论颂》之注释书，乃瑜伽行学派所依据之重要论书。大约公元450年前后，世亲作《唯识三十论颂》。至557年前后，护法、德慧、安慧、亲胜、欢喜、净月、火辨、胜友、胜子、智月等十大论师立义互有不同，于种子论，欢喜（难陀）等立新种说，非十大论师之护月等主本种说，护法则主本新种合生说。又于四分说，火辨与陈那共立三分说，亲胜、德慧等倡二分说，安慧取一分说，欢喜、净月等主二分说。这些论点，以护法、安慧之说最为有力。玄奘原准备将十大论师之著述各译一书，其弟子窥基建议以护法观点为主，糅译诸师学说，而集成此书。
《成唯识论》之内容，是说人类存在之根本依处即阿赖耶识，其中所藏之种子，由于缘起而形成现在，同时又造作未来，因而展开宇宙之一切，期以观万法唯心所现，体证诸法之真理。其各卷之内容，已如前介绍，此不赘述。
玄奘以此书和《瑜伽师地论》等弘传瑜伽行学派之学说，故其门下注释者甚多，以窥基之《述记》、《掌中枢要》、《别抄》，慧沼之《了义灯》、智周之《演秘》为最著名。《成唯识论》成为法相唯识宗的重要典籍。唐代法相唯识宗的成立，主要便是依据此论而建立的。至今这部不朽的著作，唯识学者们仍然奉为宝典。
除《成唯识论》外，《大唐西域记》也是一部不朽之著述。《大唐西域记》是玄奘门人辩机奉唐太宗之敕令，根据玄奘述而编集成书。本书为玄奘于十六年间游历印度、西域等一百十余国与传闻中二十八国之见闻录。除有关佛教大小乘诸部传播之实情记载外，举凡地理、风俗、语言、传说、产业、政治等，皆有详细之记载。其中，有关都邑、堂塔等之标示，对于19世纪以来勃兴之印度、西域等地佛教遗迹之考证，极具指南之价值；亦为考察、研究当时印度、西域之重要史料。
该书因取材时出于梵典，所以经录家也将之视为是译本一类。实际该书应是玄奘之著述。此书一出，当时的著述家莫不讶为奇制，竞相引用，如道宣的《释迦方志》、道世的《法苑珠林感通篇·圣迹部》、慧立《大慈恩寺三藏法师传》，都是依据此书来写的。
玄奘去印度的时候，路上备尝艰辛，六十岁后，身体就时有病痛。等到《般若》译完，自知精力不济，便不再准备翻译，专门做观行功夫。麟德元年（664）二月病逝。大师病逝，唐朝皇帝哀恸伤感，为之罢朝三日。谓左右曰“朕失国宝”，凡五下御札，褒恤葬事，并令官给。玄奘大师葬日，京邑及附近五州县来送葬者百万余人，是夜宿于墓者三万余人。
玄奘大师所传唯识，对先天物理生理分析精神生命的生成功能，以论证后天作用之变化，极具科学的原理与发现。就结构心理学或机能心理学而言，其贡献于后世心理学之研究者，诚非近代西方学说所能望其项背。在我国，唐代以前只有儒、道二家论心理，或言“良知”实体，或言“精露”功能，未能深得科学之论据。玄奘承印度瑜伽行学派之法统，精研唯识学于大成之世，将其精华移入中国，使我国学者始能因唯识学之论典而为对性相有进一步之认识。其影响所及，不但为大乘佛教性相二宗所必学，亦为研究儒、道心性的学者所必知。至宋明理学论心性涵育者，虽多受中观学派之禅宗影响，然其得自唯识者如邵（雍）、张（载）、程（颢、颐）、朱（熹）之质论，显然可观，是偏重科论据，是玄奘唯识之一辙。
（第二节） 唯识三祖
窥基、慧沼、智圆三位法师，史称“唯识三祖”。
窥基（632-682），是玄奘大师的大弟子，俗姓尉迟，字洪道。又称灵基、乘基、大乘基。唐代京兆长安（陕西西安）人。他与玄奘大师共同建立了法相唯识宗，故被尊为法相唯识宗初祖。因窥基大师居大慈恩寺，故又称为慈恩大师，法相唯识宗亦被称为慈恩宗。
窥基系唐朝开国功臣尉迟敬德的侄儿，父亲尉迟宗，也是一名武将，官至左金吾将军，松州都督。窥基九岁丧父，由伯父抚养长大。自幼聪明过人，气度豪迈，举措疏略，不拘小节，有将门家风。贞观二十二年（648），他年十七岁，与玄奘大师相遇于途。当时玄奘大师回国不久，致力于译经创宗，急需有器识能嗣大业的人才。窥基相貌魁伟，禀性聪慧，玄奘见他眉秀目朗，英气勃勃，心想：“将家之种，的确不凡，倘是有缘，度为弟子，则我的事业就后继有人了。”于是便去找尉迟敬德，劝他让侄儿出家。尉迟敬德将此事奏报太宗，太宗特降恩旨，令窥基舍家从释，亲从玄奘大师剃度，初住长安弘福寺，同年十二月，随师移住新建成的大慈恩寺翻经院。或谓窥基初拒玄奘之命而不断世欲，行驾三车相随，前车载经论，中车自乘，后车载家妓、女仆、食馔，遂有“三车法师”之称，然此说恐为讹传。
窥基出家后最初几年，主要是向玄奘学习五印度语，兼学佛学基本知识。他记忆力强，领会问题快，学习进步快，闻见者无不叹服。玄奘的译场，人才济济，译经时分工细密，玄奘亲自主译，助手分别担任证义、缀文、笔受、书手等工作。其中笔受一职最为重要，必须由兼通汉梵语文，而又有广博深厚的佛学修养，在翻译过程中能够随宜解决临时遇到的各种问题者担任。窥基二十五岁参与译事，直到二十八岁之前，尚未担任笔受工作，只是充当证义一类职务，负责核查已译出来的文字在文义上是否与原文符合。唐高宗显庆四年（659），窥基大师年二十八岁时，玄奘着手编译《成唯识论》。此项工作在玄奘创立法相唯识宗的事业中，具有至关重要的意义。瑜伽行学派在我国创宗，其主要依据即一经二论：《解深密经》及《瑜伽师地论》、《成唯识论》。玄奘原打算分别将十大论师关于《唯识三十颂》的注释分别译出，安排神昉润文，嘉尚笔受，普光检勘，窥基证义。四人中，除了窥基大师是年轻新进，其余三人都是资深学者，神昉更是最早参加玄奘译场的大德之一，谙解大小乘经论，为时辈所推崇；普光在玄奘译场担任笔受已经二十五次，嘉尚也有三次。玄奘选中年轻的窥基和这三位大德一起作为编译《成唯识论》的助手，已显示出他对窥基的信任和重视。然而窥基参加这一重要译事数日后，却向玄奘提出辞职。玄奘深感惊异，再三盘问原因，才知道窥基对玄奘的计划有意见。他反对分别翻译十家之言，要求将十家之论，择旨糅译为一部。他认为印度十大论师对《唯识三十颂》立论互有不同，如果不把他们的观点集中起来反映于一书之中，中国学人便会觉得无所依禀；而人的时间精力都很有限，亦不可能一一探究各家殊义。因此，最好错综采取各家学说的精华，权衡论定，作为中国学者的准则。玄奘经过反复考虑，接受了窥基大师的主张，并且说服神昉、普光、嘉尚三师，让他们退出这项译事，而让窥基独自做自己的助手，终于编译出了如今见到的《成唯识论》，流传于后世。
《成唯识论》编译之后，窥基著《成唯识论掌中枢要》四卷，初叙《成唯识论》之成立、传来、糅译编著等因缘；次释本论之题目及所被之根机；其次解释论文，于《成唯识论述记》之未详尽处，更详释之，特别是对《唯识三十颂》科段、五种性义、三类境等重要问题，均广泛解释其论意。但文中处处可见有“如疏”或“如唯识章”之语，因此学术界有人推论此书出于《成唯识论述记》及《大章法苑义林章》之后。然《成唯识论述记》中亦有“如枢要说”、“如别章”等语，故可推知本书与《成唯识论述记》应于同时而作。《成唯识论掌中枢要》与《成唯识论演秘》、《成唯识论了义灯》三书并称为“唯识三疏”。
窥基撰叙的《成唯识论述记》一书，是以佛教论理学（因明）破斥小乘、外道，并主明万法乃由人类存在之根本依处——阿赖耶识之所现，以此而组织佛教教学。本书问世以后，成为我国唯识学之根本圣典；在日本，亦为法相宗及各宗之要典，极受推崇重视。全书内容分为五门：（1）教时机，分为说教时会与教所被机两种。（2）论宗体，以唯识为宗而谓其体有四重。（3）藏乘所摄，谓《成唯识论》为一乘之所摄，并为三藏中菩萨所摄。（4）说教年主，以慧恺之《俱舍论序》论说世亲与十大论师之年代。（5）本文判释，即就本文述释共义。盖自元代以来，本书即告失传，清末杨文会先生得之于日本，遂集缁素之力锓板刊行。
经过对《成唯识论》的编译工作，玄奘进一步看到了窥基大师的超凡出众的器识和才能，而予以重用。此后玄奘大师译典有十一部，其中《辩中边论颂》、《二十唯识论》、《异部宗轮论》、《阿毗达磨界身足论》等四部由窥基大师任笔受，窥基除《阿毗达磨界身足论》外，皆作述记。窥基受到老师特别的器重，他对老师的帮助也特别大。窥基记述玄奘之言语，至为勤勉尽心，一生撰写佛教经典疏注近百部，极力阐发玄奘大师之学说。他的著作特别知名的有四十八部，除前述二部外，再列举一二：
《瑜伽师地论略纂》，系《瑜伽师地论》之注疏，内容初依最胜子等之《瑜伽师地论释》载七言七行之归敬颂，次立所为、所因、宗绪、藏摄、释题、释文等六门，实为研究《瑜伽师地论》必读之指南。
《二十唯识论述记》，系玄奘所译世亲所著《唯识二十论》之注释书，内容首叙《唯识二十论》之著作缘起，其分三门阐释安立大乘三界唯识之义，并解释非一种拨有性等问题。本书与《成唯识论述记》皆为有关唯识学之基本入门书。
《因明入正理论疏》，内容共分叙所因、释题目、彰妨难、释本文四门。商羯罗主之《因明入正理论》自玄奘汉译之后，唐代疏解者甚多，所知凡十一家：（1）净眼，（2）神泰，（3）文备，（4）靖迈，（5）灵巂，（6）胜庄，（7）壁公，（8）文轨，（9）顺景，（10）玄范，（11）窥基。其中窥基之注疏最为详细，被称为“因明大疏”，对中国、日本研究影响甚大，为研究因明学之指南。
《大乘法苑义林章》，书中对唯识教义之组织及基本内容，如判教、唯识义理、修行理论、果位等，均详加阐释，系古来研究唯识者之珍贵典籍。内容分为二十九章，第一卷有总料简、五心、唯识义林、诸乘义林等四章。其中总料简章为本书最精要之部分，系窥基大师基于唯识之立场，以简择佛陀一代以降之教说，略分五段：（1）教益有殊门，举出小乘异部与诸大乘教各别之利益。（2）时利差别门，先叙我国历来各家之判教，次述唯识三时教之说。（3）诠宗各异门，初举古来各宗立宗之不同，后诠法相之“非有非空中道”之要义。（4）体性不同门，先示外道、小乘、大乘之教体不同，复揭示唯识宗“四重出体”之说。（5）得名悬隔门，为六合释之概说。第二卷有诸藏、十二分、断障、二谛等四章。第三卷有大种造色、五根、表无表等三章。第四卷有归敬、四食、六十二见、八解脱、二执等五章。第五卷有二十七贤圣、三科、极微、胜定果色、十因、五果、法处色等七章。第六卷有三宝、破魔罗、三慧、三轮等四章。第七卷有三身义林、佛土等二章。七卷本为现今所流行者，相传另有八卷三十三章之异本，在原二十九章外，另加非得、诸空、十二观、三根等四章。
除上述之著作外，现有窥基大师之著作者尚有《瑜伽论劫章颂》、《婆沙论钞》、《般若心经赞》、《俱舍论疏》、《法华经略记》等二十八部。可以说，法相唯识宗的主要论述，差不多都出窥基大师之手，故后世称他为“百部疏主”或“百部论主”，历来的史学家都肯定窥基在法相唯识宗创宗过程的重要作用。
特别值得一提的是，玄奘专门为窥基阐说陈那之《因明正理门论》及《瑜伽师地论》等，故使其通达因明之学及五性之宗法，为窥基奠定了唯识学祖师地位的基石，并使因明学在中国扎根，中国成为其第二故乡。玄奘大师谢世之后，窥基游五台、登太行，随处化徒，为弘扬唯识学作出了巨大的贡献。所以，历史学家公认玄奘是中国瑜伽学派的开祖，窥基为法相唯识宗的初祖。玄奘若无窥基，就无以主张其说。永淳元年（682）十一月十三日，窥基大师病逝于大慈恩寺翻经院，享年五十一岁。附葬于樊川北原玄奘大师茔陇，弟子哀恸，参加葬礼之僧俗信众漫山盈谷。可以说，窥基大师的一生，为佛教事业而献身，是一位学识卓绝、贡献巨大、深受当时及后世敬仰的佛学大师。