在此次会议中，约翰逊向艾森豪威尔表示，他想经常登门请教，希望他能给予支持。一开始，他请艾克给他一份包括具体建议的备忘录。艾森豪威尔当天晚上口授了一封电报作答。他建议，约翰逊召开一次参众两院联席会议，发表一篇不超过十分钟的演说。艾森豪威尔建议：“首先要指出，您出任总统纯属意外，也接受上帝的决定。”并让他承诺，“无意对施政的目的或政策作革命性的改变，也不会出现这种情况。”约翰逊还要承诺让预算保持平衡。
在担任总统的第一年中，约翰逊全力处理国内问题。在艾森豪威尔看来，他的内政政策与计划过于自由化。约翰逊对此也是心知肚明，所以没有垂询艾森豪威尔的意见，只是每年送上生日和节日礼物、圣诞祝福及措辞谦卑的信件。他讨好艾克的方法包括无数邀请他参加白宫宴会的邀请信，以各种借口给玛米送花，并将古德帕斯特晋升为三星上将（并不是古德帕斯特不应该得到提升，而是约翰逊有意让艾森豪威尔知道自己在这件事上卖了个人情）。1964年2月，约翰逊不管山高路远，专程赶到棕榈沙漠前来问候艾克。
每次采取重大行动之前，约翰逊都会给艾森豪威尔写信或打电话，汇报自己的意图，寻求艾克的支持，征询他的意见。虽然约翰逊写给艾森豪威尔的信中全是一些阿谀奉承之词，但他请求艾克给予指点的态度却相当诚恳，对于收到的意见也很重视。毕竟约翰逊入主白宫的时候，在外交事务方面几乎全无经验。在整个50年代之中，他在每场外交政策危机中都听从艾森豪威尔的判断。像其他政界人士一样，他将艾森豪威尔将军视为美国最智勇双全的军人。他显然注意到，艾森豪威尔公开支持的越南政策对自己有着非同寻常的意义，他在这方面利用艾克无非是为了他自己的利益。有关记录证明，当约翰逊就越南战争作出重大决定时，他征询了艾克的意见，并且受到了后者的影响——只是在越南作战这个基本问题上没有得到指点。
艾克的意见还是一如既往地好战。艾森豪威尔对约翰逊越南政策的批评，重点就是约翰逊没有尽力而为。艾克对肯尼迪的外交政策也持同样的意见。作为一个局外人，艾克在这两件事情上显得非常好战，更愿意采取激进行动。
1964年，约翰逊开始实施“滚雷行动”，对越南进行轰炸。他还不管顾问们的反对，开始派美国作战部队进入越南。1965年3月12日，艾克给约翰逊去信表示完全支持，并称总统做得对。约翰逊在回信中写道：“您总是能深知我心。能够得到您的指点、关注与友谊，这对我意义非凡。”
1965年2月起，约翰逊每隔两周，就会派古德帕斯特前往棕榈沙漠或葛底斯堡向艾克介绍当前的局势，并听取他的意见。这些会议通常要持续两至三个小时。在首次会议中，艾克告诉古德帕斯特，“他强烈建议，要摆脱制约，延迟办事过程。在许多情况下，华盛顿在管理中过于注重细节才造成了这种局面。之所以有这种行为，通常是因为政府官员缺乏经验。”艾克请古德帕斯特告诉约翰逊，“让威斯特摩兰放开手脚。”总统应该为最近出任驻越美军司令的威廉·威斯特摩兰将军提供他所需的一切，然后让他放手作战。他觉得这“非常重要”。
6月16日，古德帕斯特在葛底斯堡介绍情况时说，总统想知道艾克对于派往越南的美国援军的使用与规模有何看法。参联会只想派空降师的一个旅，用它来保卫沿海基地。威斯特摩兰想要整个师，并用这个师在南越发动攻势。艾克“对这问题思考了很长时间”。随后他说“我们如今在南越动了武，因此必须取得胜利。为了实现这一目标，只是固守或静观待变并不可取。他还说，如果没有充分使用基地，那么设立这些基地也就没有什么用。建立这些基地的唯一理由，就是为了发动攻势，消灭这一地区的敌人。”因此他认为“威斯特摩兰将军的建议应该得到支持”，并说“他对威斯特摩兰将军印象深刻”。
1965年7月2日，艾森豪威尔打电话给约翰逊。罗伯特·肯尼迪和迈克·曼斯菲尔德参议员对于越战升级的批评越来越强烈。艾森豪威尔请约翰逊不要理会他们。他说：“一旦你在国际局势中动用武力帮助一个国家，你就必须全力以赴！这是战争，只要敌人正在向那个地方派兵，我的建议就是你要尽力而为！”他建议，约翰逊应该告诉苏联人，如果他们“不达成某些共识，我们就不得不全力出击”。
当时约翰逊曾忧虑地问艾森豪威尔：“您真的以为我们能够打败越共吗？”这是他第一次在艾克面前流露出不自信。艾克回答得非常谨慎。他说，这一点很难判断，因为这取决于北越和中国的立场及约翰逊的决心。仍然愁眉不展的约翰逊说，如果他进一步升级战争，“我们会失去英国和加拿大的支持，在世界上成为孤家寡人。”艾克立即答道：“我们还有澳大利亚人和韩国人，还有我们自己的信念。”
1965年8月，艾森豪威尔一直都保持着好战的立场。8月3日，他告诉古德帕斯特：“我们不应根据最低需求采取行动，而是应该用压倒性的力量横扫敌人。”他想“立即对港口布雷，告诉世界各国将船舰撤离海丰，明确表示该地区不受保护”。他抱怨“对他来说，我们做任何事都有太多的阻力。”古德帕斯特说，参联会担心美军在越南分散了力量，苏联可能会趁机在欧洲发动进攻。“艾森豪威尔将军说，他不担心这一点。如果我们卷入欧洲战争，他不会派大批部队前往欧洲，而是会动用手中的所有核弹。”
8月20日，古德帕斯特报告美军在朱莱实施了“搜索与摧毁”行动。艾森豪威尔说，“就应该这样做。这才显得很专业，做得既快又好。”他请古德帕斯特告诉约翰逊，“他完全支持总统所做的一切。他坚决支持。”
到了1965年10月，约翰逊的主要地面增援部队开始进入越南。艾克大为振奋。他告诉古德帕斯特：“我们现在必须投入足以赢得胜利的兵力。宁多勿少。他认为，我方压倒性的力量能够使敌人丧失士气，减少伤亡。”艾克警告说，向越南派遣兵役制部队将引发重大的公共关系问题，但他认为约翰逊应该只派正规军或志愿兵以避免这一问题。古德帕斯特说，上面两种兵员存在不足。
1966年1月，约翰逊征求艾森豪威尔的意见，问是否要向某些参加过二战的退休将领咨询对越作战的问题。艾森豪威尔表示反对。“他说，没有人比得上威斯特摩兰。关键在于为他提供方便，让他能够自主行事。”两周之后，约翰通过古德帕斯特问艾克如何评估“固守”战略，也就是在基地和城市周围挖掘战壕，同时放弃在后方的攻势。“艾森豪威尔将军表示，他坚决反对这样的建议。它们将使我们失去获胜的希望，实际上只会导致我方的彻底失败。”
艾森豪威尔开始担心旷日持久的战争将影响到民众的支持度，并预见到了反战示威，但随着反战声浪的高涨，他也越来越愤怒。1966年10月，他在给尼克松的信中写道：“看起来，越南战争使某些沮丧的党派分子叫苦连天，而没能使所有美国人团结起来解决国家难题。”他抱怨道，“某些学生自私、懦弱地大发牢骚。虽然他们出于无知与鲁莽，但他们不负责任地对高层官员大加批评，对美国支持国际友人的守信行为大加谴责。”
但是不管反战如何高涨，艾森豪威尔不相信美国会落荒而逃。1967年2月，他在给乔治·汉弗莱（他曾告诉艾克，说他担心约翰逊会展开谈判，“让孩子们回家”，借此再度当选）的信中写道，“美国在越南牺牲了许多人，我不相信它会接受任何协议。我们的民众会认为这种协议‘不可信’。”
艾克想要胜利，而不是谈判。而且他想速战速决。1967年4月，他请古德帕斯特告诉约翰逊，“‘渐进主义’……注定毫无效率。”为了说明问题，他引用了自己最喜欢的例子：如果某位将领派一个营去攻占一座山，他能够完成任务，但在此过程中会遭受重大伤亡。如果他派出一个团，伤亡就会大大减少。
7月，艾森豪威尔感到万分沮丧。他告诉记者，自己强烈反对“渐进主义战争”，催促国会对北越定点。他说，这场战争“将成为首要任务。其他的目标不管有多么诱人，都应退居二线”。10月，他说美国应该“千方百计赢得胜利”。当被问到他是否将为核武器的使用划定界限时，他答道：“我不想自动排除某些可能。当你在国外动用武力推行美国的政策时，你没有什么约束。”
1967年11月28日，艾森豪威尔和布雷德利在葛底斯堡通过全国广播公司发表了电视讲话。这两位老将军有段时间曾与杜鲁门一起参加过一个“争取越南和平与自由公民委员会”的团体。布雷德利说，这个委员会的宗旨是帮助美国人民了解越南战争，因为“我们认为，当他们理解这场战争时，就会支持它。”艾森豪威尔认为，如果调整战略与战术，美国能够取得军事胜利。他说，“我觉得你们可以不用太在意地图上的边界线。”他提议“从海上或山上”对北越实施突然袭击。“……我赞成采取被大家称作‘穷追猛打’的战术，直取柬埔寨和老挝。”最后，他激烈批评了“吸毒者”、“嬉皮士”及其他谈论投降的人。
但艾森豪威尔心里明白，想要退出战争的人并非只是吸毒者和嬉皮士。他私下里告诉古德帕斯特，“来看望他的人，有许多既不是鹰派也不是鸽派，但他们都在沮丧地谈论越战的进程。他们说，诸事不利，可能现在撤出比继续打下去要好。”古德帕斯特慷慨激昂地作了回答。他坚持说，一切进展顺利，胜利已然在望。艾克受到了鼓舞。“他说，他对我们赢得这场战争持乐观态度。”
又一场总统选举即将到来。越战带来的痛苦显然将成为重要议题。1967年10月，艾森豪威尔泛泛地谈到了他理想中的候选人。他说：“我没有将自己视为传教士，不想改变任何人的信仰。但是如果有共和党或民主党建议我们撤出越南，背诵在越南牺牲的一万三千名美国人的名字时，他们将与我展开较量。这将是使我走遍全国进行演讲的少数几件事之一。”
1968年初，艾森豪威尔在《读者文摘》上发表了一篇论述战争的文章。他在写到反战运动时说，“当前甚嚣尘上的对抗远远走出了体面的争论……这是造反，近乎叛国……我个人不会支持所有鼓吹投降，放弃南越，希望不惜代价换取和平的候选人。”
与此同时，越共发起了春节攻势。他们伤亡惨重，但这在美国产生了近乎恐慌的反应。无人预料到，也没有人想到越共人数如此众多，行动如此协调一致。这使艾森豪威尔想起了人们对“突出部战役”的反应。当时他要求增援，以便扩大阿登地区的战果时，盟国政府给了他完成战役所需的兵力。但是在1968年，约翰逊政府非但没有给威斯特摩兰派出他扩大战果所需的增援部队，反而限定了驻越美军的兵力。与此同时，采用反战纲领的尤金·麦卡锡参议员在新罕布什尔民主党的初选中与约翰逊对决，表现极其出色。罗伯特·肯尼迪参议员也出马反对总统。
约翰逊曾向艾森豪威尔承诺，他将坚持到底。但是却在全国电视讲话中宣布，将停止对北越多数地区的轰炸，而且将退出竞选。艾森豪威尔大为恼怒。他大骂约翰逊临阵脱逃的话实在不宜见诸报端。古德帕斯特接受了新的任命，艾森豪威尔与约翰逊政府的关系就此终结。
越南是艾森豪威尔在60年代中期感到不快的主要原因之一。对艾森豪威尔来说，长发、嬉皮士、摇滚乐、大量青少年吸毒及贫民区骚乱都是令人深感惋惜的事。1965年，他在一封给英国友人的信中写道：“蔑视法律，衣着、外表、思想和举止方面的散漫，学生运动和其他不服管束的群众运动都有一个共同的原因：不关心古老美德，不尊重法律、长者和传统爱国主义思想。”
他认为，道德堕落、品位丧失的主要原因是国家领导人素质的下降。这一点至少在1968年的总统选举中能够看出来。他无法回避共和党1964年败选的个人责任，因为他没有批评巴里·戈德华特，也没有支持某个他自己选择的候选人。他决心不再重蹈覆辙。
他推举的候选人就是尼克松。在1968年，他不像在1960年时那样举棋不定。这并不是他对尼克松的评价有所提高，而是他没有选择的余地。其他候选人如纳尔逊·洛克菲勒、乔治·罗姆尼和巴里·戈德华特由于各种原因都无法令人接受。在艾森豪威尔看来，尼克松要比民主党候选人好过千百倍。