林凤祥怒道：“胡虏占我河山涂毒中华，你恬不知耻助妖为孽，今日遭擒非但不思悔改，反而口出狂言，不杀你天理难容。”
陆建瀛临死还嘴硬，刚说声：“要杀便杀、、、”林凤祥就挥刀砍去，寒光闪处陆建瀛人头落地，可嘴里仍然发出最后四个字：“不必多言。”
下午时分，林凤祥所率敢死队正向南京城纵深推进，突然遇到两千满族旗兵的拼死阻击。敢死队伤亡很大，暂时停止前进。
与此同时，南面李开芳部从聚宝门、汉西门、水西门攻进城来；殿左二检点朱锡琨率大部队由仪凤门缺口前来接应林凤祥。几处兵马基本控制了南京外城局势。
当晚，双方疲劳各自休兵。次日晨，李开芳、林凤祥同时由南北两面夹击内城。太平军人数多出清军十倍，而且还在不断增兵。
江宁将军祥厚站在内城明故宫的高殿上，声嘶力竭地大喊：“弟兄们，我们是朝廷派驻金陵的精华，我们是优秀的满族旗人，我们与长毛发匪势不两立、不共戴天，只要我们活着一人，就不要让发匪安稳地进入内城。”
这两千旗人拼死抵抗，战斗十分激烈，无奈兵力太少顾此失彼。太平军架云梯四面登城，用强攻打进内城。一场惊心动魄的肉搏战之后，两千满族旗兵悉数全歼，江宁将军祥厚、副都统霍隆武死于乱军之中。
自此，太平军占领全部南京城。收拾打扫战场，恢复社会秩序，安定城内百姓，从容干好这些战后工作后，东王、北王、翼王先后由聚宝门、仪凤门、水西门进入南京城内。
洪秀全坐在八抬大轿上，由聚宝门入城，受到热烈欢迎。他对那些鞭炮锣鼓、狂热欢呼早已习以为常。他心里只是略有激动，面带微笑地看着人们，任轿子抬进两江总督署。
总督署改为天王府，洪秀全住进去以后，就深居简出，很难离开王府了。
占据南京以后，广大天军将士依然保持良好军风纪，不抢掠、不滥杀、不、、、。男女分营居住，既夫妻不得同宿。只有洪秀全、杨秀清、韦昌辉、石达开等四个王爵有女眷随馆居住，这已是公开的秘密。
太平军一到南京便开始实行有饭同食，有衣同穿的“共享太平”生活。他们开仓放粮救济贫苦，给百姓带来福音。广大劳苦民众感到盼来了救星，情不自禁地唱起歌谣表达心声：“早也盼，晚也盼，太平军来了穷人安；你不怕，我不怕，太平军来了富人怕。”
“洪杨到，百姓笑，白发公公放鞭炮，三岁孩童扶鞍马，乡里大哥吹角号。”
贫穷落后的广大民众主观上希望出现一个救苦救难的救世主，初入南京城的太平军正好迎合了这一民众心理。
占领南京，无疑是太平天国军事上的重大胜利。此时长江以南清军兵力极为薄弱。如果太平军集中精力巩固江南半壁河山，彻底扫除后顾之忧再行北伐，也许能够统一整个中国。但是，最高首领们被胜利冲昏了头脑，以为既得金陵天下大定，进了南京就等于进了小天堂，可以营建安乐窝了。一到南京就开始大兴土木扩建宫殿。战略上也出现麻痹轻敌。