首次飞行试验的成功，证明我国研制的飞船和新型运载火箭性能优良，新建的载人航天发射场和航天测控网具有先进水平。这次飞行试验中进行的空间遥感和环境监测以及空间材料、生命、天文和物理科学试验，拓宽了我国和平利用空间的领域。
飞船返回时，返回舱与轨道舱分离，轨道舱在太空轨道继续运行，并按计划开展预定的科学实验工作。返回舱返回地面，经确认完好无损，于23日运抵北京。次日，在北京空间技术研制中心大厅，"神州"号试验飞船举行了开舱仪式。工作人员打开返回舱封盖后，首先取出一个盒子，里面装着具有象征意义的中华人民共和国国旗和中华人民共和国澳门特别行政区区旗，还有一条参与这次工作的全体工作人员签名的红色条幅。这面国旗将于2000年1月1日升起在天安门广场上空，澳门特别行政区区旗也将于澳门回归祖国的那一天在澳门特别行政区飘扬。随后，工作人员又从舱内取出一个邮包，里面是3000枚纪念这次重大事件的纪念封和一些邮票。此外，在这次具有历史意义的飞行试验中，"神州"号返回舱内还搭载了许多物品。中国空间技术研究院和有关单位的专家们将抓紧时间分析各种数据，以带动我国航天事业及相关科技和产业的发展，并为将来航天员上天作好技术准备。
月8日，中华全国总工会向为载人航天工程第一次飞行试验做出突出贡献的先进集体和先进个人颁发了全国五一劳动奖状和全国五一劳动奖章。此前，中国运载火箭技术研究院于12月3日给"神州"号的功臣——王德臣等5位科学家颁发了特等"长征奖"，每人奖金10万元。载人航天一直是国际航天界十分关注的一个高科技领域。我国发展载人航天技术，对促进科技进步，增强综合国力和国防实力，增强民族自豪感和凝聚力，都具有重要意义。我国载人航天工程自1992年实施以来，取得了预期的效果。工程的研制和建设，体现了中国特色和技术进步，为走出一条符合我国国情的发展载人航天的路子进行了有益的探索；攻克了大量的关键技术，掌握了许多新技术、新工艺，提高了我国航天技术及相关技术的整体水平；培养了一支跨世纪的航天科技队伍；使我国拥有了一批载人航天工程设施，为我国航天事业的持续发展奠定了坚实的物质技术基础；丰富了我国大型航天工程管理经验。首次飞行试验的成功，表明中国人民完全有能力独立自主地攻克尖端技术，在世界高科技领域占有一席之地。我国科技专家将对这次试验结果进行科学分析，在完善各系统方案的基础上，今后还要进行若干次无人飞行试验，最终实现我国载人航天的历史性突破。
澳门回归祖国怀抱年12月19日深夜，中葡两国政府澳门政权交接仪式在澳门文化中心花园馆隆重举行。12月20日零时，伴着雄壮的《义勇军进行曲》，中华人民共和国国旗和中华人民共和国澳门特别行政区区旗庄严升起，标志着中国政府恢复对澳门行使主权，澳门终于回到祖国怀抱。
澳门自古以来就是中国的领土。16世纪中叶，澳门被葡萄牙逐步占领，1840年鸦片战争后，葡萄牙人攫取了对澳门的管治权。在经历了400多年的风雨归程之后，澳门终于回到祖国怀抱，这是中华民族的一大盛事。
改革开放的深入发展，"一国两制"构想的提出，为澳门回归提供了坚实的基础。1987年4月13日，中葡两国经过友好谈判，发表了《中华人民共和国政府和葡萄牙共和国政府关于澳门问题的联合声明》，澳门由此进入12年的平稳过渡期。在中葡两国的积极合作基础上，双方妥善解决了澳门回归中国的各种历史遗留问题，为顺利回归准备了条件。
年5月5日，全国人民代表大会澳门特别行政区筹备委员会在北京宣告成立，筹建澳门特区的工作正式启动。在一年半的时间里，筹委会完成了全国人大常委会赋予的9项任务，包括：筹组澳门特别行政区第一届政府；产生第一任行政长官人选报中央人民政府任命；制定第一届立法会和司法机关的具体产生办法；提出与平稳过渡有关的重大法律问题的处理意见，以及研究涉及澳门经济、社会、文化等各个方面平稳过渡的许多问题；提出特区成立庆典仪式和庆祝活动方案等。1999年5月15日，何厚铧当选为特区首任行政长官人选；20日，国务院任命何厚铧为澳门特区第一任行政长官，澳门从此进入"澳人治澳"、"高度自治"的时代。
经过紧张而有序的筹备，隆重、庄严的中葡澳门政权交接仪式如期举行。12月19日23时42分，政权交接仪式开始。葡萄牙总统桑帕约在讲话中说，两国就澳门地位协议的最终达成，充分体现了双方在此问题上的实事求是态度及和平方式解决问题的智慧，使两国之间数世纪的悠久关系步人一个新时期。23时58分，葡萄牙国旗和澳门市政厅旗缓缓降下。20日零时整，军乐团奏响中华人民共和国国歌，中华人民共和国国旗和澳门特别行政区区旗冉冉升起。至此，中葡两国政府完成了澳门政权的交接。国家主席江泽民随后讲话，他说，从这一刻起，澳门的发展进人一个崭新的时代。澳门回归后，中国政府将坚定不移地贯彻执行"一国两制"、"澳人治澳"、高度自治的方针。江泽民说，中国政府按照邓小平提出的"一国两制"的伟大构想，成功地解决了香港、澳门问题，这是中国人民在完成祖国统一大业中取得的重大进展。"一国两制"在香港、澳门的实践，已经并将继续为我们最终解决台湾问题发挥重要的示范作用。中国政府和人民有信心有能力早日解决台湾问题，实现中国的完全统一。他相信，回到祖国怀抱的澳门，必将迎来更加美好的未来。
月20日凌晨，中华人民共和国澳门特别行政区成立暨特区政府宣誓就职仪式在澳门综艺馆隆重举行。1时45分，江泽民主席宣布：中华人民共和国澳门特别行政区政府成立。1时47分，在国务院总理朱镕基监誓下，澳门特区首任行政长官何厚铧郑重宣誓：本人就任中华人民共和国澳门特别行政区行政长官，必当拥护并负责执行中华人民共和国澳门特别行政区基本法，效忠中华人民共和国及其澳门特别行政区，尽忠职守，遵守法律，廉洁奉公，致力于维护澳门的稳定和发展，对中央人民政府和澳门特别行政区负责。1时49分，澳门特区政府主要官员、立法会主席、终审法院院长、检察院检察长宣誓就职。随后，特区行政会10名委员、立法会23名议员、各级法院23名法官、检察院23名检察官分批走上主席台宣誓。国务院总理朱镕基在宣誓结束后致辞，他说，从今天起，《中华人民共和国澳门特别行政区基本法》开始实施，澳门特别行政区政府开始行使职权。中央人民政府将全力支持行政长官何厚铧先生和他领导的澳门特别行政区政府的工作。希望特区官员继续发扬澳门同胞爱国爱澳的光荣传统，全面贯彻落实澳门特别行政区基本法，恪尽职守，为保持澳门的长期稳定和发展作出自己的贡献。
日上午11时20分，中国人民解放军驻澳门部队约500名官兵分乘10辆装甲车和60多辆汽车，从珠海营地出发，并于下午1时全部到达位于澳门东望洋山下的龙成大厦临时驻地。这是100多年来中国政府派遣的第一支军队正式进入澳门，这是中国政府对澳门恢复行使主权的重要标志。从20日起，驻澳部队开始全面担负起澳门特别行政区的防务。
澳门回归祖国，是继香港回归之后中华民族的又一盛事，在澳门、在北京，在全国各地、在海外，中华儿女都在欢庆这一盛事的到来。20日夜，中共中央、全国人大常委会、国务院、全国政协、中央军委在首都体育馆隆重举行"首都各界庆祝澳门回归祖国大会"，国家主席江泽民在会上讲话指出，我国政府对澳门恢复行使主权，中华人民共和国澳门特别行政区正式成立，是我们完成祖国统一大业的又一个重要里程碑。他说，澳门与祖国的分离和团聚，是近代以来中华民族发展历史的一个缩影。昔日的澳门，是在旧中国积贫积弱、备受欺凌的情况下被葡萄牙逐步占领的。今天的澳门，是在新中国昂首阔步走向繁荣富强的进程中胜利回归的。这一历史性变化，充分显示了当代中国和中国人民的强大力量。邓小平同志提出的"一国两制"伟大构想，是我们解决香港、澳门和台湾问题，实现祖国完全统一的唯一的正确方针。中央政府将坚定不移地实行"一国两制"、"澳人治澳"、高度自治的方针，保持澳门现行的社会、经济制度不变，生活方式不变，法律基本不变。江泽民说，遵循一个中国的原则，实现中国的完全统一，是包括台湾同胞在内的全中国人民的共同意愿，是历史发展的必然趋势，任何势力都无法阻挡。我们希望台湾当局不要再背逆历史潮流，不要再为两岸关系的发展设置障碍，不要再做损害台湾同胞和整个中华民族根本利益的事。中国政府和中国人民对任何分裂中国的企图都绝不会坐视不管。在"和平统一、一国两制"方针的指引下，我们有决心也完全有能力早日解决台湾问题，完成祖国统一的伟大事业。
同一天，澳门市民也纷纷涌上街头，以空前规模的巡游庆贺澳门的回归，抒发对澳门美好未来的期盼。
澳门回归祖国，对中国人民而言，有着特殊的意义。它证明了我们国家的日益强大，证明了中华民族巨大的凝聚力和向心力。澳门的回归，也为台湾问题的解决再次提供了一个成功的范例。这是中华民族送给世纪之交千年之替的一份厚礼。