隋炀帝逃往江都后，江淮郡官谒见时，“专问礼饷丰薄，丰则超迁丞、守，薄则率从停解”。如江都郡丞王世充，献铜镜屏风，升任通守，历阳郡丞赵元楷，献异味，迁江都郡丞。“由是郡县竞务刻剥，以充贡献”，广大农民所受压榨更加厉害，“生计无遗”。因此，在大业十三年（公元617年）里，农民起义军继续在各地进行反隋斗争，并有不少义军崛起。
卢明月进攻河南，转战淮北，“众号四十万”，隋炀帝命王世充征讨。两军会战于南阳，义军失利，卢明月牺牲，义军溃散。
弘化（今甘肃庆阳）人刘击成聚集万余人起兵反隋，声震傍郡。
徐圆朗率数千义军攻破东平郡，分兵攻郡打县，占有琅邪以西、北至东平一带，义军发展到二万余人。
王子英聚众起义，攻破上谷郡。
庐江（今安徽合肥）张子路义军，被隋右御卫将军陈镇压。陈复渡清江击宣城义军。李通德率义军“十万寇庐江”，被隋左屯卫将军张镇州击破。
房宪伯义军攻占汝阴郡（今安徽阜阳）。
原州（今宁夏回族自治区固原）“奴贼”数万人，围攻扶风郡，太守窦据城顽抗。经数月围攻，义军食尽，多有离散，其中千余骑归附起兵歧、雍间的地主武装首领丘行恭。丘行恭利用归附的酋渠进行劝降，同时率五百人携牛酒、米麦伪装慰劳，杀害奴帅，兼并了这支奴军。
太原（今山西太原）人阳世洛聚众万余人攻打城邑。武贲郎将高毗败济北郡甄宝车义军于山（在今山东聊城东南）。颍川（今河南许昌）沈柳生义军攻打割据罗川的隋官肖铣，后者作战不利，遂以中兴肖梁相欺骗，沈柳生归附肖铣，旋被杀害，义军溃散。
康老和聚众起义于张掖（今甘肃张掖）。南海（今广东广州）义军竞起，多次攻打郡城，太守刘权倚城固守。
桂阳（今湖南郴县）人曹武彻举兵反隋，建元通圣。
张善安义军攻占庐江郡。
灵寿（今河北灵寿）郗士陵聚众数千反隋。
大业末年聚众起义，或活动于这个时期的农民起义军则有：
李青蛙起义于淮左（今安徽境内），后为隋将刘德威杀害。
起义丹阳（今江苏南京）的吴棋子义军，俘获奉隋炀帝之命于上江督运的原丹阳留守刘子翊，“子翊说之，（吴棋子）因以众降”。
长白山义军在淮阳郡（今河南淮阳）城大败隋军。
虢州卢氏（今河南卢氏）张士贵聚众起义，“攻剽城邑，远近患之”。
邵江海据歧州（今陕西凤翔）起义，号新平王，隋炀帝命陇州刺史叔孙老征讨。
并州（今山西太原）王君廓，大业末年聚众反隋，攻打夏县（今山西夏县）、长平（今山西晋城东北），河东丞丁荣一面拒战，一面遣使招降。王君廓伪称归降，“（丁）荣轻之，因陈兵登山，君廓悉伏甲山谷中。荣军还，掩击，破之”。王君廓又与韦宝、邓豹等义军联合攻打虞乡（今山西永济）等地。
杨厚起义军进攻北海县，生俘前来刺探军情的石门府队正松，义军后被隋炀帝派来的户曹郎郭子贱击败。
此外，尚有一些起兵者，因史籍记载简略，仅言某人据某地，难以判断其为农民起义还是地主起兵，只好留待以后查考了。
总之，从大业七年开始的农民大起义，到隋末，除“剑南独无寇盗”外，其他地方几乎无处不有。史称农民起义“星离棋布，以千百数”，“相聚萑蒲，毛而起，大则跨州连郡，称帝称王；小则千百为群，攻城剽邑”，“小盗阻山泽者万数”，“自燕、赵，跨于齐、韩，江淮入于襄、邓，东周洛邑之地，西秦陇山之右，僭伪交侵，盗贼充斥”。参加起义的人，有“避征役者”、无产业者、渔猎之手、盐户、奴婢、儒生，下层僧道、少数民族、逃兵、商人和中、小地主等，就是说，隋炀帝的暴政及其对民众造反进行血腥镇压，激起了不同阶级，阶层和各民族人民的普遍愤怒，几乎全体民众都加入了这场反暴政的斗争行列，其势犹如大海的怒涛，席卷了神州大地，猛烈地冲击着隋王朝的反动统治。色厉内荏的隋炀帝见天下危乱，“意亦扰扰不自安”，终日长醉浇愁，贮毒药以备随时自尽，对镜哀鸣“好头颈，谁当斫（砍）之”。
§§§第四节瓦岗、河北和江淮三大义军的斗争
从大业七年起义爆发以来，经过七个年头的战斗洗礼，农民起义军由小到大、由弱变强，逐渐克服地域观念，加强团结，相互支援，从分散活动、走向联合作战。至大业十三年左右，在全国范围内形成了三支强有力的起义集团军，这就是翟让和李密领导的瓦岗军，窦建德和刘黑闼领导的河北义军，杜伏威和辅公领导的江淮义军。这三大义军的形成，标志着隋末农民大起义进入了一个新阶段：
一、翟让和李密领导的瓦岗军
瓦岗军是隋末农民大起义中举义最早、发展最快的义军之一。创始人翟让，东郡（今河南滑县东南）韦城人。自称“起陇亩之间”，曾任东郡法曹，“坐事当斩”，狱吏黄君汉“奇其骁勇”，放他逃走，翟让遂在大业六年底，聚众起兵于东郡之瓦岗寨（今河南滑县内）。同郡人单雄信“骁健，尤能马上用枪”聚少年前往参加。济阴郡离狐（今山东菏泽北）人徐世，年十七，有勇略，家富于财，也参加了瓦岗军。翟让接受徐世提出的在汴水所经的荥阳郡（今河南郑州）和梁郡（今河南商丘）边界，夺取公私行舟的货物的建议，因而“资用丰给，附者益众，聚徒至万余人”。瓦岗军不少是“齐、济间渔猎之手，善用长枪，华驺龙厩细马所向江都者，多为（翟）让所劫，故其兵锐于他贼”，曾多次粉碎隋王朝围剿。大业十二年（公元616年），翟让在李密的辅佐下，攻下金堤关（今河南荥阳东北）及荥阳侧近诸县、城堡，直接威胁东都洛阳的安全与运河的畅通。隋炀帝命荥阳太守王庆，及河南道十二郡黜陟讨捕大使张须率二万隋军征讨。张须曾血腥镇压过山东地区许多支义军，号为“名将”，深受隋炀帝器重，由齐郡丞擢为仅次于太守的通守，“画须、（及其部将罗）士信战阵之状而观之”，其部素称隋军劲旅。曾屡为张须所败的翟让，听说他又来征讨，“大惧”，欲远走逃避。李密说，张须骄狂寡谋，可以智取。翟让遂“阵而待，（李）密率骁勇常何等二十人为游骑，伏千兵莽间”。张须一贯轻视翟让，引兵打阵，翟让迎战不久即佯败而去。张须驱兵追击十余里，及至大海寺（今河南荥阳东北），伏兵自丛林中骤起猛攻张须后队，翟让亦率军回马反戈围击隋军，隋军大溃。张须反复突围，终不能出，乃仰天哀叹：“兵败如此，何面见天子”，被瓦岗军斩杀于阵。付将贾务本“亦被伤，帅余众五千余人奔梁郡，务本寻卒”。义军乘胜攻占河南地区军事重镇荥阳。这是瓦岗军取得的一次重大胜利，大长了农民起义军的威风，而隋王朝的“河南郡县为之丧气”。
义宁元年（公元617年）二月，天下饥馑，隋王朝粮仓里粟米山积，却不赈济饥民，民众异常愤怒。李密对翟让说，东都空虚、兵不素练，越王年幼，政令不一，士民离心。倘若将军亲帅大军，轻行掩袭，攻占兴洛仓，“如拾遗耳”，发粟济赈穷人，“百万之众，一朝可集”，然后枕威养锐，以逸待劳，檄召四方，天下则指麾可定。翟让采纳了这个夺取粮仓、壮大义军的正确策略。并与李密一起亲率精兵七千出阳城（今河南登封东南）北，方山（今河南登封东北），自罗口（今河南巩县西南），一举袭取兴洛仓。“开仓恣人所取，老弱襁负，道路不绝，众至数十万”。由于翟让袭占兴洛仓不仅救济了广大饥民，获得了大批军粮，壮大了队伍；而且切断了东都洛阳的重要粮食供应基地，使其失去了一个有战略价值的要地。
洛阳留守、隋炀帝之孙越王侗，急命贲郎将刘长恭，光禄少卿房率东都步骑二万五千，屯兵虎牢（今河南汜水西北）的河南讨捕大使裴仁基等率所部，约于二月十一日会师仓城南，前后两面合击瓦岗军，妄图夺回兴洛仓，以稳定河南政局。
翟让侦知越王侗的作战计划，遂把骁将劲卒分作十队，以四队伏于横岭（今河南巩县东），对付从虎牢而来的裴仁基，其余六队布阵于巩县东南石子河东岸，迎战隋军主力刘长恭部。刘长恭率领的东都兵先到，士卒未食早饭，他便驱使士卒渡过洛水，布阵于石子河西，见瓦岗军少，不等裴仁基军会师，就攻打义军。翟让所率义军失利稍退，李密率部从侧翼猛击刘长恭，隋军饥疲大败，死者十之五六，刘长恭易服潜逃。裴仁基闻风“惧不敢进”，屯兵百花谷（今河南巩县东南），固垒自守，“东都震恐”，瓦岗军声威远扬。
在取得这次大捷后，翟让等推李密为主，上其号魏公，设坛场即位，称永平元年，其文书行下，称行军元帅，魏公府置三司、六卫，元帅府置长史以下官属。李密拜翟让为上柱国、司徒、东郡公，亦置长史以下官，减元帅府之半。以房彦藻、邴元贞为左、右长史，杨德方、郑德韬为左、右司马。命筑洛口城，方四十里而居，建立农民政权。又命护军田茂广造云三百具，以机发石，号“将军炮”，进逼东都。于是赵魏以南，江淮以北的农民起义军莫不响应。“孟让、郝孝德、王德仁及济阴房献伯、上谷王君廓、长平李士才、淮阳魏六儿、李德谦、谯郡张迁、魏郡李文相、谯郡黑社、白社、济北张青特、上洛周比洮、胡驴贼等”，均前来归附，李密一一拜官，使统其众，“置百营簿以领之，道路降者不绝如流，众至数十万”。有些反隋地方武装首领也归附李密。
李密遣将攻取安陆、汝南、淮安和济阳，河南诸郡相继多为瓦岗军控制。同年四月，李密命孟让率步骑二千夜入东都外郭，袭扰隋军。巩县长柴孝和、监察御史郑、淮阳太守赵陀和裴仁基等投降瓦岗军。李密命裴仁基等帅二万余人袭破回洛东仓，烧东都天津桥，后为隋军击败，还保巩县。李密亲自率兵攻打偃师、金墉，失利，撤回洛口（今河南巩县东北）。当时，东都守军尚多达二十余万，越王侗使人运回洛仓米入城，又在东都之北的北邙山、城东上春门和丰都市等地扎营九座，首尾相应。隋军昼夜不解甲，防御十分强固。李密率三万义军复据回洛仓，大修营堑，以逼东都。隋将段达等出兵七万拒战。两军战于回洛仓北，段达败走。
在瓦岗军积极围攻东都的同时，各地义军也都有很大发展。徐圆朗义军攻占鲁郡，封民赡义军席卷平原之境，郝孝德义军据有黎阳仓储，李士雄义军虎视于长平，王德仁义军扬威在上党，刘兴祖义军起于北朔，崔白驹义军发难颍川，房献伯义军占领谯郡，孟海公义军又破济阳，“各拥数万之兵，俱期牧野之会”。李密遂乘此大好时机，向天下郡县发布檄文，列举隋炀帝杀父害兄、乱伦、沈溺酒色、广营宫苑台榭、科税繁重、游览劳民、征伐高丽、嫉害忠良、政以贿成和言行无信等十大罪状，号召民众推翻这个“罄南山之竹，书罪未穷；决东海之波，流恶难尽”的独夫民贼及其黑暗统治，并鼓励隋官见机而作弃隋归降，“天下震动”。隋炀帝在江都，风闻瓦岗军的浩大声势，“惧留淮左，不敢还（东）都”。
越王侗遣太常丞元善达赴江都求救，说李密有众百万，围逼东都，城内无食。如果陛下速还，瓦岗军必定溃散，否则东都肯定陷落。