但一场天灾所引起的农民起义，又给这个刚登基的皇帝带来了麻烦。公元1465年，荆襄地区的流民由于大旱，加上赋税徭役过重，于是起义反明，一年之后被装备精良、人多势众的官军镇压。这时，广西境内大藤峡的瑶民又宣布起义，朱见深只得再派大军前往镇压，在大藤峡一带击溃瑶民，残酷地镇压了起义。以后来见深又镇压了荆襄山区人民起义，派兵击退了北方蒙古连续对西北河套地区的进攻。朝野因此对朱见深大为赞许。
正当朝野内外对朱见深的赞扬之声四起的时候，一个女人却迷住了朱见深，将刚有起色的大明王朝，重又拉入深渊。这个人就是万贵妃，原名万贞儿。
万贞儿是孙太后宫中的使女，朱见深出生后，孙太后命令万贞儿伺候这个将来的太子。万贞儿虽是女人，却颇有心计，她非常清楚这个襁褓中的婴儿将会是大明王朝的皇帝，因此费尽心机，尽心尽力地伺候这个小她17岁的朱见深。万贞儿还是有几分本事，一来二去，竟然将来见深迷得神魂颠倒，等到顺利继承大统后，朱见深竟将其封为贵妃，这一年，朱见深18岁，而万贵妃35岁。朱见深对于这个从小就在她的怀中长大的万贵妃，既有夫妻之情，也有母子之爱，反而对亲生母亲周太后倒有了些生分。万贞儿成为贵妃后，首先就将位居正宫仅32天的吴皇后逼得被打入冷宫，之后更加有恃无恐，后来被立为皇后的王氏秉性恬淡，凡事退让，只是名义上的皇后而已。从此，万贵妃借朱见深对自己的宠爱，搜罗了大批太监和奸佞之人为自己的喽啰。这些人依仗万贵妃的势力，颐指气使，骄横跋扈，内外大臣敢怒而不敢言，朱见深也因为爱屋及乌，对他们任意放纵。
有了这个万贵妃，朱见深再无治国之心，而是与万贵妃肆意享乐，大肆挥霍，尽情歌舞，连早朝也很少前去，大臣们纷纷上书劝谏，朱见深根本不予理睬。万贵妃由于年龄已过生育之期，并不能给朱见深孕育龙种，但为了独享专宠，横行六宫，对怀孕的后宫妃子大加迫害，采取毒杀、堕胎等办法，使得朱见深日思暮想的皇子一直没有出生。直到公元1474年，才有一个太监悄悄告诉朱见深，有一个来自广西的宫女纪氏，已经替他生了一个儿子。朱见深便在大臣们的建议下，将这个儿子交给皇太后周氏抚养，并将其立为太子。万贵妃见此情况，索性让各个妃嫔多生几个皇子，以与太子争宠。于是一时间，皇宫内生龙子的喜讯接连不断，短短几年中，后宫的嫔妃就为朱见深生下了11个儿子。
万贵妃嫌自己深居后宫，不能控制宫外局势，因此又找来一个阉货以作外应，这个人就是汪直。汪直被万贵妃推荐给朱见深后，很快得到重用，并被授命成立并掌管新的特务机构西厂。
在朱见深的支持下，汪直结党营私，屡屡制造骇人听闻的冤狱，到后来朝中公卿大臣，一遇到他都像避瘟神似地改道而行，没人敢招惹是非。大臣们不满汪直的胡作非为，便上书朱见深请求处罚他。朱见深不得不撤掉西厂，但让汪直暂避风头，令他回御马监再操旧业。
没过多久，朱见深就接到了汪直党羽对汪直的吹捧，说汪直公正无私，建议恢复西厂。对汪直念念不忘的朱见深立即顺水推舟，恢复西厂，让汪直官复原职。汪直从此更是飞扬跋扈，但大臣们还是一直没有放弃劝谏。但也不再像上一次扳倒汪直那样直接进言，而是旁敲侧击，从侧面提示朱见深，朱见深也渐渐地对汪直产生了怀疑。
公元1479年的秋天，朱见深终于让汪直巡视边疆，以此来试探汪直，而汪直却不明究理，沿途接受边官的讨好，奢侈铺张到了惊人的地步，还将对自己不敬的兵部侍郎马文升加上了扰边的罪名，把他贬戍边城。此事被人密奏给朱见深知道，朱见深终于有了疏远之心，两年后，朱见深连连拒绝了汪直要求回京的要求，只是召还了跟随他的官吏。大臣们非常明白，这是朱见深疏远汪直的信号，于是纷纷上疏，揭批汪直，请求撤销西厂。
朱见深终于下定决心，将汪直及其党羽罢官驱逐，并撤销了西厂。
大臣们欢欣鼓舞，击掌相庆，认为革新朝政，恢复明朝前期繁荣的机会已经来到。可令他们大跌眼镜的是，朱见深又宠信了新的太监梁芳，外加一个无耻的僧人继晓。朱见深在消灭汪直的势力后，再也没有振作起来，整日求道炼丹，以求延长寿命，要不就是终日沉溺于房事，身体更是江河日下。太监梁芳便向来见深推荐了一个对房中之术很有研究的僧人，名叫继晓。继晓在指导朱见深行房中术的同时，还为朱见深自制了一些春药，从而得到朱见深的宠信。朱见深从此深居宫中，随意让太监传旨，任命和尚、道士、番僧、优伶、工臣等人为官，总数多达3令人。因这些人不学无术，所以被称为“传奉官”。朝中多了这些叠纸老虎吓人的“传奉官”，政务更是混乱不堪，因此大臣们又继续劝谏，终于迫使朱见深摆脱梁芳、继晓的控制，下诏将已封为国师的继晓革职为民，斥罢传奉官5余人。
公元1487年，在万贵妃死于肝疾后，朱见深也染上重病，一病不起，很快就结束了自己平庸的一生。
孝宗朱祜樘
（公元1470年～公元1505年）
在位时间：公元1487年～公元1505年
曾用年号：弘治
谥号：无
庙号：孝宗
安葬地：泰陵
公元1847年，明宪宗的长子朱祜樘出生。
公元1487年。明宪宗朱见深死去，朱祜樘即位，是为明孝宗。
公元155年，明孝宗病逝，享年36岁。
在宪宗时的后宫中，是没有嫔妃敢怀孕生子的，这是因为被年龄已大，无法生子但又专宠的万贵妃残害的结果。朱韦占樘能侥幸出生并存活下来，其间充满戏剧色彩。他的母亲纪氏是宫中一个小小的女史（女官名称），负责管理宫中藏书。公元1469年的秋天，纪氏被偶然来到书房的宪宗幸之，自此有孕。纪氏生下来祜樘后，忍痛将他交给门监张敏，让张敏把他溺死。为人善良的张敏想到皇上无子，就背着万贵妃秘密抚养，从而保全了朱祜樘的生命。6年后的一天，宪宗召张敏梳头，对镜叹道：“朕将老了，可是还没有儿子！”张锄立即跪下说：“皇上并非无子！”宪宗大为惊诧，张敏接着说：“现在安乐堂内就有您的龙种。”完宗更加奇怪了，于是追问，张敏就把朱祜樘的事情告诉了他！宪宗大喜，立即派人把朱祜樘拯来，随即命礼部定名，并册封纪氏为淑妃。
但纭氏终究还是没能逃过厄运，不久就在新居永南宫暴死。公元1469年的冬天，朱祜樘被立为太子，并于公元1487年即位，是为孝宗。
即位后，孝宗立即对太监梁芳、礼部右侍郎李孜省等前朝奸臣给予了严厉的惩罚。两个月后，孝宗又下令将那些冒领官俸，总计有3000人之多的艺人、僧徒一概除名。接下来，孝宗以各种方式处罚了另外一些奸佞之徒。在清理过程中，孝宗注意方式方法，没有大开杀戒。
被砍掉脑袋的，只是一个罪大恶极的继晓。
罢斥完奸佞后，自然任用的就是贤能之人。为了熟悉官吏的情况，孝宗曾下令吏、兵两部把官吏姓名全部抄录下来，贴在墙壁上，遇有迁罢的人，随时更改。由于孝宗注意任用贤能，形成了“朝多君子”的盛况，出了许多名臣。孝宗还善于纳谏，在他上台不久，朝中就形成了大臣纷纷上书的生动局面。孝宗还采纳了除早朝之外，再在便殿召见大臣，谋议政事，当面阅其奏章，下发指令的意见，开始增加“午朝”，每天在左顺门接见大臣，倾听他们对政事的见解，做出了许多重大决策。
在孝宗统治的整个时代，其实行的一系列富国强民的措施都自始至终地得以贯彻执行，这是因为孝宗时代有一批对朝廷忠心耿耿的大臣，为他的励精图治立下了汗马功劳，其中有孝宗最信任的王恕、极为赏识的马文升等等。孝宗和这些内阁大臣的关系极为融洽，对他们讲的话也是言听计从，每每称善，这种情形在君臣之间，确实少见。
孝宗还减免灾区的赋税征收，从公元1490年河南因灾免秋粮开始，孝宗对每年奏报上来的因灾免赋要求，基本上都同意。孝宗还令刘大夏于公元1492年夏坐镇山东阳谷，负责整治黄河以及江南的水患，刘大夏历时两年，完成了多项水利工程，终于治服了水害。在孝宗的支持下，刘大夏还大力整顿军事，核查军队虚额人手，补进了大量壮丁，同时也请孝宗停办了不少“织造”。
公元1489年秋九月，孝宗下令禁止宗室、勋戚奏请田土，不准接受外人的投献钱财、物品。
张皇后的兄弟张鹤龄在皇室中，是最为飞扬跋扈的一个，闹得百姓无以为生。因此，在公元155年春，李梦阳上书弹劾张鹤龄。孝宗在张鹤龄与其母天天在面前哭闹的情况下，不得不将李梦阳下狱，后来又将李梦阳复职，只是罚俸三个月，随后找到张鹤龄训斥，从此张鹤龄收敛了许多。从此，那些往日横行不法的权贵，只得收敛劣迹。
孝宗在执掌权力的最后一段时间里，全力以赴整顿朝纲，渴望帝国的振兴。公元1505年，李东阳奉旨去山东曲阜祭祀孔子，当时正好大旱，李东阳在返京的路上仔细调查，回来后，便将所见所闻奏告孝宗，并指出其中很多都是弊政造成的后果。孝宗听完李东阳的话，沉吟半晌，两行清泪顺着脸颊流了下来，李东阳感动得跪伏在地，高呼“万岁”。正在此时，工部尚书有事奏报，孝宗听说是为了削减宫中的开支，因而裁减尚衣局、军器局、司设监的匠人，他马上下旨，批准了工部尚书的请求。此后，再接到宫内针工局，计划招收大批的裁缝入宫的奏告，孝宗也没有批准。另外，孝宗还下令裁减织造数额的三分之一，节省了经费开支。
公元1505年，这个明朝中期最有作为的皇帝因病去世，享年35岁。
武宗朱厚照
（公元1491年～公元1521年）
在位时间：公元1505年～公元1521年
曾用年号：正德
谥号：武宗毅皇帝
庙号：武宗
安葬地：不详
公元1491年，明孝宗的长子朱厚照出生，后来因弟弟夭折，朱厚照成为唯一的皇子。
公元1505年，明孝宗去世，朱厚照即位，是为明武宗。
公元1508年，明朝另一特务机构内行厂设立，是继东厂、西厂之后的第三个特务机构。
公元1518年，宁王朱宸濠发动叛乱，不久便平定。
公元1521年，朱厚照病死，时年31岁。
孝宗的儿子朱厚照在孝宗临死前，得到了父亲留给自己的皇位，还给自己留下了大笔有形和无形的财富、弘治时期的贤相和能臣以及宗社的安定。孝宗非常希望自己的儿子朱厚照，能将他的政绩发扬光大，使“弘治之治”连续成“弘正之治”，但遗憾的是他的希望落空了。明武宗不但没有继承和延续父亲留下的天下大治的局面，反而将这个大明王朝糟蹋得千疮百孔，日渐衰落。
公元1505年夏，孝宗因病去世，15岁的皇及子朱厚照即位，是为明武宗。朱厚照从小就非常聪明，老师当天安排的背诵作业，他常常是在第二天便能流畅地被出来，对老师也非常尊敬，每天下课时，他必要拱身致敬，作揖告别。对父亲也非常有孝道，只要听说父亲来了，朱厚照都立即率东宫官僚前往迎接，并按照学过的礼节，恭恭敬敬地回答父亲的提问。此时的明武宗，应该算是一个既聪明而有明事理的儒生，可他并不是一个有定性的人。当父亲带他外出后，朱厚照就被外面的花花世界所吸引，逐渐厌烦读书写字，像飞出樊笼的小鸟一般，再也不愿回到笼中去了。从此，朱厚照心猿意马，学业上逐渐荒废。在玩遍了踢线球、斗蟋蟀、角抵、百戏等太子能玩的游戏后，朱厚照开始需要更多、更新鲜、更富刺激性的游戏方式，而骑马弓射是最合适不过的游戏了：朱厚照的悟性也非常高，得到热心的太监们耐心的教习后，朱厚照很快就学会打马飞奔、挽弓疾射。而孝宗太过疼爱他这唯一的儿子，即使有人向他进谏，即使张皇后有些忧虑，孝宗还是不以为然，更是放任自流，随他的马儿飞奔。等孝宗死后，没有经过很好教育、且心已玩疯了的朱厚照即位，就非常厌烦繁复的礼仪、枯燥的奏疏和繁乱的国家大事，于是每日早朝就成了他一天中最难捱的时光。既然朱厚照想玩，自然身边就会有陪他玩的人。虽说伴君如伴虎，但陪着一个贪玩的皇帝，只要想方设法让他开心，就不再是伴着老虎，而是伴着权势了。这个人就是非常阴险的太监刘瑾。
刘瑾善于揣摩朱厚照的心思，知道朱厚照爱玩，他就千方百计地寻找些鹰犬、歌伎、角抵之类的玩意来满足朱厚照的玩心，还经常陪着这个小皇帝出宫玩乐，自然就得到朱厚照的信任和宠爱，也就得到了想得到的权势。为了巩固自己的权势，刘瑾还收罗了马永成、高风、罗祥、魏彬、丘聚、谷大用、张永等七个太监，以形成自己的势力圈子。从此他们相互勾结，骄横跋扈，人称“入党”、“八虎”。
有了刘瑾等人，朱厚照玩心更盛，经常率手持武器的太监在皇宫里驰骋，或整日泛舟于湖者。逐渐染上流氓习气的朱厚照竟然追逐宫女，溜出皇宫进妓院，酒后肆意闯入民宅调戏良家妇女，纵情玩乐，丑态百出。每次玩累了，就不再上早朝，大臣们多次劝谏，也无力改变。