他上奏太后王政君：“王宇在吴章、吕宽等人的蛊惑下，制造事端、妖言惑众，犯下了像管叔、蔡叔（周武王的弟弟、周成王的叔叔，周公摄政时发动叛乱）一样的大罪。我不敢徇私，应该将他处以极刑。”
太后看到王莽的上奏后，于心不忍。王莽已经有过一次大义灭亲的行为，失去了一个儿子，自己这个做姑姑的，怎么忍心再让他为了捍卫国法，又诛杀一个儿子呢？
太后将王莽叫来，亲自说服他法外开恩。王莽也深知白发苍苍的太后疼惜王家的子孙，但他不能让步。“王宇生死事小，国家的安危、汉室的兴衰事大，丁、傅两家专权误国、欺凌太后的殷鉴不远，断不可重蹈覆辙。如果不杀王宇，我们何以穷究此案，铲除那些威胁朝廷的祸害。为了刘汉的江山社稷，王莽就算是粉身碎骨也在所不惜，这点小小的牺牲又算得了什么？”
“你的意思是？”太后听出了王莽话中的深意，追问道。
“太后英明，这是一个斩草除根、清洗朝堂、安定国家的契机。机不可失，时不再来，天赐良机，一定要把握住。”
太后若有所思地点点头，没再深问。王莽大义凛然，句句都是肺腑之言，而且又深思远虑，计划周密，太后王政君也就不好再阻拦他，随即下诏：“唐尧的儿子丹朱狂妄自大、荒淫无道，周文王的儿子管叔、蔡叔大逆不道，发动叛乱，连圣人都管不住自己的不肖子孙。王莽不徇私枉法，这一点我非常赞同。周公讨平叛乱的四国之后普施教化，才使人们不敢触犯国法。王莽应该专心致志打理朝政，使国家国泰民安。”
王莽下令将王宇逮捕入狱，迫使他服毒自杀。儿媳吕焉因为怀有身孕，暂时收押，待其生产后再处决。“血门事件”的主谋之一、王宇的老师吴章被当众车裂处死，他门下的弟子一千多人都被宣布为“恶人党”，遭到禁锢，不得为官。
吴章也是一代名儒，落得如此下场，实在令人扼腕叹息。他支离破碎的尸体被丢弃在市集上，没人敢去收敛，任由野狗吞食。最后，吴章的弟子、担任大司徒掾的平敞冒着生命危险，买来棺木，收敛了恩师的尸体。或许是平敞的勇气和尊师重道的精神打动了王莽，也可能是考虑舆论的压力，王莽没有处置平敞。
在血门事件中，王莽表现出来的铁腕和冷血，让他的政敌们感到胆寒。这些人敏锐地意识到，王莽之所以作出这么大的牺牲，连自己的亲生儿子都不放过，他是不会善罢甘休的。诛杀王宇、吴章只是一个开始，又一次大清洗的序曲而已。
危险的大清洗
既然要穷治血门一案，首先要诛灭的就是与王宇勾结的平帝外戚——卫家。这是一招险棋，试想：如果血洗了皇帝的娘家，那么皇帝长大亲政后，会不怀恨报复吗？王莽虽然早就考虑到了这一点，但事到临头，还是有些犹豫不决，拿不定主意。他把自己的亲信——王舜、王邑、甄丰、甄邯等人叫来商量。
这些人也觉得左右为难，想不出什么万全之策。王莽见大家都保持沉默，只好率先打破这种尴尬的场面。他清了清嗓子，朗声说道：“天子犯法，与庶民同罪。不能因为卫家是外戚，就枉法纵容。卫姬是皇帝的母亲，孝道至上，可以法外开恩。但其他人绝不能放纵，一定要予以严惩。”
领导发话了，其他人只有随声附和，血洗卫家的事情就这么定了下来。王莽进宫向太后王政君回报。太后也担心这么做会后患无穷。王莽道：“事情已经到了这一步，我们没有退路了。大狱已经兴起，只能一查到底。太后想一想，平帝即位以来，我们隔离卫家，软禁中山太后（卫姬），平帝将来就会原谅我们吗？既然如此，我们现在放纵卫家，又有什么意义呢？不如就此斩草除根。”
“如果皇帝亲政后复仇，怎么办？”太后忧心忡忡地问道。
“我们并没有做错什么。既要抑制外戚，又要避免皇帝将来报复，实在是一件两难的事情。我以为，最重要的事情是江山稳固、国泰民安，其次是我们王家的荣华富贵、世代平安。至于龙椅上坐的是谁，并不重要。”
王莽抬头直视着太后。王政君被他眼中闪过的那道寒光吓得心头一凛，那是凌厉的杀机，她没有想到王莽竟然胆大包天。但冷静下来想一想，事已至此，似乎没有别的办法可以化解眼前的难题了。
得到了太后的认可，王莽开始了肆无忌惮的大清洗运动。卫家的人除了皇帝的母亲卫姬没被牵连外，其他亲属全部被诛杀。只有皇帝的舅舅卫宝的一个女儿，也就是皇帝的表姐，嫁为中山王后，被废掉并流放。
皇族中牵连被杀的，有与哀帝外戚丁、傅两家关系密切的敬武长公主（汉元帝的妹妹），与卫家有联系的梁王刘立。
王家被牵连的人有红阳侯王立。这个叔父一直是王莽的眼中钉、肉中刺，这次终于被彻底消灭了；王莽的堂弟、平阿侯王仁。
大臣中被杀的有抵制王莽为大司马的前将军何武等人。
王莽也学习周公，刚柔并济、软硬兼施。在靠铁血手段清除政敌之后，继之以和风细雨的教化，为自己的血腥手段蒙上一层道义的光辉，赢得人们的认可与支持。
一方面，他撰写了八篇文章，现身说法——“子爱至深，为帝室故不敢顾私”，以王宇为例，警示后人。很快，全国上下掀起了学习王莽著作的热潮，学官们要负责教授这八篇文章，并把它们作为选举人才时的考察科目；在职官员中能够背诵这些文章的，也要记录在案，作为将来考核时的依据之一。
另一方面，他把朝廷的高官们集中起来，集体学习“为人后之谊”，宣扬“为人后者，义不得顾私亲”。这样做的实际目的是给年幼的平帝洗脑，也是为了应付社会舆论的压力。他仍然抱着一线微弱的希望，指望平帝能够理解自己为了江山社稷的良苦用心，也能支持大义灭亲，将来不怀恨报复。
虽然抱着这样的侥幸心理，但王莽也明白，这是知其不可而为之，成功的可能性微乎其微。要想平帝宽恕他，那么皇帝就得有像大海一样宽阔的心胸，像圣人一样高尚的品德。王莽自己是个道德超人，他能做到的事情，在别人看来几乎是不可能的。
这天傍晚，王舜来找王莽喝酒、聊天。初秋时节，秋高气爽，院子里非常清凉。堂兄弟二人就在院子里的石桌旁相对而坐，仆人端来几碟清淡的小菜给他们下酒。
王舜抿了一口酒，对王莽说：“巨君，血门大案已经基本终结，现在放眼朝野上下，能够威胁我们的人基本都被清除了。下一步你打算怎么办呢？”
王莽抬头望着湛蓝的天空，悠悠地说：“我兴起大狱，血洗朝野，绝不是为了一己之私。现在朝廷内外众志成城、万众一心，正是我们可以有所作为的时候。我一生的心愿就是像周公一样，辅佐君王，开创一个政通人和、国泰民安的盛世，推行仁政、教化苍生、振兴礼乐，重建礼仪之邦。为了这个目的，我已经努力了这么多年，付出了巨大的代价，经历了常人无法承受的坎坷和挫折。现在看来，这一切都是值得的，我们在一步步地向目标靠近。”
看到王莽踌躇满志的样子，王舜低头沉思了一会儿，小心地说道：“我听说了一些市井流言，有人揣测你将来会取汉室而代之。”
王莽睥睨了王舜一眼，冷笑道：“这种道听途说能相信吗？我所做的一切都是为了国家、为了苍生，你难道还不了解我吗？”
王舜道：“如果有一天，大势所趋，你真的可以做一个开国之君，不是更有机会施展自己的抱负吗？到那时候，你会不会坐到龙椅上去？你的所作所为究竟是为了刘汉一家，还是整个天下？”
王舜的话直戳王莽的心坎。那是一个他有所觉察，但一直不肯直接面对，只是朦朦胧胧地意识到的症结。“民为贵，社稷次之，君为轻”，圣人的教诲在王莽的耳畔回响，不管是推行仁政，还是以礼治国，目的不都是为了老百姓吗？江山社稷怎么就一定要算成是刘家的私产？
“方制海内非为天子，列土封疆非为诸侯，皆以为民也！”“天下乃天下人之天下，非一人之天下也！”那些儒生的议论也就是王莽的心声，因为他在骨子里就是个儒生。