张士诚的宫里，有一座齐云楼，是张士诚的妻子刘氏居住的地方。张士诚兵败的时候，曾对刘氏说：“我要是战败而死，你们怎么办？”刘氏说：“夫君不用担心，妾决不负君！”等到平江沦陷，刘氏就命乳母金氏将两名幼子抱出来，然后将群妾侍女赶到齐云楼上，让养子辰保在楼下放火。霎时间烈焰冲天，一座高楼被烧成灰烬。随后，刘氏也悬梁自尽。张士诚一个人坐在室内，左右已经全都逃走了。徐达命降将李伯昇去劝张士诚投降。李伯昇敲了很久，没有回应，只好破门而入。只见张士诚穿着龙袍，两脚悬空，已经吊死在梁上了。李伯昇急忙令降将赵世雄解绳相救，张士诚竟然苏醒过来。这时候潘元绍也来了，再三开导张士诚。张士诚始终闭着眼睛，一言不发。在送往应天的路上，张士诚不说话也不进食，奄奄待毙。到了应天之后，李善长百般开导，劝他归顺。张士诚竟出言不逊，惹恼了李善长。李善长禀报朱元璋，想置他于死地。朱元璋还想保全他的性命，哪知张士诚竟乘人不备，自缢身亡。
张士诚于元至正十三年起兵，至正二十四年自称吴王，至正二十七年缢死在金陵，朱元璋为他殓葬。降将大多免罪，只有熊天瑞被斩首示众。朱元璋将平江改为苏州府，接着论功行赏。封李善长为宣国公，徐达为信国公，常遇春为鄂国公，其余将士也一概做了封赏。
平江还没有攻下的时候，朱元璋曾派廖永忠到滁州迎接韩林儿到应天府。刘基密嘱吴王，让廖永忠弄翻韩林儿的船，使韩林儿溺水身亡。朱元璋替他办好葬礼。后又除去龙凤年号，改为吴元年，设立宗庙社稷，构建宫室，订立乐律，规定科举。等到攻下平江，江东大定，朱元璋决定分道出师，一路攻打中原，一路平定南方。
因元相脱脱贬死在云南，河北一带多半沦陷。幸亏察罕铁木儿在关陕起兵，转战大河南北，平定晋冀，收复汴梁，剿抚山东，盗匪几乎被荡平。吴王朱元璋曾派人给察罕写信，与他通好，察罕回了信，却将使臣扣留。后来察罕被降将田丰所杀，朝廷就让察罕的养子王保保代理军务。王保保就是扩廓铁木儿，他率兵复仇，擒杀了田丰，又送还朱元璋的信使，并写信劝朱元璋归降元朝。朝廷也派尚书张昶，从水路到达庆元，授吴王朱元璋为江西平章。朱元璋不肯接受。
扩廓铁木儿智勇双全，毫不逊色于他的父亲。只是河南平章孛罗铁木儿，屡次动兵侵扰朝廷。元太子爱猷识理达腊，与扩廓铁木儿相处得不错，就让他调兵讨伐孛罗铁木儿。孛罗铁木儿当即举兵造反，驱逐太子，幽禁皇后。多亏威顺王和尚派人刺死孛罗铁木儿，朝廷才安定下来。扩廓铁木儿送太子回朝之后，被封为河南王，总管各路军马，代太子出师江南。不料关中四将军竟然抗命。四将军一个叫李思齐，一个叫张良弼，一个叫孔兴，一个叫脱列伯。他们互相勾结，推选李思齐为盟主，拒绝扩廓铁木儿。扩廓铁木儿怒不可遏，与李思齐等人力争。双方相持了好几年，朝廷屡次调解，都没有效果。后来，顺帝特意下诏，命扩廓铁木儿专管江淮军事。扩廓铁木儿一心想囊括关中，然后南下。顺帝很不高兴。太子还朝时，想趁机内禅，和扩廓铁木儿商议却遭其拒绝，也怀恨在心。父子二人都忌恨扩廓铁木儿，就想削去他的官职，夺掉他的兵权，并让太子统领各军，专门防备扩廓铁木儿。扩廓铁木儿年轻气盛，哪里肯受这种屈辱？当下占据了太原，抗旨不遵。顺帝正想派兵讨伐，哪知应天这边，已经命徐达为征虏大将军，常遇春为副将军，率师二十五万，向北行进。也不知朱元璋早给齐、鲁、河、洛、燕、蓟、秦、晋发了檄文。
朱元璋与诸将筹划北伐的事情时，常遇春认为应当直捣元朝都城。朱元璋不以为然，说应该先取山东，然后攻入河南，进军潼关，再去攻打元都，这样，敌人势孤援绝，自然容易攻破。接着，再西取云中、太原，进逼关、陇，统一中原。诸将全都点头称善，随即由徐达、常遇春统领重兵，向山东进发；命汤和为征南将军，吴桢为副将，率常州、长兴、宜兴、江淮的兵马，讨伐方国珍；胡廷美也被封为征南将军，何文辉为副将，率兵攻打福建；平章杨璟、左丞周德兴、张彬，率领武昌、荆州、潭州、岳州的兵马，从湖广进攻广西。
方国珍一直和应天通好，常常派使臣进贡物品。后来吴王朱元璋与陈友谅、张士诚争夺地盘，方国珍乘机抢占濒海的几个郡县。吴王派人去问，方国珍支支吾吾，说不出个所以然。吴王觉得他反复无常，决定进兵温州。方国珍派人去谢罪，并谎称攻克杭州之后，马上纳粮。可等到杭州平定，吴王向他征粮二十万石时，方国珍竟然置之不理。后来，汤和、吴桢奉命南征，围攻庆元。方国珍还想严防死守。谁知部下徐善竟带着父老乡亲开城投降，害得方国珍孤掌难鸣，只好带了些亲信，到海上避难。汤和分兵攻下定海、慈溪等县，又与廖永忠会师，夹攻方国珍。方国珍走投无路，惶惶不可终日。幸亏汤将军网开一面，派人去招降。方国珍这才献上二十六方大印，一万两白银，两千缗钱，并让儿子方明完奉表称臣。
吴王朱元璋见方国珍阴险狡诈，本来想赐他死罪。等看到那降表，又觉得凄凉婉转，不禁可怜起来，当即回信：“既然已经投降，我也就不再追究了！”方国珍收到回信，立即带着部下赶到应天。吴王当面指责他：“你反复无常，害我劳师动众。不过现在投降也不算晚！”方国珍随即叩头谢罪，归顺了朱元璋。朱元璋即位之后，一直厚待方国珍，在京师赏赐他府第，还给他的两个儿子封官。方国珍也算是善终了。
汤和等人收降了方国珍，就从水路直达福建，接应胡廷美的军队。福建正被陈友定占据着。陈友定是福清人，朝廷封他为福建行省平章政事，曾派兵侵略处州，被参军胡深打败。胡深进军松溪，擒获守将陈子玉，接着攻入建宁。胡深在建宁被陈友定的部下阮德柔偷袭，后来被擒杀。胡深文武双全，防守处州五年，恩威并济。他被擒获之后，天象有变，太阳中出现黑子。刘基说东南要损失一员大将，最后果然应验了。朱元璋听到噩耗，派人前去祭拜，追封他为缙云郡伯。胡廷美、何文辉等人率兵南下，先派人招降陈友定。陈友定将信使杀死，誓死不降。胡廷美得知消息，督兵猛进，先后攻陷光泽、邵武、建阳，直逼建宁。这时候，陈友定的部下袁仁递来降书，表示愿意开城投降。第二天一早，袁仁果真打开了南门。吴兵乘机拥入，曲出、赖正孙、谢英辅等人先后逃走，邓益战死，参军尹克仁投水自尽，佥院伯铁木儿拔剑自刎。此后，兴化以及莆田等十三个郡县一律被平定。
胡廷美、何文辉等人攻克建宁之后，继续向前推进。陈友定派兵出城，正好遇到汤和的兵马。双方一阵厮杀，陈友定败下阵来。汤和兵临城下，城中的守将纷纷请求出战。陈友定说：“敌兵远道而来，士气正盛。我们不如以逸待劳，和他打个持久战，看他怎么胜我？”诸将唯唯听命。陈友定下令守城的士兵不得轮番休息，不得交头接耳，违令者斩。将士们对此都有怨言，部将萧院判、刘守仁抱怨了几句，陈友定当即杀死萧院判，削去刘守仁的兵权。陈友定的做法逼得刘守仁出城投降。后来陈友定的军器库被人放火，城里炮声震天。汤和等人知道城里内变，蜂拥而至，城池随即被攻破。陈友定和他的儿子一同被擒，在闹市被斩首。