在内部管理中，狂妄的马云很清醒，他知道自己的长处和短处，所以能摆正自己的位置，不当英雄，只当凡人，不做皇帝，只做员工，善待同事，与人平起平坐，是他内部管理的利器。马云出色的口才，能在危机时刻，驱散人们的种种疑虑和恐慌；马云聪明的做人之道，把内部矛盾成功地化解，能让员工热情澎湃的为阿里巴巴打拼；马云英明的策略之术，数次将阿里巴巴挽救于狂澜之中。对待雅虎的员工，更显示了马云管理艺术神奇魅力，这个“后娘”当可可谓是仁至义尽，彻底否定了“一朝天子一朝臣”的论调。
1.敞开心扉，善待身边的每一个人
“自己有一颗平常心，才能让员工放下心。”
——马云
管理大师约翰·科特说：“作为一个领导者，许多时候，并不一定需要宏篇大论，领导者只要注意一下人感情上的细节，就会产生惊人的效果。”
马云是一位成功者，但成功者必须要有自己的实力。商业领域需要的是那种综合素质最佳的“极品男人”，而马云正是这样的人。领导者需要服众，才能上下齐心，达到目标。领导力是管理的关键，责任心是管理的基础，亲和力是管理的辅助条件，实力是管理的资本，威望是管理的保证。马云成功地做到了这些所以他顺利地实现了自己的梦想。马云的魅力就是走到哪里都能与人打成一片。
马云在公司内部则始终把自己定位为一个便利提供者。他已经学会摆脱恐惧，摆脱了去争取公司内外认可的需求，他发现了真实的自我。他关注人与人之间的沟通技巧、矛盾的解决和团队建设。在开诚布公的交流中，他感受到了巨大的满足和欢乐。一种内在的爱取代恐惧成为马云的驱动力，因此他也成了他的团队的精神领袖和心灵导师。
在公共办公区里，马云经常会笑容可掬地走到某位员下身旁，亲切地与其交流，拍着他的肩膀倾听员工工作中的难题，和员工打成一片。这种上下级的沟通方式，既不会让下属感觉拘谨，又能及时了解他工作的状态。时间一长，员工们也逐渐习惯甚至爱上了这种特殊的上下级沟通方式，这也就成为阿里巴巴的一种文化——“闻味道”。
从小受澳大利亚籍义父的影响，马云非常善于和人沟通，在阿里巴巴业务尚不成气候的阶段，马云不断出现在各种能够提升阿里巴巴国际知名度的场合演讲、以及接受海外媒体采访，在海外树立了良好的国际化形象，为阿里巴巴赢得了海外投资者和海外买家的关注。马云也利用其本人的魅力，来招揽忠诚和默契的“左膀右臂”，另外，马云对于整个管理团队也是敞开心扉，带头坚守。
在阿里巴巴，还有更有趣的事，阿里巴巴的任何一名员工可以直接称呼马云的名字。公司员工之间直呼其名或许并不算太奇怪，但老板和员工之间这样“不成体统”的确是很少见，如果不是亲眼所见甚至会让人感觉不可思议。但是，在阿里巴巴这种“犯上”的现象是很正常的。
这或许和马云当老师的经历有关。对于自己当老师的那段经历，马云认为对自己日后创业也有帮助。马云说：“我跟学生之间是真诚的感情，后来跟同事之间也是这样一种关系，不像老总与下属的关系。”怪不得他公司的员工都是直呼其名，外人尊称他马总时，他也很不习惯，赶紧纠正：“别叫我马总，叫马云！”
时间一长，马云在员工心里像朋友，像老师，像家人。他们眼里的马云本质非常好，非常善良，比较照顾周围的人，而且不是应付也不是应酬，而是发自内心的关心。他把员工当成自己的朋友，他付出从来不讲回报，他很平等待人，而且做得很公正。很多事情员工觉得很困难做好时，马云会说：“你看我们还有这么多希望。”员工们觉得跟马云工作很高兴。生活永远是两面的，人看到一面特别耀眼就看不到另外一面，马云启发他们去看到另外的一面，困难的时候阿里巴巴人也没怎么愁云惨淡，很开心就过来了。马云的性格也很好，这些都影响了他的员工。可是，在阿里巴巴人心里，马云的评价是很高的，这绝不是蓄意的奉承，而是发自内心的真诚。
在中国，有些老板为了树立自己在企业内部的绝对权威，可以说是处心积虑，用心良苦，甚至不惜用“杯酒释兵权”的手段。而马云却从来没考虑过这些，尽管他已经在自己的团队中有着很高的威望。但马云并不希望自己被神话了，也不希望公司员工对他有什么个人崇拜，他甚至都不希望自己的员工是为了他马云而工作。但是，尽管马云不希望被神话或者崇拜，他希望员工能认可自己的理念、思想、战略战术，他说：“一个CEO他最后要取得的决定权不是人，是他讲的理念思想、战略战术是不是确实有理。所有人都觉得你说得有理，他们就会跟着你。”
马云这个精明的人，以其独有的魅力赢得了所有的尊重，正是应了马云常说的那句话：“自己有一颗平常心，才能让员工放下心。”
阿里巴巴的经验告诉我们，马云的成功之处不仅在于志存高远，还在于有马云这样一个灵魂领军人物。马云最大的领导特质就是建立团队的能力。众所周知，IT业是一个出英雄的行业。但随着经济日益全球化，这个行业越来越理性，市场越来越规范，英雄也越来越少。团队协作更多的被提倡。马云说：“单靠个人或者少数人的力量已经不行了，个人英雄的时代业已结束。”
一般人都认为领导力和商业直觉是天生的，是不可培养的，其实，这种说法是不全面的。这里所说的领导力是人的天生的气质，一种超乎常人的控制能力，就像拿破仑、毛泽东等伟人特殊的气质，这种领导力确实是不可能培养的。当然作为一个神话的主角，马云的远见是天生的，而好的领导人是可以修炼出来的。
马云认为，企业家是具有思想，会合理组织既定资源，能把企业带向正确方向的掌门人、决策者、指挥者，同样张瑞敏也认为，企业家是优秀的经营者，是一个群体，是决策正确、指挥科学的群体。
虽然对领导者的定义见仁见智，但是人们对于领导本身素质的要求却是大同小异的。马云在培养领导人才方面积累了许多宝贵的经验。一般说来，所有领导都应具备的基本素质包括高智商、科技和专业知识、商业头脑、执行能力、战略能力、经验等。但要成为一位真正的领导，仅具备这些基本素质还是远远不够的，还必须拥有诚实守信、乐于沟通、主动热情、自我批评、终身学习等价值观。马云在这方面绝对是一位大师级人物。
2.拒绝崇拜，不能把自己当英雄
“如果别人把你当英雄的时候，你千万不能把自己当英雄，如果自己把自己当英雄，必然要走下坡路，你从此再也不是英雄！”
——马云
“发展依靠员工”是马云经常挂在嘴边的话。在马云眼里，一个企业管理者不必样样精通，一个精明的管理者必须学会借鉴众多的智慧和力量，而自己则是这个团队的驾驭者。人们非议过阿里巴巴的商业模式，但从来没有人非议阿里巴巴的团队。毫无疑问，阿里巴巴的传奇应归功于一大群优秀的阿里巴巴人。而这群一度叱咤风云又特立独行的阿里巴巴人聚拢在一起，又自应归功于马云创建的独特价值观。究竟马云施了什么魔咒，使那么多优秀的人能心甘情愿地甚至是降身份、降收入去跟他捕捉一个在当时还非常遥远的未来？
与生俱来的使命感，不仅笼络了随同马云创业的17位绿林好汉，还吸引了众多高手的加盟。
1999年9月，阿里巴巴正式成立后，瑞典银瑞达公司的副总裁蔡崇信飞赴杭州洽谈投资。和马云谈了4天后，蔡崇信说：“马云，那边我不干了，我要加入阿里巴巴！”马云求之不得：“好！你来帮我管钱。我不会管钱，我最多管过200万元人民币。”蔡崇信的加盟增加了阿里巴巴的说服力。1999年10月29日，由高盛公司牵头，瑞典银瑞达公司等联合向阿里巴巴投资500万美元。随后，阿里巴巴又从软银孙正义手中获得了2000万美元的投资。
2000年5月，雅虎搜索引擎专利发明人吴炯被阿里巴巴吸引，放弃上千万的收益加盟阿里巴巴。继蔡崇信、吴炯之后，阿里巴巴吸引了更多高素质人才的加盟。2001年，在GE工作了16年的关明生加入阿里巴巴，就任阿里巴巴的首席运营官；2003年，微软（中国）原人事总监和联想网站原财务总监加盟阿里巴巴。这些人在原来的公司都已经做到了高层，阿里巴巴没有高薪挖他们，在职位上也没有升迁。他们看重的不是这些，他们看重的是马云及阿里巴巴的企业文化和前景。
此时，阿里巴巴已经从18罗汉变成了一个300多人的跨国公司。将这样一群哈佛、耶鲁的毕业生，和一些杭州师范学院毕业的1980年代出生的人统一在一个团队中，是一件相当有挑战性的工作。
众多高手加盟阿里巴巴，首先是阿里巴巴所在的是朝阳行业；其次它是一个奇特的公司，对企业的价值观、文化之类“虚”的东西很疯狂。可以说，如果没有马云对公司文化和价值观近乎偏执的坚持，阿里巴巴不会如此有吸引力，也不会如此有凝聚力。如今阿里巴巴已经有近6000人，按照计划，阿里巴巴B2B公司今年将招收2001名员工，目前，这一计划已经完成了85%～90%。马云明确表示，2007年，除了引进人才，有良好的机制，进行资本运作，扩大阿里巴巴的影响力、扩大整个公司的收入以外，他将会与高层团队一起为阿里巴巴制定一本阿里巴巴的基本法。
马云之所以大量的招兵买马，吸纳众多的高端人才，一方面是企业的迫切需要，另一方是马云懂得依靠他人的力量来管理公司。马云说，自己不懂财务不要紧，他可以让懂财务管理的专业人士去负责，自己不会说专业的投资术语也不要紧，他可以让懂投资的专业人士全权负责。马云以一个智慧的思维和一个豪杰的胸怀来大胆放权，让这些人为阿里巴巴贡献自己的力量，所以马云才有了今天出色的团队。我们由此可见，马云的自知之明，他不崇拜个人英雄主义。
马云说，不懂的人要对懂的人足够信任。这一点，我们又可以有100个理由相信马云做到了。马云总是在强调自己用人的诀窍：用人最大的突破就是信任人。事实上，不仅是蔡崇信，其他几位高管和马云配合得都非常默契，而马云也一直把他们当作最大的骄傲。重要的，最难能可贵的是，马云有自知之明，他知道自己的长处和短处，不会“以己之短，攻彼之长”。
很难想像，阿里巴巴和淘宝网的创造者马云不懂电脑，对软件、硬件一窍不通。但马云认为，一个成长型企业成功的第二个原则是：打造一个明星团队，而不只是拥有明星领导人。马云最欣赏的就是唐僧师徒团队，他说：“唐僧是一个好领导，他知道孙悟空要管紧，所以要会念紧箍咒；猪八戒小毛病多，但不会犯大错，偶尔批评批评就可以；沙僧则需要经常鼓励一番。这样，一个明星团队就成形了。”在马云看来，一个企业里不可能全是孙悟空，也不能都是猪八戒，更不能都是沙僧，“要是公司里的员工都像我这么能说，而且光说不干活，会非常可怕。我不懂电脑，销售也不在行，但是公司里有人懂就行了。”
马云认为，很多时候，中国的企业往往是几年下来，领导人成长最快，能力最强，其实这样并不对，他们应该学习唐僧，用人用长处，管人管到位即可。毕竟，企业仅凭一人之力，永远做不大，团队才是成长型企业必须突破的瓶颈。大智者，贵在有此明智也！
3.经营人心，用态度去影响别人
“这是一件好事，‘非典’成为凝聚人心的时刻”。
——马云
马云在近几年高速的扩张中，坚持给每一批加入阿里巴巴的新人上一堂企业价值观课。阿里巴巴追求“天下没有难做的生意”，在价值观上还有著名的“六脉神剑”：客户第一、团队合作、拥抱变化、诚信、激情和敬业。马云最善于施展自己的影响力进而打造阿里巴巴的团队凝聚力。对此，赞同者说马云善于打造凝聚力，反对者说马云对员工施展的一种精神巫术。但不管怎样都说明了马云是一个非常出色的管理者。
提到阿里巴巴的凝聚力，我们不能不说这个卓绝的团队在2003年“非典”时期的惊人表现。2003年春天，一场让全世界惶恐的疾病在中国的南方爆发并迅速蔓延，现在我们叫它Sars，当时医学界还没有能够确定疾病的原因和性质，因此只能含糊地称之为“非典型性肺炎”。因为它的不为人所知，也因为在疫情一开始有部分病人死亡，使得在一段时间，人们对“非典”的恐惧达到了高潮，任何与“非典”这两个字有着任何联系的人或者事物，都被视作洪水猛兽一般。这是一场战争，一场考验包括马云在内的所有阿里人的战争。