以上两种说法，第一种为不正义，故《成唯识论》中就简别说：“余依他起性，虽亦是依，而不能持种，故此不说。”在《成唯识论述记》里，也举出依他起性，属断舍和弃舍之一，不能说为转之所依。据此看来，说依他起为转之所依，确实太糢糊了。
3.所转舍：指所应转舍者，有所断舍之二障之种子，及所弃舍之其余有漏法和劣无漏之种子。所转“舍”就是能转智所转舍的东西，这有两类：一类是“障”的，一类是“非障”的。障的就是烦恼、所知二障，因为障于圣法，而必为智慧之所对治，故谓之障。非障的，就是三界有漏善法，或无记法，和劣等的无漏法（如二乘圣者身中的“四圣谛法”），不障圣法，亦不必为智所断。不过不为佛果净识中所藏，而佛果净识非彼依故，故亦须舍也。
因是“障”与“非障”之故，第一类名“所断舍”，第二类名“所弃舍”。断舍之“舍”，有二种说法：一说是“无间道”现前之时，与二障种子，如似冰与火炭，绝对不能相容，道火愈增胜，二障愈减消，从此以后二障永远不得复生。道于二障有殊胜之威力，所以说断舍。二说是，“所执我法不对妄情”，亦叫做“舍”。此说之意，凡实我实法，皆无自性，但由众生的妄情，执著似有；令众生自身的妄情一断，使不计执实我实法，而实我实法，也不再与妄情相对，于此妄情不对其境，假名之曰“舍”。
弃舍之“舍”，要在“金刚道”之“金刚定”现前之时，由此定引生最极圆满明亮纯净的“根本净识”。此识所藏，纯为殊胜无漏的种子，不藏下劣无漏或其他有漏的善、无记种，及诸劣无漏法等，在金刚道末无间道进，即须弃舍，到佛果圆明净一生起，顿然灭尽，无存无余。为圆明净识所不容纳，不更借胜道威力加行断舍，净识一生，彼自退出，故名为弃舍。
四、所转得：指所应转得者；有所显得之涅槃，及所生之菩提。由有能转舍的智，转舍了所转舍的二障和有漏善及劣无漏法，应必有所得，乃可合符正理。所转得即是“二转依果”。《成唯识论》卷一谓：“由转烦恼得大涅槃；转所知障，证无上觉。成立唯识，意为有情证得如斯二转依果，或依即是唯识真如。”
1.所显得——大涅槃果：大涅槃如何名“所显得”呢？因为涅槃就是真如，又名清净法界，也就是诸法的真实理体；乃众生无始以来本具之德相。其体不增不减，不生不灭，不明不暗，尽绝一切安立之相；诸佛出世若不出世，体常凝然；然而众生烦恼炽盛，将其隐被盖复，不得光明显现而已。若大菩提智一生，烦恼顿然灭尽，其相脱然而出，好似云散日显，垢去镜明。一不由种子而生，二非熏习所成，所以名为“显得”。
平常为何说有四种涅槃，涅槃真有四种吗？涅槃本无二体，一切众生与一切圣人，都是共同一个涅槃。不过因为有客障复令未显之时，而假名为“本来自性清净涅槃”；谓虽为客障，而性本净，不生不灭，凝然湛寂。烦恼已断，真如已证，涅槃已得，而犹有异熟果报的依身存在，故名“有余依涅槃”；即前此的异熟果身一灭，所谓灭身泯智，故名“无余依涅槃”；即前此真如，尽除所知之障，然为大悲般若，交相辅翼，故不如二乘人之住于寂灭，亦不如众生之位于生死，利乐有尽，穷未来际，虽现生死而相常寂，安然不动，故特立名“无住大涅槃”。总之，涅槃是一个，不过由未显及已显而又断障不同运用不同，安立如上四个名字罢了。
涅槃虽一而证得各异，什么人该得什么样子的涅槃呢？
2.所生得——大菩提：大菩提果，如何名叫“所生得”呢？因为阿赖耶识中，本来具有“菩提种子”，但因所知障障碍难生，后由圣道之力，断所知障，令其从种子位发生现行，故名“所得生”。菩提种子虽阿赖耶中无始本具，但在渐趣大菩提果的因位之中，数数熏发，渐渐增长，非到佛果究竟，不能圆满；然至佛果以后，却又不必再熏，仅是从种发生现行即是。因为得佛果即是圆成，无丝毫缺陷，功德圆满不增不减。
大菩提果到底是些什么呢？就是前述之“四智相应心品”。四智，指大圆镜智、平等性智、妙观察智、成所作智。什么是四智相应心品呢？品是聚类之意，就是说四智各个相应的一聚心及心所。这一聚心心所总共有二十二个，统称心聚，称为相应心品。既然智就是一聚心品，为何独以“智”来标名呢？因为智用殊胜，所以特用立名。这四智相应心品，总能包括佛果位上一切有为功德，所以就是大菩提果。
四智是转有漏的八识而得，故体、相、用都与有漏八识相似。如转第八阿赖耶识所得的大圆镜智，能摄藏无漏种子，能现自受用身土和余三智的“智影”，恰像一面光明大镜，故名大圆镜智；转第七末那识所得的平等性智，则与有漏第七识相翻其用，于内则证诸法的平等理性，于外则观诸法自他平等，无有高下，而常与大慈大悲等恒共相应，随十地菩萨所乐所欲而变现他受用身土，满他受用，故名平等性智；转第六意识所得妙观察智，则善能观察诸法自相共相，便能于诸大会中，转大法轮，施设无量无边众多方便，断诸有情之疑网，令得妙法之安乐，故名妙观察智；转前五识所得的成所作智，则是示现一切身土等法，以应地前和二乘圣人及诸凡夫之机，以成佛果本愿力所应成的事业，故名成所作智。
转八识得四智，是否完全在佛果位时才转的呢？圆满转得，当然四智都须到了佛位才圆满。不过也有从初地就得初起的，那就是妙观察智与平等性智，此二智一入初地，就得现前。可是，在初地之后，于后诸地之中，或时现前或不现前，直到第八地才永远现前。若单论妙观察智，若是生空观品妙观察智，二乘见道之时亦可现起，若是法空观品的妙观察智，则非菩萨见道位，不得现起。因为观察法空，唯有菩萨故，非二乘所能也。这是地上所得初起的二智。若大圆镜智和成所作智，未到佛位，是决定不能现起的。所以四智有地上初起者，有非佛果不能现起者。至于所修之行，修行之次第等，在下二节《唯识观》与《唯识修行之根基及次第》中专述，此不赘说。
此外，《佛地经论》卷七自“所转得”之意来解释“转依”，而认为转依乃法相之身。关于转依之分类，《摄大乘论本》卷下依所得位之别，将转依分为六种，称为“六转依”。
1.损力益能转，即资粮、加行二位之转依。此二位修习胜解而有惭愧心，故减损本识中染种子之力而增益净种子之势力，虽未断灭烦恼障与所知障种子，未证转依，然以渐伏现，故亦称为“转”。
2.通达转，即通达位之转依，以见道无分别智断分别起二障之粗重，证得一分真实之转依。
3.修习转，即修道位之转依。由数度修习十地之无分别智，渐断俱生起二障之粗重，次第证得真证之转依。
4.果圆满转，略称圆满转，乃究竟位之转依。成就三大阿僧祇劫之难行，金刚喻定现前时，于无间道断一切粗重，永除惑障，于解脱道证得菩提、涅槃，为成就佛果圆满之转依。
5.下劣转，即二乘之转依。二乘以自利之念厌苦欣寂，唯能通达生空真如，已断烦恼障之种子而未断所知障之种子，仅得生空之理智。
6.广大转，乃大乘位之转依。为利他之故，趣大菩提，不厌欣生死涅槃，通达“二空”真如之理，断除一切二障之种子，顿证大菩提、大涅槃。
《三无性论》卷下，则依修行阶位而分为五种转依：
1.一分转依，谓二乘人灭尽我见我爱故，得无漏相续而异于凡夫。
2.具分转依，谓初地菩萨证得“人法二空”。
3.有动转依，于七地以前之菩萨，有出入观，故称“有动”。
4.有用转依，十地以前之菩萨，其事未办，不舍功用，故称“有用”。
5.究竟转依，至如来地，得圆满究竟之果。
《大乘阿毗达磨杂集论》卷十，列有三种转依：
1.得无学道，证法性，称为心转依。
2.所作已办，道果究竟圆满，称为道转依。
3.永离一切烦恼随眠，称为粗重转依。
《大乘庄严经论》卷三《菩提品》，则举出如来之转依有十种功德，读者宜自去深入。但转依之余义尚有三点应于注意：
1.转识成智非转识种。由表面看去，“转识成智”似乎是将心王的八识，转变成心所的四智；或者将八识的种子，转为四智的种子，而另发生智的现行。实则不是。众生有八识，佛还是有八识；众生有心所，佛也并非没有；盖识种不变，识性不灭。不过因为强劣相异，运用不同，而假名“转识成智”罢了。识之胜用是“分别”，在凡夫位极强，名识；智之胜用显“抉择”，在圣位则胜，名智。非是灭除因位上之识，而另产生一个智体。然而为何要说“转”呢？第一要转去无始以来藏于识中的染污，智慧才能生起。第二是智随识转。第三转舍转得，识为依故；所以特为转识。
2.“转依”二字之妙用。二障种子和涅槃菩提，同时都是藏在阿赖耶识中的，但二障一除，但现出了涅槃与菩提，这在一断一证之间，到底安个什么名字才相恰当呢？那就是“转依”，故转依之为义，真是妙到不可言喻。一方面显示菩提涅槃，无始本转，不是从断障之后，不是从“无”的方面而生出的。另一方面，显示转舍转得，只是两种子易位。因为烦恼不是固体之物，须智力来断，而智一生起，障即灭尽，两法同时，一生一灭。盖唯识不许一识上同一刹那有相违的二性存在，有此便无彼，有彼便无此。唯识殊胜微妙的思想，转依也是其中之一种。
3.转依果之得全是意识之力。转八识成四智，转烦恼得涅槃，八识之中的主动者，并非八个识，而仅是八个识中的第六意识。第一，“动身发语独为最”，意识乃一切善恶业之制造者故（思为业主，意识相应）。第二，初步的转依，要靠多闻熏习如理作意，这正是第六意识的功用。第三，见道时之妙观察现前时智，能通平等性起初起故。第四，大圆镜智和成所作智要金刚道后，进入佛位时方得生起，亦为第六识遣障熏发之力故。所以四智虽为八识所转成，而能转者，却为第六意识也。
（第三节） 唯识观
瑜伽行学派的理论根据，是依“六经十一论”，其中“十一论”中之《瑜伽师地论》为本，其余十论为支。《瑜伽师地论》详述了瑜伽行之观法。瑜伽为梵语yoga之音译，意译作相应。依调息（调呼吸）等方法，集中心念于一点，修奢摩他（止）与毗钵舍那（观）为主之观行，而与正理冥合一致。相应之义，据《成唯识论述记》卷二本之说有五义：（1）与境相应，谓不违一切法之自性。（2）与行相应，谓与定慧等相应。（3）与理相应，谓安立非安立等二谛之理。（4）与果相应，谓能得无上之菩提果。（5）与机相应，谓既得圆果，利生救物，赴机应感，药病相应。据此而建立唯识学的实践理论，就是唯识观。
观想真理的方法，为佛教一般之实践法门。瑜伽行学派有三界唯心之观，如观五重唯识，称五重唯识观。五重唯识观的依据有两点：一是《般若经》所说的“空无自性”的教义，二是《华严经·十地品》所说为缘起观之“三界唯心观”。从《般若经》所展开的是作为唯识学骨架的“三性、三无性”说；从《华严经》的“三界唯心观”，乃变成了发展有关心的本质与分析的基础。
观，系心思观察说名为观，即细心伺察思惟诸法名义等之精神作用。观以别境中之慧心所而为自性。慧，于所观境，简择为性，断疑为业。所观境，是智观，名之为境。即是三性三无性。以一切法为自体，通观有漏无漏有为无为一切诸法皆唯识故。一切法不离三自性，诸法因缘生，本没有实我实法，众生不了虚妄计执为实，增益遍计执，更不了依他起圆成实，起惑造业，沉沦生死。因此，于此三性中，应舍遍计执，观依他起如幻而生，圆成实为唯识实。万有诸法皆不离识，如是遣遍计执，显现依他起圆成实，成万法唯识，名为唯识三性观。三无性乃针对三性而建立。依遍计所执性立相无性，众生既于世间之相处处计著，执为实有，为除此妄执，说一切法皆无自性。依依他起性立生无性，万法乃从众缘而生，为虚假之存在，故其性实不定，故说一切法非自然生，亦无凡夫所执之体性，如幻化之事。依圆成实性立胜义无性，真如乃根本无分别智之对象，故虽为一切法存在之真本质，却不受任何特点之性质所规定，已离我执法执，犹如虚空一般。由三性三无性之说，而立“非有非空”之中道，而观三性之存在为唯识无境，称为唯识三性观行。即遍计执为虚妄之唯识性，依他起为世俗之唯识性，圆成实为真实胜义之唯识性。说明观此三性的顺序、方法，观此唯识三性理，从粗至细的五重观法，即名“五重唯识观。”
根据唯识的原理，五位百法是其基础。唯识百法是以“无我”为宗，唯识学修观当以“无我唯识观”为先。先师正果法师《止观简介》中，详述了“无我唯识观”及“五重唯识观”，兹介绍如下：
一、无我唯识观
1.百法无我
一切法总为五位，共计一百法。无论心、心所、色、不相应行和无为，都没有众生计执的我法二种实性。“我”有实、常、主宰、自在义，然以心心所色等积集组合而成的有情，决无坚实、不变、主宰自在的体性。法是轨持义，轨是轨范，可生物解，持是任持，一切法只有依他如幻缘生的虚假作用，亦决无坚实不变的自性胜用存在。这里分别略述其义：倘若有情法中有我，所计我以何为体？若言以色为体，则色不应是无常，因为我是常一主宰者故。反之，我是常一主宰者故，色亦应是常一主宰自在。如是则色法不应有迁变坏灭，但是实确与常识学理相反，眼见无有一色法亘古而不变坏者，若承认色法是有迁变坏灭，又许为我的体性，则我性应当随色之迁变坏灭。若如是者，则常一主宰自在的我性便不复存在了。其余眼耳根等，皆以此理推证可以例知，若我是短等为体者，长短等是色尘分位，色尘尚且是无常变坏的，没有我体存在，依色尘分位积聚的长短等，离色尘外既无别体，更不可以为常一主宰自在的我体了。其余滑涩等触尘等分，皆以此理推证可以例知。若谓我是以心心所为体者，八识心王五十一心所，都是无常的没有常一主宰自在的势用，都是互相资助观待而得生起。要是有我之体性存在其中，则总八识心王五十一心所，或总聚，或一王一所，应是常一主宰自在不变的存在。但是我们以常识学理的观察，心心所之总聚一多的作用，均非常一主宰自在，而是无常苦空无我。又纵许以心心所为法我体，而心王有八，心所有五十一，其我是以一心一所为体，还是以多心所为体？实则依一依多依和合，皆是说不通的。因为无论为一为多，为和合，心心所法都是无常苦空无我，决无常一主宰自在的我性，且依多依和合以为我体，则以从心从色，从内从外，从头至足，从皮至髓，六腑五脏，骨肉皮脉等，一切诸物，乃至所有种种心识念念等中，一一推求，众生所计执的常一主宰自在的实我，终不可得，毕竟都无，仅是无常苦空的心心所色声香味等，故云无我。