临别时，中山先生神气极坚决地再次指示：第一，让伍廷芳名义上为议和首要代表，而实权则由汪精卫操持；第二，我们设法利用袁世凯，不是袁利用我们。这两点，望向汪精卫转达。并望你们保守秘密，不要外传。
孙中山送走了张竞生，秘书宋霭龄又走过来，呈上“北京方面清室优待条件最后文本”，内容如下：
一、大清皇帝改称皇帝，相传不废，以待外国君主之礼待之。
二、暂居宫禁，日后退居颐和园。
三、优定皇帝岁俸，年支若干，由新政府提交国会议决，唯不少于300万两。
四、所有陵寝、宗庙，得永远奉祀，并由民国妥为保护。
五、保护其原有私产。
优待满、蒙、回、藏人条件：
一、满、蒙、回、藏人与汉人平等，均享受一切权利，服从一切义务。
二、保护其应有之私产。
三、先筹八旗生计，于未筹定以前，原有口粮暂仍其旧。
四、从前营业之限制、居住之限制，一律蠲除。
五、所有王公世爵概仍其旧。
孙中山阅毕，哈哈大笑道：“此乃条件，殊为可笑。”于是提笔复信伍廷芳，指示如下五条内容：
请告唐，清帝退位，共和既定，既推让出于诚意，至其手续，则须慎重。以为民国前途计，若两日为期，不特贻外人讥笑，且南方各省或有违言，转为不美。今以五条件要约如下：
一、清帝退位，其一切政权同时消灭，不得私授其臣。
二、在北京不得更设临时政府。
三、得北京实行退位电，即由民国政府以清帝退位之故电发各国，要求承认中华民国彼各国之回电。
四、文（指孙文）即向参议院辞职，宣布定期解职。
五、请参议院公举袁世凯为大总统。如此方于事实上完善。
次日，孙中山又电告伍廷芳，将三、四、五条并为一条：“各国承认中华民国之后，临时总统即行辞职，请参议院公举袁为大总统。”
同日，孙中山又对北京方面清室优待条件提出修改：“‘相传不废’当改为‘终生不废’。至交海牙存案，民国内阁反对者多，其理由：一、国内之事件，交列国国际公会，大伤国体；二、不信国民，存案于外，即为丧失国人信用，牵涉于国际；三、唯有用正式公文，通告各国政府，即可为将来之保证。”
19日，清隆裕太后见电，又召集御前会议于养心殿。此时隆裕有意退位。会议开始后，隆裕太后原文宣读南京关于优待皇室条件和优待满、蒙、回、藏人条件的电文，结结巴巴念完电文后，便问：“你们都听了，看是君主好？还是共和好？”闷了好长一段时间，溥伟等对曰：“臣等皆力主君主，无主张共和之理，求太后圣断坚持，勿为所惑。”
太后尖声笑道：“我何尝要共和？都是奕勖和袁世凯说的，革命党人太厉害，我们没有枪炮，没有军饷，万不能打仗。……”
接着她拂了拂袖子，又说：“现在内帑已竭……胜了固然好；要是败了呢，连优待条件都没有，岂不是要亡国吗？”
溥伟仍坚持不退位的好。
太后龙颜不悦：“就是打仗，也只冯国璋一人，焉能有功？”
溥伟道：“为了大清，我愿意自己率兵出战！”
最后太后问他：“他们主和了，你还出什么战？”
溥伟仍坚持：“请太后仍是主持前次谕旨，着他们要国会解决。若设临时政府，或迁就革命党，断不可行，如彼等有意外要求，请太后断不可行。”
隆裕则答道：“我知道了。”
会议不欢而散。
恰在这时，清廷驻俄国公使陆徵祥，致电请外务部，再次促请清室退位。清驻意大利公使吴宗濂、驻日公使汪大燮等亦随后电请内阁，呼吁清廷退位。
20日，孙中山再电伍廷芳，重申五条件：
一、清帝退位，系帝制消灭，非只虚名。
二、袁须受民国推举，不得由清授权。
三、袁可对中外发表政见，服从共和，方为被举之地。
四、临时政府不容有二，以避竞争，今清帝退位后，民国政府当然统一。
五、袁可被选为实任大总统，不必用临时字样。如此，始得民国巩固，南北一致。并要求袁世凯来南京会谈。
袁世凯接电后，再次拖延，致使战火再起，革命阵营内也意见不一。一些原来不赞成议和的同志，也对孙中山不满起来：“议和，议和，这不，又打了起来吗？”一些主张议和的同志也针锋相对：“不能无谓地流血！先生你怎么又改变了初衷？”
袁世凯暗中促进清帝退位的实现，使驻外公使和段祺瑞等军人要求共和制，但表面上，有时又表现出左右为难的姿态，一会儿跪请清廷退位，一会儿又致电伍廷芳，仍要求召开国会公决国体，甚至还佯作备战，其中心目的，是以舆论为工具，窃夺总统大权，又因唯恐失去总统职位，不愿承认南京政府，故有意阻碍和平解决清帝退位的进程，与南京政府讨价还价，完全为个人一己之私而玩弄权术。
南京。陆军部的参谋部作战室。
会议桌边，围坐着陆军总长黄兴、秘书长胡汉民、陆军部次长蒋作宾、海军部次长汤芗铭、实业部次长马君武、交通部次长于右任及宋教仁、汪精卫等。
孙中山坐在绘有六路北伐进军的挂图前，环视与会者：“关于战局，务请各抒己见。”
黄兴首先发言：“战局令人忧虑，军费支出庞大，国库空虚。杯水车薪，无济于事，甚至连预算都无从算起……”
大家沉默。
孙中山道：“也不能只看财政，武昌起义以来，民气激昂，北方人心也大体倾向共和。海外华侨，继续踊跃捐输，美洲、南洋、日本等地，都有汇款……总之，和谈，北伐，不可偏废！”
马君武立即应声：“陆军总长是否应马上率所属17个师北上，不管袁世凯是战是和，我们都要直捣幽燕！”
宋教仁仰首冷笑。
马君武站起；“遯初，你笑什么？”
宋教仁：“我笑我辈不外纸上谈兵。”
马君武不快地坐下。
宋教仁：“兆铭兄刚从北京回来，谈谈那边的形势吧！”
风尘仆仆的汪精卫脱下大衣，走到地图前：“不仅要明白北方，还要统鉴世界大局。英、日、美、德等列强支持袁世凯，路人皆知。甚至横舰长江，阻拦民军在秦皇岛登陆，驱逐占领即墨的义军……公使团日前通电，不准在京奉铁路两侧十里内交战。日、俄增兵东三省和内蒙古，企图乘机分割……”
一种沉重的气氛压迫着会场，大家都不做声。
孙中山用期待的目光注视黄兴：“克强，刚才的话还未讲完。”
黄兴：“湖北实际上已经与袁世凯媾和，北洋七镇正向南京压来。陆军部所辖部队号称17万，但真有战斗力的也只有粤、浙两军……”他的话又被咳嗽打断了。
全场默然。
汪精卫：“项城若能促清帝退位，则我辈目的已达。战事如果再起，恐非国民之福！”
孙中山愤然：“袁世凯阴怀莽、操之志，居心叵测，反复无常，企图在南北对峙中渔利。共和肇始，将元首职务交给这个守旧官僚，似应慎之。”
宋教仁：“可是在临时大总统选举之前，不是已经商定虚位以待吗？”
孙中山：“是的，但前提是他必须服膺共和主义！”
汪精卫浅浅一笑：“先生，您不会对大总统的职位恋栈吧？”
宋教仁语带讥讽：“先生当然不会有权力思想。”
马君武拍案而起：“你们是暗指先生贪恋权势吗？”
宋教仁轻轻拉一拉马君武：“你坐下。”
马君武怒不可遏：“你这个袁某的说客！”说罢，一拳向宋教仁左眼打去。
宋教仁意外而委屈地：“你——”他的眼睛立刻肿起来。
与会者的目光都集中到马君武身上，然后又一齐转向孙中山。
孙中山痛心地、感情复杂地看着马君武：“君武——太粗暴了，应该向遯初道歉！”
马君武执拗地坐着不动。
孙中山叹了口气：“这不是什么恋栈职位和权力思想。既然历史把重任赋予我们，我们就要不辱使命！”
黄兴满怀同情地看着孙中山，断断续续地说：
“上海的和议若不成……兴自度不能下动员令，唯有剖腹以谢天下。”
说罢，低头吐出一摊鲜血。
“今也让，明也让。吃人的老猿称霸王”
1912年2月13日，就是7岁的宣统皇帝溥仪签署退位诏书的第二天，孙中山被迫向参议院提出辞职咨文，并推荐袁世凯继任总统。
局势急剧地变化。
就在宋嘉树帮助宋教仁起草《临时约法》的时候，2月12日，清帝在袁世凯的威逼下，宣布逊位。两千多年的帝制终得推翻。接着孙中山履行诺言，向参议院提交了辞职咨文。
他在致参议院的咨文中说：“清帝逊位，南北统一，袁君之力实多，发表政见，更为绝对赞同，举为公仆，必能尽忠民国。且袁君富于经验，民国统一赖有建设之才，故敢以私见贡荐于贵院。请为民国前途熟计，无失当选之人。”同时宣布，袁世凯必须遵守《临时约法》，又派出以蔡元培为专使，汪精卫等为随员的迎接总统候选人代表团北上迎袁南下，希将袁世凯引出巢穴，到革命党人占优势的南京来，以便监督其遵守《临时约法》。
但在临时参议院门外，陆军所属的沪军和浙军蜂拥而来，包围呐喊着：“我们要见孙大总统！”“我们要见议员！”“谁要让孙大总统辞职，我们就把谁绑走！”口号声一阵高于一阵，远处的炮台也传来隆隆的炮声……
参议员们一个个呆坐在座位上，心情复杂。
当时，既有革命党人表示反对推袁世凯为下届总统候选人，海外华侨也有来电反对推荐袁世凯的。孙中山复电说：
“今日目的已达。……我辈之义务告尽，而权利则享自由人权而已，其他非所问。”
2月15日，参议院举行选举，袁世凯以17票被选为中华民国第二届临时大总统。
2月18日一早，陆军第一军军长柏文蔚（民国元年6月任安徽都督）不赞成一味向袁世凯退让，主张利用革命气势组织力量打击袁世凯，亲到南京政府谒见孙中山哭谏。孙中山“亲为调牛奶、咖啡、茶并给以饼干”相待。
柏文蔚岂能吃下，痛哭流涕地对孙中山说：目前革命气势正在高涨，北伐军事不应停止。且北洋军实力尚在，“应利用当前革命优势，予以严重打击，将所有障碍扫除，方能实现本党政治主张，否则急于求和，恐难有好结果。”
“我非常同意你的主张。”孙中山道，但这时他只能向柏文蔚表明：只要清帝退位，袁世凯绝对赞成共和，他自己可以立即辞职，不再涉身政界，专求在社会上做成一种事业。关于今后的军事问题，则指示柏文蔚与黄兴研究。柏文蔚在总统府吃完早餐，向孙中山告辞。到了陆军部，他向黄兴说：“袁世凯乃是不讲信义之人，戊戌政变，他能卖友向慈禧告密，我们对他不能相信太过。”
黄兴向他解释说：“革命目的是推翻满清，建立民国。只要袁世凯承认这种主张，我们就可以将总统让给他。他虽狡猾，也一定与我们合作，假如完全靠武力解决，将来鹿死谁手，尚难预料。”此时，柏文蔚已看出黄兴，“亦大有放弃武力之意”。他后来很感慨地说：“当时和平空气浓厚，余之不放弃武力主张，已不为各方面所重视，诚所谓曲高和寡者也。”
2月20日，补选黎元洪为临时副总统。
3月30日，孙中山与袁世凯最后敲定了内阁成员名单，唐绍仪为总理，九名总长中，同盟会员占了四席，分别是司法总长王宠惠，教育总长蔡元培，农林总长宋教仁，工商总长陈其美。
4月1日，孙中山于参议院举行解职礼。他说：“清帝逊位，民国成立，民族民权两主义已经达到，只待实现民生主义。”他念念不忘修筑20万里铁路的宏图，表示10年之内不过问政治，一心完成铁路建设计划，使中国在经济上富强起来，与欧美同步。
辞去职务一身轻。
南京郊外。紫金山。
清明时节，细雨霏霏。
静寂的山林，偶尔响起回荡的枪声。
时断时续的哭声传来——人们在扫墓。
蜿蜒的山路，远远可见几个身着猎装、手执猎枪的人在攀登……
黄兴、胡汉民、宋教仁、朱执信等人依次攀上一块平坦地方。走在后面的孙中山也攀了上来，马湘接过他手中的猎枪。人们停下来歇息。
孙中山轻喟一声：“总算轻松些。”
黄兴眺望着山脚下，一群祭扫烈士墓的小学生列队走过。嘹亮的歌声隐约传来：
五色国旗照亚东，
问谁铁血功？
中华大总统，
孙中山与黎元洪。
两千余年专制毒，
一旦扫而空。
……
黄兴有所感地转向孙中山：“我们终究在历史上留下了痕迹。”
似乎也在倾听孩子们歌声的胡汉民站了起来：“几个月来，事变太过迅速和复杂，来不及思考，更遑论索解。”
宋教仁却执著于自己一贯的思路：“我持乐观态度。议会、宪法，必使共和制度长存。”
他们起身，继续攀登。
路过许多小小的墓前，纸幡飘动，粗瓷碗碟里放着简陋的祭品——几个馒头，两块猪肉。
孙中山颇有感触：“民生主义，迫待实施。……当务之急，先得修20万里铁路。”
朱执信好像自言自语：“有的出国，有的做官，有的退隐，还有的出家——路漫漫其修远兮……”
散漫的谈话中断。孙中山凝望着嫩绿色的山峦，缓缓地对宋教仁说：“既然我们在国会获多数，组织内阁是必然的，您也将出任内阁重任……”
大家朝他转过脸来。
孙中山回避开战友们的眼光，从马湘手中取过猎枪，走了两步，朝着从容飞过的一群白鸟随手射击。
回声在山谷中滚动，消逝。
林木萧萧。细雨霏霏。
鸟群像是没有受到任何惊扰，自由舒展地向着更高的苍穹飞去……
4月3日，卸任后的孙中山乘坐的火车抵达上海，陈其美率都督府官员及总务科全体人员到车站迎接。
说心里话，对于孙中山的请辞总统，陈其美是有其不同看法的。但是孙中山又是他最为尊重的人。为欢迎孙中山抵沪，陈其美特地动员上海戏剧界，在沪南新舞台演出新剧《波兰亡国恨》，为孙中山先生一行接风洗尘。