使人特别敏感的是，这次会议上，蒋经国派人散发了以中央干校名义出版的两本小册子，一本名叫《我们对团的建议》；一本名叫《团的改造》，公然主张把“三青团改造成为独立的党”。这实际上是蒋经国揣摩了父亲的意志而编写的，是有来头的。
再说陈氏兄弟看了小册子后，就睡不着觉了。凭着他们多年从政的经验和体会，一场暴风雨就要来临。他们不光嗅到了小蒋的野心，同时还感觉到这种理论的提出，对党将是一场大灾难。因为党团分立的最坏结局，就是以团代党。如果到了那一天，自己，连同CC都将一文不值。
兄弟二人商量了半夜，决定还是早下手为强。
不久，又传来消息：老蒋原则同意小蒋以三青团组党。那消息说得有鼻子有眼的，不信也得信：说是蒋介石在庐山的别墅里召见了三青团的高干，一边对自己读过并且圈红的《改造》一书大加赞许；一边又指示三青团研究“独立组党”的纲领，要起草一个文件，送给他看。二是在大会的闭幕词中，蒋介石反反复复地谈了自己对党的失望，多次强调三青团“独立发扬革命创造精神”的重要性。随后，谴责国民党“腐化”，要求三青团独立组党的呼声一浪高过一浪，从发言的内容看，不像即兴的发挥。
此消息证实了“二陈”的猜测没错，同时也激起了他们为捍卫CC不惜拼死一搏的雄心。于是，兄弟二人分头行动，陈立夫快马先行，带上一批CC骨干，星夜兼程，直奔庐山，向蒋介石表达反对“三青团独立组党”的意见。任凭陈立夫详陈危害，蒋介石始终不肯表态。陈立夫没辙了，双膝一屈，跪伏在地，一字一泣地说道：
“兹事体大，总裁万万不可草率行事！”
蒋介石听了，“我草率什么啦？我行何事体啦？胡搅蛮缠，成何体统！”
说话间，戴季陶闯了进来，此佬脾气更大，措词更加激烈，他从陈果夫那里知道蒋介石不要党了，直着嗓子便嚷：“党是总理缔造的，我不能撒手不管！”他与蒋介石理论，满口的革命辞藻，陈立夫听得暗呼痛快，说到尾梢，一声“阿弥陀佛”，又有回头是岸的感召，听得蒋介石良久无语，最后表示，自己会考虑大多数人的意见。
翌日，大会继续进行。接到陈立夫通知，火速从北平赶到庐山的黄宇人率先发言，他说：“国民党曾有光荣的历史，今日的腐败无能，怪谁呢？我以为总裁应负主要责任。因为中央党政大员，都是总裁任命的，他们直接向总裁负责，不受民意机关和舆论的监督，可见总裁的责任最大。如果青年团要组成一个实行三民主义的党，必须另选出一位领袖，才能在新环境中发挥其领导才能，否则，我们的团长以一身兼任两个党的领袖，当新党攻击国民党腐败无能时，他将何以自处？”
黄宇人是党内有名的“大炮”，以口无遮拦著称，一席话说得在理，全场为之默然。蒋介石连遇两阵阻击，心里开始明白：以团代党的风险太大，弄不好要翻船。于是凭着政治家的机巧，了无声息地将“组新党”的念头打消了。
蒋的突然转变，与会代表并不知道。
9月6日，围绕三青团的性质和地位的主题召开讨论会。会上，组建新党的调门依然高唱入云。有一个叫张其学的三青团干部，想在蒋介石面前讨好，竭力抨击“党的腐化”，“党已失去人心”，大声疾呼“立即组党”，博得了全场的喝彩。
蒋介石问秘书长：“这位代表姓什么？”
张正在得意时，未等秘书长回复，便抢先自报家门，大声地答道：“我是四川支团书记张其学。”
蒋面带愠色地点一下头，向大会发问：“张代表说党腐化了，是不是啊？”
大家齐声说：“是。”
蒋又问：“党腐化了，你们有没有责任？”
台下没人回答，只是交头接耳，窃窃私语。
蒋清了清嗓子，接着说：“党腐化了，你们就有责任振作起来，你们现在反而说，团要离开党，另外组党，这是逃避责任！这不是革命的表现，而是革命的逃兵！”蒋介石把话说得分量很重，代表们像吃了闷棍一样，有点儿发晕。
蒋介石目扫会场一周，目光停在张其学身上说：“张代表的发言是错误的。”
张其学暗呼冤枉，马上站起身来辩解：“报告团长，我没有错。团长在开幕词中就指示我们独立组党……”
蒋不等对方把话说完，就怒斥道：“你胡说！”接着转身吩咐秘书长，取消张代表的发言资格。
张其学像泄了气的皮球跌落在座椅上，整个会场上只剩下蒋介石的声音在回荡。他一会儿指责党不争气，一会儿批评团不成熟，异想天开地要闹独立，这不是陷党于死地吗？他还说，自己的确对团寄予厚望，但绝不是要团来取代党。现在大家误会很深，有必要清理一下……
蒋介石把该讲的意思讲完，拂袖而去，会场上顿时炸开了锅，秘书长不知如何应付，只得宣布休会一天。
三青团独立组党的梦想破灭，不仅使CC显示了力量，而且看到了希望。陈氏兄弟趁热打铁，频频向蒋介石进言，痛陈党团分立的危害，突出强调了一元领导的重要性。蒋介石终于同意党团合并。1947年9月，三青团被宣布取消，该组织的干部与成员重新登记后，全部转入同级党部工作。看上去，“二陈”挫败毁党的预谋，保住了CC的根据地。可实际上，以蒋经国为首的三青团高干纷纷挤进国民党中央执委会，使纯CC色彩的陈家党内，有了太子爷的地盘。陈氏兄弟算算“总账”，明里赚了面子，暗里吃亏不少，于是对党团合并的局面，一直有行政机关清算的图谋。参见李海生、张敏著：《陈果夫与陈立夫》，上海人民出版社2001年版，第305—307页。
总而言之，蒋介石可以改变三青团独立组党的初衷，并不会放弃扶植蒋经国的愿望。实际蒋陈间的斗争并没有结束。
陈果夫顶撞蒋介石
且说“蒋家王朝陈家党”，这句话生动地反映了陈果夫兄弟，积极卖命蒋家王朝，在政治上摇旗呐喊，在组织上招降纳叛，为维护王朝的统治，带病工作20年，可谓呕心沥血，殚精竭虑。
应该说在国民党五全大会以前，蒋介石并未亏待陈氏兄弟，给予了百分之一百的信任。包括职务、权力，能给予的便给予，能下放的便下放。这叫放手放脚。然而在国民党五全大以后，随着蒋经国的成长，他似乎觉察到了陈氏兄弟再不限制，就要威胁到儿子的升官道路。再加上CC派出现了一系列的问题，于是借口也来了，陈氏兄弟只降不提，这是蒋介石内定的大原则。可是陈氏兄弟并不知情。时间一长，“二陈”开始有所感觉，但不知什么原因。有人开玩笑说：“你们占了位置，小蒋往哪放？”对此，陈果夫摇摇头：“这哪是往哪放啊。”
1933年5月的一天，蒋介石突然传令召见陈果夫。作为监察院副院长的陈果夫正在找党内同志谈话，听到总裁要召见的消息，他立即终止了谈话，心想着一定有好事降临，直到蒋公馆。
“总裁，是你找我？”陈果夫气喘吁吁。
“想让你挑担子。”蒋介石很随便。
“什么担子？”
“江苏省主席。怎么样？”
陈果夫没置可否。
蒋介石开始了攻心：“这可是京官，很多人想去的地方，我没能安排。和你现在的副院长职务相比，虽然职务有些降，可是是实职啊。你和立夫都是在机关长大，没有地方工作经验，到头来总要吃亏。到地方干得好，升迁也快。”
蒋介石说到这里，陈果夫有些动心。实际他考虑更多的是职务的升迁。如果是先降后升，吃小亏占大便宜，那样他也认了，于是他立即向蒋回话说：“感谢总裁的信任，我应该下去锻炼锻炼，争取干一番事业，过总裁的考验关。”
“这就对了。”蒋介石哈哈地笑起来：“是的，就要干一番事业来，我祝贺你。”
“什么时候报到？”
“不要急嘛。什么时候下令什么时候报到。”
“好的。”
应该说派陈果夫到江苏省任政府主席，是蒋介石想法赶走“二陈”的第一步棋。从1935年起，蒋介石便对“二陈”起了疑心，想方设法在党内给陈氏兄弟物色对手，并不断调整“二陈”的职务。同时也加紧了对蒋经国的栽培，目的是他要搞蒋家天下蒋家党。
陈果夫在江苏省主席的位置上带病工作了五年，仍不见蒋把他调回南京。开始时，他还踌躇满志，时间一长，他不着急，别人倒替他着了急。最着急的还是陈立夫，陈立夫在蒋介石面前几次有意把话题扯到兄长身上，而蒋介石就是金口玉言，避而不谈。这使陈立夫大伤脑筋。
一天，兄弟二人见了面，讲起这事，陈果夫问：“老蒋没表态？”
“不是不表态，人家是有意回避咱们。”
“不行，我就打辞职报告。我这病也难坚持。”陈果夫说完把一大把中药丸子直往口中倒，然后用水冲下。陈立夫看着骨瘦如柴的兄长，眼泪一下子夺眶而出：“大哥，我看就写报告吧。还是保命要紧。”
“好吧。”陈果夫不情愿地说。
再说蒋介石看到了陈果夫的辞职报告，挥笔批道：念果夫苏政五年，带病工作，政绩突出，考虑其身体状况，准予辞职。
无官一身轻。陈果夫卸任的第二天，还没有容对方来得及开欢送会，他就乘上西去的汽车前往安徽省的安庆，然后再到九江，与他先前离开南京的夫人朱明、父亲陈其业、弟弟陈立夫等人会合。他们游了九江，九江的雾大，看不清庐山的真面目。接着他们又乘船西上到了武汉。日军轰炸向纵深推进，武汉告急，他又迁移长沙，最后到达陪都重庆，与国民政府会合。
应该说这一段时间，陈果夫主要是养病治病，由于休息较好，身体渐渐地恢复。对于离职，他曾做过将来任职的预想，他也企盼着预想的到来。话说这天，陈果夫正在林园二号与一帮朋友下棋，他的秘书走过来，把一纸命令递给他。他看了半天，怎么也没有想到，蒋介石会委任他为中央政治学校代理教育长。又是一个没想到，他到一所学校管教育，教育长还是一个代理的。
军人天职是服从。陈果夫硬着头皮到了职。他寡寡不欢，但又是木已成舟。经过五年的地方的锻炼，克勤尽职，本想回中央担任要职，哪里想到，离了中央，去了无职无权无势的学校。这时，他才回过点儿味来，仿佛是吃了一只绿头蝇一样，感觉上了蒋介石的当。蒋介石说话不算数，不该当初轻信蒋的话。越想越生气，陈果夫在教育长的位置上又住了一次院。出院后，他仍敬职敬业地工作，决心把学校工作上一个新台阶，以挽回总裁对自己的不公。
可是陈果夫错了，也太天真了。蒋介石真正把他赶出了中央，就不会也不能再回到中央。按照蒋的观点是离中央越远越好。
此时此刻的蒋介石正酝酿着一场更坏的阴谋，把陈果夫赶到更远的边省去。
时间到了1938年的秋天，蒋介石再次传令陈果夫，商谈任职事宜。
陈果夫怀疑自己的耳朵听错了：“到甘肃省任主席？”
“不错，是甘肃。”蒋介石说：“甘肃是个大省，又是个穷省，更需要有才能的能打开局面的人。中央研究来研究去，认为你较为合适。”
“我……”陈果夫大吃一惊：不要说上中央了，甘肃还比不上江苏呢！他实在想不明白老蒋卖的什么药。对于身前这位蒋总裁，顿时他感到既熟悉又陌生起来。
蒋介石开导说：“越是艰苦越是锻炼人的地方。中央在考验你。”说到这里，蒋介石揭老底地说：“想当初，到江苏任职时，你不像今天啊，那时你爽快得很。”
“此一时彼一时，容我考虑考虑。”陈果夫做了推辞。
陈果夫一连想了好几天，终于找了一个冠冕堂皇的理由回敬蒋介石。他说：“现在抗战方兴，最好此时不更换甘肃省主席，军政仍应该统一，更要考虑新疆盛世才的猜疑。”
蒋介石知道陈果夫是不想去，但他说得又有道理，只好放弃此议。
但蒋介石赶陈果夫离开中央的念头一直没有打消，此后，蒋介石又几次劝陈果夫下去当省主席，陈果夫均以身体不好为由加以拒绝。
时间到了1943年的初春。油菜花开，蝴蝶采蜜。
蒋介石再次召见陈果夫，先问身体如何，再谈工作。
陈果夫回答：“身体还可以，我的病得到控制。要彻底好，看来希望不大。因为这病不是一时半会儿得的。”
“身体是第一，工作是第二。”蒋介石说到这话锋一转：“最近浙江主席黄季宽打了辞职报告，不知你听到没有？”
陈果夫心里纳闷儿：此事与我无关，老蒋问我干什么？便说：“我是有病在床，消息不大灵通。”
蒋介石继续说：“浙江是我们的家乡。浙江好比一国，浙江的建设如何，不光是家乡的问题，也是一国的问题。我想让你挑这个担子，不知你意下如何？”
谈来谈去，还是到省里工作，陈果夫打心里很烦，立马就不高兴了，接着说：“现在可当主席之人不少，我身体尚未痊愈，此时去此职，身体怕是受不了啊。”
蒋介石不高兴了：“果夫，你受命组织部长时，可是欣然接受的啊。”
陈果夫解释道：“在中央工作，担子轻些，可以照顾我的身体。下面可就不一样了。”
蒋介石一听火更大了：“你做地方事做得好，在中央做不好。”
陈见蒋翻了脸，也忍不住了，多年的积怨一并火起，他提高了声音道：“中央的事我做不好，请问委座，现下中央谁做得好？”
蒋介石被问得哑口无言。
应该说这是十多年来陈果夫第一次顶撞蒋介石。蒋介石面子上过不去，拂袖道：“这不去那不去，你陈家的事我管不了！”
此事不了了之。